滤泡性淋巴瘤成像质谱流式单细胞图谱(已处理数据)
该数据集提供了滤泡性淋巴瘤组织微阵列的成像质谱流式单细胞空间蛋白质组学数据,包含约420万个经过注释的细胞,数据模态包括单细胞蛋白质表达矩阵、细胞类型标签以及二维空间坐标。其主要用途是支持肿瘤微环境的空间解析研究,特别是用于揭示滤泡性淋巴瘤中免疫细胞与基质细胞的相互作用、免疫逃避机制以及核心促瘤微环境的结构特征,为淋巴瘤的精准治疗和生物标志物发现提供数据基础。

基本信息
资源简介
滤泡性淋巴瘤成像质谱流式单细胞图谱(已处理数据)
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Imaging mass cytometry single-cell atlas of follicular lymphoma (processed data)》。源站首次发布:2026-06-09。
【数据内容】
源站原始描述:Processed, de-identified single-cell data from imaging mass cytometry (IMC, Hyperion) of follicular lymphoma tissue microarrays, accompanying the manuscript "Spatial Proteomics Reveals Dual-Compartment Immune Evasion Architecture and Core Lymphomagenic Stromal Niches in Follicular Lymphoma" (Elemento et al.). Two AnnData (.h5ad) files contain the analysis-ready single-cell tables for two complementary 39-marker antibody panels (T, immune-focused; S, stromal/myeloid-focused) across four tissue mi…
【数据结构与技术规格】
数据集 DOI:10.5281/zenodo.20612591。
【主题与分类】
主题标签:follicular lymphoma、imaging mass cytometry、spatial proteomics、tumor microenvironment、single-cell、Hyperion、tissue microarray、immune evasion。
【获取与许可】
源站页面:https://zenodo.org/records/20612591
使用许可:cc-by-4.0。
下载信息
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使用方式
数据集获取(Zenodo 公开直链)
源站:https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.20612590
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数据说明
该数据集是来自滤泡性淋巴瘤组织微阵列的成像质谱流式(IMC/Hyperion)单细胞数据,经过处理并已去除个人身份信息。它包含两个互补的39标志物抗体面板(T细胞/免疫聚焦面板和基质/髓系聚焦面板)在四个组织微阵列上的分析就绪单细胞表格,总计约420万个细胞。数据以AnnData(.h5ad)格式提供,包含细胞类型注释、空间坐标以及跨组织微阵列的嵌入信息。.X矩阵经过arcsinh(raw/5)转换和每个标志物的z-score标准化。数据集主要应用于空间蛋白质组学研究,旨在揭示滤泡性淋巴瘤的免疫逃避结构和核心淋巴瘤发生基质微环境,为肿瘤微环境、免疫治疗和淋巴瘤生物学研究提供关键资源。
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