MPNST细胞系基因组表征数据集
该 Synapse 数据集包含常用 MPNST 细胞系的 SNP-array、全外显子和全基因组测序数据，用于细胞模型评估。由IGTP提供，来自Synapse / NF Data Portal，包含多种数据模态，包含9条数据记录，适用于分类任务，专注于肿瘤领域的恶性周围神经鞘膜瘤（MPNST）研究。
基本信息
资源简介
MPNST细胞系基因组表征数据集
【数据内容】
源站原始描述：Characterization of 8 MPNST cell lines at genomic level linked to the Magallón-Lorenz et. al. 2022 (preprint: It includes raw SNP-array, Whole-Exome Sequencing and Whole-Genome Sequencing data for all cell lines
中文译文（机器翻译，仅供快速理解，请以原文为准）：与Magallón-Lorenz等人2022年研究相关的8个MPNST细胞系在基因组水平上的特征描述（预印本：https://doi.org/10.1101/2022.05.07.491026）。该数据集包含了所有细胞系的原始SNP阵列、全外显子组测序和全基因组测序数据。
【适用方向】
多模态数据适合跨模态对齐、融合建模与联合表征学习方向的研究。
【获取与许可】
源站页面：https://nf.synapse.org/Explore/Studies/syn22392179
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
需登录公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://nf.synapse.org/Explore/Studies/syn22392179
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该 Synapse 数据集包含常用 MPNST 细胞系的 SNP-array、全外显子和全基因组测序数据，用于细胞模型评估。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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