phs001500:NCI原代人黑素细胞QTL研究

phs001500: NCI Primary Human Melanocyte QTL Study 是收录于 NCBI dbGaP 的一项 eQTL 研究数据集,研究对象指向人类原代黑色素细胞,在本站被归入肿瘤 / 黑色素瘤分类,主题标签为 eQTL

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基因组分类eQTL
phs001500: NCI Primary Human Melanocyte QTL Study

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-01

资源简介

phs001500:NCI原代人黑素细胞QTL研究

phs001500: NCI Primary Human Melanocyte QTL Study 是收录于 NCBI dbGaP 的一项 eQTL 研究数据集,研究对象指向人类原代黑色素细胞,在本站被归入肿瘤 / 黑色素瘤分类,主题标签为 eQTL。

【数据集背景】

该数据集的英文名称为 phs001500: NCI Primary Human Melanocyte QTL Study。名称中的 phs001500 是其在 dbGaP 中使用的编号形式,NCI 通常指美国国家癌症研究所,在此作为研究名称的组成部分出现;Primary Human Melanocyte 指向人类原代黑色素细胞这一研究对象;QTL Study 表明它属于数量性状位点研究。来源站对其的原始描述为 dbGaP study (eQTL),即 dbGaP 数据库中的一项 eQTL 研究。dbGaP 是 NCBI 维护的基因型与表型相关数据库,用于存放和发布此类研究数据。至于该研究的具体立项背景、研究团队、资助来源、研究目标与科学假设,源站未提供。

【数据内容】

从来源站的描述与主题标签来看,该数据集的核心内容围绕 eQTL 展开,即表达数量性状位点相关的研究数据。其研究对象为人类原代黑色素细胞,本站分类将其归入肿瘤 / 黑色素瘤方向。至于数据集具体包含哪些类型的记录,例如基因型数据、基因表达数据、样本注释、表型字段或分析结果文件,以及样本数量、细胞来源、检测平台、数据文件格式与体积等,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。作为 dbGaP 收录的研究,其数据通常由研究方提交、经数据库整理后对外发布并提供访问入口。就本数据集而言,具体的样本采集方式、样本获取途径、采集时间跨度、涉及的地域与人群范围、伦理审查与知情同意安排等,源站未提供。

【适用场景】

eQTL 研究的一般用途在于将遗传变异与基因表达水平建立关联,从而探讨基因表达调控的遗传基础。结合本站将其归入肿瘤 / 黑色素瘤分类、主题标签为 eQTL 这一信息,该数据集可用于与黑色素细胞、黑色素瘤相关的表达调控方向的分析场景。至于具体的适用条件、推荐分析流程、可支持的统计模型以及不适用的情况,源站未提供。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用步骤,包括访问方式、下载途径、账户或权限要求、配套的分析工具与文档说明等均未给出。由于来源站为 ncbi.nlm.nih.gov 上的 dbGaP 数据库,实际获取与使用需以该来源站的相关规定和流程为准;本数据集自身在访问与使用上的具体要求,源站未提供。

【质量与限制】

源站未提供关于该数据集质量情况的信息,例如数据完整性、一致性、质控标准、批次效应处理、版本更新记录等均未给出。其使用上的限制条件,包括样本适用范围、统计效力边界、结果外推范围等,源站亦未提供。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式、文献出处、许可条款、使用协议以及数据再分发相关规定。如需引用或使用,应以来源站 ncbi.nlm.nih.gov 上该研究条目所载信息为准,但该条目中的具体引用与许可内容,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs001500

标准获取流程:

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

dbGaP study (eQTL).

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