NF1神经鞘瘤单细胞图谱

该数据集包含 NF1 相关周围神经鞘瘤的单细胞 RNA 测序数据,覆盖 MPNST 及相关肿瘤谱系。由Childhood Cancer Data Initiative提供,来自Childhood Cancer Data Catalog,数据格式为表格,包含63条数据记录,适用于分类任务,专注于肿瘤领域的恶性周围神经鞘膜瘤(MPNST)研究。

Childhood Cancer Data InitiativeChildhood Cancer Data Initiative
Childhood Cancer Data Catalog
浏览 28
表格分类NeurofibromatosisNF1MPNSTPeripheral Nerve Sheath TumorsSingle-Cell RNA SequencingChildhood Cancer
Single-Cell Atlas of NF1 Nerve Sheath Tumors

基本信息

模态
表格
数据量
63
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-09-27

资源简介

NF1神经鞘瘤单细胞图谱

【一句话概览】

儿童癌症数据计划(CCDI)发布了NF1神经鞘瘤单细胞图谱。NF1最严重的后果是良性丛状神经纤维瘤(PN)转化为侵袭性强、高度转移的恶性外周神经鞘瘤(MPNST),且缺乏有效治疗。该研究对63例临床注释的NF1相关外周神经鞘瘤进行单细胞RNA测序,包括24例PN、34例癌前非典型神经纤维瘤和5例MPNST,涉及29名受试者。结果提高了识别高风险神经纤维瘤的能力,为MPNST早期检测提供了独特机会(来源 datacatalog.ccdi.cancer.gov)。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Childhood Cancer Data Initiative (CCDI): Single-Cell Atlas of NF1 Nerve Sheath Tumors》。

【数据内容】

源站原始描述:The worst outcome of NF1 is the development of the aggressive and highly metastatic malignant peripheral nerve sheath tumors (MPNST), which transform from benign plexiform neurofibroma (PN) and lack effective treatment. In this study, we performed single-cell RNA sequencing of 63 clinically annotated NF1-associated peripheral nerve sheath tumors, including 24 PN, 34 premalignant atypical neurofibromas, and 5 MPNSTs. These results improve the ability of identifying high-risk neurofibromas and pro…

中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):NF1最恶劣的结果是发展出侵袭性强且高度转移的恶性外周神经鞘瘤(MPNST),这些肿瘤由良性的丛状神经纤维瘤(PN)转化而来,且缺乏有效的治疗方法。在本研究中,我们对63例临床注释的NF1相关外周神经鞘瘤进行了单细胞RNA测序,其中包括24例PN、34例癌前非典型神经纤维瘤和5例MPNST。这些结果提高了识别高风险神经纤维瘤的能力,并为MPNST的早期检测提供了独特的机会。

【主题与分类】

主题标签:Neurofibromatosis、NF1、MPNST、Peripheral Nerve Sheath Tumors、Single-Cell RNA Sequencing、Childhood Cancer。

【适用方向】

结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。

【获取与许可】

源站页面:https://datacatalog.ccdi.cancer.gov/dataset/CCDI-phs003519

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源站:https://datacatalog.ccdi.cancer.gov/dataset/CCDI-phs003519

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含 NF1 相关周围神经鞘瘤的单细胞 RNA 测序数据,覆盖 MPNST 及相关肿瘤谱系。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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