scRNA-seq SHH驱动型髓母细胞瘤小鼠模型
该数据集是一个单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集，包含15只SHH驱动型髓母细胞瘤小鼠模型的基因表达数据，涵盖野生型小脑、药物治疗后肿瘤和对照处理肿瘤三种组织类型，数据模态为基因表达谱，主要用于研究髓母细胞瘤的细胞异质性、肿瘤微环境及药物反应机制，为神经肿瘤的分子机制探索和精准治疗策略开发提供支持。
基本信息
资源简介
scRNA-seq SHH驱动型髓母细胞瘤小鼠模型
【数据集背景】
本数据集源站标题为《scRNA-seq mouse model SHH-driven medulloblastoma》。源站首次发布：2023-04-17。
【数据内容】
源站原始描述：### Data and Context Data - results of single cell RNA sequencing, i.e. rows - correspond to cells, columns to genes (or vice versa). value of the matrix shows how strong is "expression" of the corresponding gene in the corresponding cell. See tutorials: ("Scanpy" - main Python package to work with scRNA-seq data). Or "Seurat" - "R" package For the cell cycle analysis see Computational challenges of cell cycle analysis using single cell transcriptomics Alexander Chervov, Andrei Zinovyev And the…
【数据结构与技术规格】
文件数 15 个，合计 2.16 GB。
【主题与分类】
主题标签：cancer、biology、biotechnology、genetics。
【获取与许可】
源站页面：https://www.kaggle.com/datasets/alexandervc/scrna-seq-mouse-model-shh-driven-medulloblastoma
使用许可：Unknown。
下载信息
注册下载
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需登录公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
方式一：KaggleHub（Python，推荐 AI Agent 使用）
# 前置依赖: pip install kagglehub
import kagglehub
path = kagglehub.dataset_download("alexandervc/scrna-seq-mouse-model-shh-driven-medulloblastoma")
print("数据已下载至:", path)
方式二：Kaggle CLI（命令行）
# 前置条件: 注册 Kaggle 账号, Settings > API > Create New Token
# 将 kaggle.json 放到 ~/.kaggle/ 并 chmod 600
pip install kaggle
kaggle datasets download -d alexandervc/scrna-seq-mouse-model-shh-driven-medulloblastoma
unzip scrna-seq-mouse-model-shh-driven-medulloblastoma.zip -d scrna-seq-mouse-model-shh-driven-medulloblastoma/
数据说明
该数据集是一个单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集，来源于SHH（Sonic Hedgehog）驱动型髓母细胞瘤的小鼠模型。数据包含15只小鼠的样本，具体分为5个野生型小脑组织、5个药物治疗后的脑肿瘤组织以及5个对照处理（vehicle-treated）的脑肿瘤组织。数据通过高通量测序技术获取，主要用于研究髓母细胞瘤的肿瘤微环境、细胞异质性、药物反应机制以及SHH信号通路在肿瘤发生发展中的作用，为神经肿瘤学和精准医疗提供分子层面的研究基础。
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