人类视网膜母细胞瘤空间转录组图谱
该数据集是一个基于空间转录组学技术构建的人类视网膜母细胞瘤基因表达图谱，包含来自视网膜和肿瘤组织的空间分辨基因表达数据，揭示了肿瘤内10个转录异质亚群及其微环境组成，主要用于研究视网膜母细胞瘤的肿瘤异质性、细胞间通讯网络和恶性进展机制，为癌症生物学和精准医疗提供重要资源。
基本信息
资源简介
该数据集是一个人类视网膜母细胞瘤（RB）的空间转录组学数据集，通过空间转录组技术对人类视网膜和视网膜母细胞瘤肿瘤进行基因表达谱分析，以全面解析肿瘤的空间细胞间通讯网络。数据集揭示了RB肿瘤内的高度异质性，包含10个转录特征不同的亚群，并识别了肿瘤微环境的主要组成，如视锥前体细胞、胶质细胞和癌症相关成纤维细胞。此外，数据集还描绘了RB恶性进展的细胞轨迹，识别了关键信号通路，并构建了RB亚群与邻近区域的空间网络图谱。该数据集为RB研究提供了首个空间基因图谱，有助于深入理解RB进展中复杂的空间通讯机制，为靶向治疗设计提供新见解。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://explore.data.humancellatlas.org/projects/1662accf-0e0c-48c4-9314-5aba063f2220
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是一个人类视网膜母细胞瘤（RB）的空间转录组学数据集，通过空间转录组技术对人类视网膜和视网膜母细胞瘤肿瘤进行基因表达谱分析，以全面解析肿瘤的空间细胞间通讯网络。数据集揭示了RB肿瘤内的高度异质性，包含10个转录特征不同的亚群，并识别了肿瘤微环境的主要组成，如视锥前体细胞、胶质细胞和癌症相关成纤维细胞。此外，数据集还描绘了RB恶性进展的细胞轨迹，识别了关键信号通路，并构建了RB亚群与邻近区域的空间网络图谱。该数据集为RB研究提供了首个空间基因图谱，有助于深入理解RB进展中复杂的空间通讯机制，为靶向治疗设计提供新见解。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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