血浆细胞外囊泡蛋白质组识别弥漫性大B细胞淋巴瘤患者
主题标签:肿瘤、淋巴瘤、血浆、细胞外囊泡、蛋白质组、弥漫性大B细胞淋巴瘤。本数据集为肿瘤领域公开数据集,主题涵盖肿瘤。本数据集为肿瘤领域的蛋白质公开数据集,来源:google_dataset,主题涵盖肿瘤。

基本信息
资源简介
血浆细胞外囊泡蛋白质组识别弥漫性大B细胞淋巴瘤患者
Plasma extracellular vesicle proteome identifies diffuse large B cell lymphoma patients 是一个公开的肿瘤领域数据集,主题涵盖肿瘤与淋巴瘤,具体聚焦于血浆细胞外囊泡蛋白质组与弥漫性大B细胞淋巴瘤的关联研究。该数据集由 Rune Matthiesen 于 2023 年发布,收录于 ebi.ac.uk 的 PRIDE 归档平台,项目编号为 PXD036735。从主题标签来看,数据集围绕肿瘤、淋巴瘤、血浆、细胞外囊泡、蛋白质组以及弥漫性大B细胞淋巴瘤等关键词组织,属于蛋白质组学与肿瘤临床研究交叉方向的数据资源。整体而言,该数据集面向弥漫性大B细胞淋巴瘤这一特定肿瘤类型,以血浆来源的细胞外囊泡蛋白质组为核心研究对象,为相关领域的公开数据获取与后续分析提供了入口。
【数据集背景】
弥漫性大B细胞淋巴瘤是淋巴瘤中的常见类型,其临床诊断与分型通常依赖组织病理学等手段。该数据集以“血浆细胞外囊泡蛋白质组能够识别弥漫性大B细胞淋巴瘤患者”为主题,说明其研究背景在于探索血浆细胞外囊泡中的蛋白质组信息是否具有区分患者的能力。数据集归属于肿瘤/淋巴瘤分类,来源为 ebi.ac.uk,发布年份为 2023 年,发布者为 Rune Matthiesen。源站描述以数据集条目的形式给出了名称与访问地址,未提供更多关于研究设计、样本规模或实验假设的背景说明。
【数据内容】
该数据集的主题标签包括肿瘤、淋巴瘤、血浆、细胞外囊泡、蛋白质组和弥漫性大B细胞淋巴瘤,表明其数据内容围绕血浆细胞外囊泡的蛋白质组展开,并服务于弥漫性大B细胞淋巴瘤患者识别这一目标。数据集属于肿瘤领域公开数据集,主题涵盖肿瘤。关于具体的蛋白质鉴定数量、样本数量、分组信息、定量结果表格或原始质谱文件构成等细节,源站未提供。
【采集与来源】
数据集来源站为 ebi.ac.uk,源站描述中给出的访问地址为 https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD036735,项目编号为 PXD036735,发布者为 Rune Matthiesen,发布年份为 2023 年。数据集的生物样本类型在主题标签中体现为血浆与细胞外囊泡,研究材料为血浆来源的细胞外囊泡蛋白质组。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、样本纳入与排除标准以及实验流程等具体内容,源站未提供。
【适用场景】
基于其主题构成,该数据集适用于肿瘤与淋巴瘤方向的蛋白质组学研究场景,尤其是围绕血浆细胞外囊泡蛋白质组开展的患者识别、生物标志物探索以及方法学比较等分析工作。数据集作为公开资源,也可用于教学演示、分析流程复现与跨数据集比较等用途。关于该数据集在临床诊断、预后判断或疗效监测中的具体应用价值,源站未提供。
【使用方法】
该数据集通过 ebi.ac.uk 的 PRIDE 归档平台以项目编号 PXD036735 提供访问,使用者可依据源站描述中的地址获取数据集条目。关于数据文件的具体格式、下载方式、文件组织结构和分析软件要求等操作层面的信息,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为公开数据集,发布者为 Rune Matthiesen,发布年份为 2023 年。关于数据质量评估指标、缺失值情况、批次效应、样本代表性以及技术重复等信息,源站未提供。使用者在利用该数据集开展分析时,应结合源站条目自行核实数据内容与适用范围。
【引用与许可】
引用信息可依据源站描述:Rune Matthiesen (2023). Plasma extracellular vesicle proteome identifies diffuse large B cell lymphoma patients [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD036735。关于该数据集的许可条款与使用限制,源站未提供。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
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使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD036735
标准获取流程:
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Rune Matthiesen (2023). Plasma extracellular vesicle proteome identifies diffuse large B cell lymphoma patients [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD036735
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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