PRJNA392675:PRIMA 滤泡性淋巴瘤试验靶向外显子组测序数据

该数据集来自 PRIMA 滤泡性淋巴瘤试验,包含个体肿瘤样本的原始测序文件。PRIMA 是一项大型 III 期临床试验,旨在评估利妥昔单抗维持治疗在一线滤泡性淋巴瘤样本中的疗效

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基因组分类Raw sequence reads
PRJNA392675: Targeted exome sequencing data for the PRIMA Follicular Lymphoma Trial

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJNA392675:PRIMA 滤泡性淋巴瘤试验靶向外显子组测序数据

PRJNA392675 数据集收录的是 PRIMA 滤泡性淋巴瘤试验中个体肿瘤样本的靶向外显子组测序原始数据。PRIMA 是一项大型 III 期临床试验,旨在评估利妥昔单抗维持治疗在一线滤泡性淋巴瘤样本中的疗效。该数据集中的肿瘤活检样本通过 Foundation Medicine 的“Foundation One Heme”平台进行测序,该平台是一种靶向外显子组测序检测方法,用于从肿瘤样本中识别体细胞变异。数据集以原始测序读段(Raw sequence reads)的形式提供,属于肿瘤/淋巴瘤分类,来源于 ncbi.nlm.nih.gov。整体而言,该数据集为研究滤泡性淋巴瘤的体细胞变异提供了来自大型临床试验的原始测序资源。

【数据集背景】

该数据集依托于 PRIMA 试验。PRIMA 是一项大型 III 期临床试验,其设计目的是测试利妥昔单抗维持治疗在一线滤泡性淋巴瘤样本中的疗效。数据集所涉及的测序工作正是围绕该试验中的原发肿瘤活检样本展开,因而其背景与滤泡性淋巴瘤一线治疗相关的临床研究直接关联。

【数据内容】

数据集包含来自个体肿瘤样本的原始测序文件。这些文件属于原始测序读段类型。测序所针对的是肿瘤样本的靶向外显子组区域,所用检测平台为 Foundation Medicine 的“Foundation One Heme”,该平台用于从肿瘤样本中识别体细胞变异。数据集中不包含经过变异识别后的结果文件,仅提供原始测序读段。

【采集与来源】

样本来源为 PRIMA 试验中的原发肿瘤活检样本。测序在 Foundation Medicine 的“Foundation One Heme”平台上完成,该平台是一种靶向外显子组测序检测方法。数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于样本采集的具体时间、地点、伦理审批及知情同意等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于需要从原始测序读段出发分析滤泡性淋巴瘤肿瘤样本体细胞变异的研究场景,例如对靶向外显子组区域进行变异识别、复现或方法学比较。由于数据来自一项评估利妥昔单抗维持治疗疗效的大型 III 期临床试验的一线滤泡性淋巴瘤样本,也可用于与该项临床试验背景相关的探索性分析。关于具体的分析类型或已验证的下游应用,源站未提供。

【使用方法】

数据集以原始测序文件形式提供,使用者需自行完成从原始读段到变异识别的处理流程。关于具体的文件格式、读长、测序深度、分析流程参数及推荐工具,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为原始测序读段,未提供经过处理的变异结果,使用者需自行承担数据处理与变异识别的质量控制。关于测序质量指标、覆盖度、样本量及批次信息,源站未提供。数据仅覆盖靶向外显子组区域,并非全基因组或全转录组数据。关于该数据集在临床或科研结论上的适用边界,源站未提供。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式与使用许可条款,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA392675

标准获取流程:

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

PRIMA试验是一项大型III期临床试验,旨在测试利妥昔单抗维持治疗在一线滤泡性淋巴瘤样本中的疗效。原发肿瘤活检样本使用Foundation Medicine的“Foundation One Heme”平台进行测序,该平台是一种靶向外显子组测序检测方法,用于从肿瘤样本中识别体细胞变异。该数据集包含来自各个肿瘤样本的原始测序文件。

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