基本信息

模态

基因组

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

犬弥漫性大B细胞淋巴瘤全基因组测序综合分析

PRJNA1128010 是 NCBI BioProject 数据库中收录的一项生物项目，其英文全称为“Comprehensive analysis of canine diffuse large B-cell lymphoma through whole genome sequencing”，即通过全基因组测序对犬弥漫性大B细胞淋巴瘤进行综合分析。该数据集在分类上归属于肿瘤 / 淋巴瘤方向，主题标签为原始测序读段（Raw sequence reads），来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。整体来看，该项目围绕犬弥漫性大B细胞淋巴瘤这一特定肿瘤类型，借助全基因组测序手段产生原始序列数据，为相关研究提供可直接获取的测序读段资源。BioProject 作为生物数据的集合记录，将同一项研究所产生的多种数据类型汇聚于一处，便于用户集中查找和定位该项目所关联的数据内容。

【数据集背景】

该数据集对应的是一项以犬弥漫性大B细胞淋巴瘤为研究对象的综合性分析项目，项目名称明确指向全基因组测序这一技术路径。犬弥漫性大B细胞淋巴瘤属于肿瘤 / 淋巴瘤范畴，因此该项目在 NCBI BioProject 中被归入相应的分类体系。BioProject 的设计初衷是汇集与单一研究计划相关的生物数据，这些数据可来自单一机构或联合体；每条 BioProject 记录为用户提供一个统一入口，用以发现该项目所产生的不同类型数据。PRJNA1128010 正是在这一框架下，承载了围绕犬弥漫性大B细胞淋巴瘤全基因组测序所生成的数据集合。

【数据内容】

该数据集的主题标签为原始测序读段（Raw sequence reads），表明其数据内容以测序仪直接产出的原始读段为主。结合项目名称可知，这些原始读段来自全基因组测序，研究对象为犬弥漫性大B细胞淋巴瘤。原始测序读段通常保留测序过程中生成的碱基序列及质量信息，是后续比对、变异检测和基因组分析的基础材料。除原始读段这一数据类型外，源站未提供关于该数据集具体样本数量、测序深度、读长、覆盖度或数据文件体积等进一步细节。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI BioProject，源站为 ncbi.nlm.nih.gov，项目标识为 ID 1128010。BioProject 记录本身并不直接产生数据，而是作为一项研究计划的汇总入口，指向由单一组织或联合体生成的多种数据类型。就本项目而言，其数据产生自针对犬弥漫性大B细胞淋巴瘤的全基因组测序工作。关于样本采集地点、采集时间、犬只品种、临床背景、测序平台或建库方法等信息，源站未提供。

【适用场景】

基于其肿瘤 / 淋巴瘤分类以及全基因组测序原始读段的属性，该数据集可服务于犬弥漫性大B细胞淋巴瘤的基因组学研究场景。研究人员可利用原始测序读段开展序列比对、基因组变异识别、结构变异分析以及与其他犬淋巴瘤样本的比较分析等。由于 BioProject 提供统一的数据发现入口，用户也可借助该记录定位同一项目下可能关联的其他数据类型。需要说明的是，以上适用方向系依据数据分类与数据类型所作的通用性说明，源站未提供该数据集的具体应用案例或研究结论。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 中标识为 1128010 的记录访问该项目，并经由记录中的链接查找该项目生成的数据。由于主题标签为原始测序读段，获取到的数据通常需要经过质量控制、接头去除、比对至参考基因组以及后续变异分析等常规处理步骤后方可用于下游研究。具体的数据下载方式、文件格式、分析流程或配套工具，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集以原始测序读段形式提供，原始读段一般保留测序原始信息，便于使用者自行执行质量控制与处理。但源站未提供关于数据质量评分、测序错误率、污染评估、样本重复性或数据完整性的具体说明。此外，该数据集聚焦于犬弥漫性大B细胞淋巴瘤，其适用范围受物种与疾病类型限制；关于样本量、群体代表性及批次效应等信息，源站未提供。使用者在解释结果时需结合自身分析流程加以判断。

【引用与许可】

该数据集来源于 NCBI BioProject，源站为 ncbi.nlm.nih.gov，项目标识为 ID 1128010。关于该数据集的引用方式、许可条款、使用限制或数据共享政策，源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJNA1128010

访问原始数据

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付，我们提供全链路闭环服务，让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持？联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1128010

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

全基因组测序（WGS）数据来自10例犬弥漫性大B细胞淋巴瘤（cDLBCL）及作为配对正常组织的相应皮肤打孔活检样本。该数据集包含10例cDLBCL和10份皮肤打孔活检的WGS数据，这些犬接受了化疗-免疫治疗，包括CHOP为基础的标准方案和APAVAC疫苗的给药。DNA使用AllPrep DNA/RNA Mini Kit（Qiagen，Hilden，Germany）提取。文库使用Illumina兼容的KAPA HyperPlus Library Preparation Kit（Roche Sequencing and Life Science，Wilmington，MA）制备，并在Illumina NovaSeq 6000（Illumina Inc.，San Diego，CA，USA）上以双端（150PE）模式测序。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别