滤泡性淋巴瘤Tregs具有影响其在恶性淋巴结中迁移和滞留的独特转录谱
研究对来自滤泡性淋巴瘤淋巴结、正常淋巴结和反应性淋巴结的流式分选 Tregs 进行 RNAseq 分析，识别出与滤泡性淋巴瘤淋巴结 Tregs 抑制能力增强相关的分子（如 CTLA-4、IL-10、GITR 上调），并揭示通过下调 S1PR1、SELL 和 CCR7 使 Tregs 靶向并积聚于人类
基本信息
资源简介
滤泡性淋巴瘤Tregs具有影响其在恶性淋巴结中迁移和滞留的独特转录谱
Follicular Lymphoma Tregs Have a Distinct Transcription Profile Impacting Their Migration and Retention in the Malignant Lymph Node
该数据集来自 plos.figshare.com，包含 2 个 PDF 文件，配套论文发表于 PLOS ONE（2016 年）。研究对来自滤泡性淋巴瘤淋巴结、正常淋巴结和反应性淋巴结的流式分选 Tregs 进行 RNAseq 分析，识别出与滤泡性淋巴瘤淋巴结 Tregs 抑制能力增强相关的分子（如 CTLA-4、IL-10、GITR 上调），并揭示通过下调 S1PR1、SELL 和 CCR7 使 Tregs 靶向并积聚于人类肿瘤微环境的新机制。数据可用于研究 Tregs 在淋巴瘤微环境中的转录特征、迁移与滞留机制（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。
【数据集背景】
配套论文《Follicular Lymphoma Tregs Have a Distinct Transcription Profile Impacting Their Migration and Retention in the Malignant Lymph Node》发表于 PLOS ONE（2016），DOI：10.1371/journal.pone.0155347。源站首次发布：2016-05-26。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：我们此前已表明，浸润滤泡性淋巴瘤淋巴结的调节性 T 细胞（Tregs）在数量和质量上均不同于浸润正常淋巴结和反应性淋巴结的 Tregs。为深入了解这些 Treg 群体如何不同，我们对来自所有三种来源的流式分选 Tregs 进行了 RNA 测序（RNAseq）分析。我们识别出若干可能促成观察到的滤泡性淋巴瘤淋巴结 Tregs 抑制能力增强的分子，包括 CTLA-4、IL-10 和 GITR 的上调，所有这些均经蛋白表达确认。此外，我们识别并功能确认了一种新机制，即 Tregs 通过下调 S1PR1、SELL（L-选择素）和 CCR7 靶向并积聚于人类肿瘤微环境，可能导致更大的淋巴结滞留。此外，我们识别并功能确认了上调
【数据结构与技术规格】
文件数 2 个，合计 2.75 MB。数据集 DOI：10.1371/journal.pone.0155347。
【主题与分类】
源站学科分类：Cell Biology、Molecular Biology、Physiology、Immunology、Cancer、Hematology。主题标签：RNA sequence、CCR、lymph node、lymphoma nodal Tregs、CTLA、Such findings offer、GITR、tumor microenvironment、chemokines CXCL 13、Distinct Transcription Profile Impacting。本站分类：肿瘤/淋巴瘤。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Cell Biology、Molecular Biology、Physiology、Immunology、Cancer、Hematology。
【获取与许可】
源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/Follicular_Lymphoma_Tregs_Have_a_Distinct_Transcription_Profile_Impacting_Their_Migration_and_Retention_in_the_Malignant_Lymph_Node/3935799
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Nedelkovska, Hristina; F. Rosenberg, Alexander; P. Hilchey, Shannon; Hyrien, Ollivier; Burack, W. Richard; Quataert, Sally A.; et al. (2016). Follicular Lymphoma Tregs Have a Distinct Transcription Profile Impacting Their Migration and Retention in the Malignant Lymph Node. PLOS ONE. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-01，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取（Figshare）
- 源站标题：Follicular Lymphoma Tregs Have a Distinct Transcription Profile Impacting Their Migration and Retention in the Malignant Lymph Node
- DOI：10.1371/journal.pone.0155347
- 发布日期：2016-05-26
- 文件数：2 个
- 文件总体积：2.75 MB
- 源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/Follicular_Lymphoma_Tregs_Have_a_Distinct_Transcription_Profile_Impacting_Their_Migration_and_Retention_in_the_Malignant_Lymph_Node/3935799
命令行下载
curl -L -o "S1 File.PDF" "https://ndownloader.figshare.com/files/6156963"
curl -L -o "S2 File.PDF" "https://ndownloader.figshare.com/files/6157008"
文件清单
S1 File.PDF（2.61 MB）S2 File.PDF（140.72 KB）
文件总体积 2.75 MB（源站 API 实测）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据说明
我们此前已证实，浸润滤泡性淋巴瘤淋巴结的调节性T细胞（Tregs）在数量和质量上均不同于浸润正常淋巴结和反应性淋巴结的Tregs。为深入探究这些Treg群体之间的差异，我们对来自上述三种来源的经流式分选的Tregs进行了RNA测序（RNAseq）分析。我们鉴定出若干可能促成滤泡性淋巴瘤淋巴结Tregs所观察到的抑制能力增强的分子，包括CTLA-4、IL-10和GITR的上调，且均已通过蛋白表达予以证实。此外，我们还鉴定并通过功能验证了一种新机制，即Tregs通过下调S1PR1、SELL（L-选择素）和CCR7靶向并蓄积于人类肿瘤微环境中，可能从而导致淋巴结内滞留增加。
此外，我们在功能上鉴定并证实了趋化因子受体CXCR5的上调以及趋化因子CXCL13和IL-16的分泌，证明滤泡来源的Tregs具有独特能力，不仅能够定位于并蓄积于恶性淋巴结内，还能定位于并蓄积于恶性B细胞滤泡本身之中。这些发现为滤泡性淋巴瘤淋巴结Tregs如何参与滤泡性淋巴瘤生物学提供了重要的新见解，并确定了若干新的治疗靶点。
许可
CC BY 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0155347（source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/Follicular_Lymphoma_Tregs_Have_a_Distinct_Transcription_Profile_Impacting_Their_Migration_and_Retention_in_the_Malignant_Lymph_Node/3935799）。
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