男性乳腺癌样本的流式细胞术数据
该数据集包含男性乳腺癌(MBC)和女性乳腺癌(FBC)样本的单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞T细胞受体测序(scTCR-seq)数据,涉及超过11万个细胞的转录组信息,数据模态包括基因表达谱和T细胞受体序列。其主要用途是研究MBC与FBC在肿瘤微环境、T细胞浸润、免疫特征及代谢通路方面的差异,旨在揭示MBC的免疫逃逸机制和潜在治疗靶点,为开发针对男性乳腺癌的精准免疫疗法提供数据支持。

基本信息
资源简介
该数据集聚焦于男性乳腺癌(Male Breast Cancer, MBC),这是一种罕见但侵袭性强、预后较差的恶性肿瘤。数据集通过对6例ER+ MBC和13例ER+女性乳腺癌(Female Breast Cancer, FBC)样本中的111,038个细胞进行转录组学比较分析,并应用单细胞T细胞受体测序(scTCR-seq)探索MBC与FBC之间T细胞克隆的差异。研究结果表明,MBC的T细胞浸润程度显著低于FBC,且T细胞亚群具有不同的特征:MBC中的T细胞显示出p38 MAPK和脂质氧化通路激活的功能失调状态,而FBC中的T细胞则表现出更高的细胞毒性标志物(如GZMK和KLRB1)表达水平以及免疫调节细胞因子介导的通路激活。此外,研究还识别了MBC微环境中癌细胞与T细胞之间的抑制性相互作用(如TGF-β、TIGIT和VSIR介导的细胞间通讯)。该数据集为理解MBC的肿瘤免疫学和代谢特征提供了重要信息,有助于推动针对MBC的有效治疗策略开发。
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pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
该数据集聚焦于男性乳腺癌(Male Breast Cancer, MBC),这是一种罕见但侵袭性强、预后较差的恶性肿瘤。数据集通过对6例ER+ MBC和13例ER+女性乳腺癌(Female Breast Cancer, FBC)样本中的111,038个细胞进行转录组学比较分析,并应用单细胞T细胞受体测序(scTCR-seq)探索MBC与FBC之间T细胞克隆的差异。研究结果表明,MBC的T细胞浸润程度显著低于FBC,且T细胞亚群具有不同的特征:MBC中的T细胞显示出p38 MAPK和脂质氧化通路激活的功能失调状态,而FBC中的T细胞则表现出更高的细胞毒性标志物(如GZMK和KLRB1)表达水平以及免疫调节细胞因子介导的通路激活。此外,研究还识别了MBC微环境中癌细胞与T细胞之间的抑制性相互作用(如TGF-β、TIGIT和VSIR介导的细胞间通讯)。该数据集为理解MBC的肿瘤免疫学和代谢特征提供了重要信息,有助于推动针对MBC的有效治疗策略开发。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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