儿童非霍奇金淋巴瘤血清蛋白生物标志物iTRAQ蛋白质组学数据

该数据集来自frontiersin.figshare.com,包含一份关于儿童非霍奇金淋巴瘤(NHL)的iTRAQ蛋白质组学分析表格文件

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2023-06-04 更新
浏览 2
蛋白质分类non-Hodgkin’s lymphomaproteomicschildrenserum
Data from: Hotspot propensity across mutational processes

基本信息

模态
蛋白质
大小
0.000805177 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-06-04
版本
v1

资源简介

儿童非霍奇金淋巴瘤血清蛋白生物标志物iTRAQ蛋白质组学数据

Table_1_iTRAQ-Based Proteomic Analysis Reveals Potential Serum Biomarkers for Pediatric Non-Hodgkin’s Lymphoma.xlsx

该数据集来自frontiersin.figshare.com,包含一份关于儿童非霍奇金淋巴瘤(NHL)的iTRAQ蛋白质组学分析表格文件。研究检测了B-NHL、T-NHL患儿及健康对照各20例的血清蛋白表达谱,并进一步验证候选生物标志物S100A8和LRG1。数据可用于筛选和验证儿童NHL的潜在血清生物标志物,支持基于蛋白质组学的分类与诊断研究(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Non-Hodgkin Lymphoma in Children and Adolescents: Progress Through Effective Collaboration, Current Knowledge, and Challenges Ahead》发表于 Journal of Clinical Oncology(2015),DOI:10.1200/JCO.2014.59.5827。源站首次发布:2022-03-17。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):非霍奇金淋巴瘤(NHL)是儿童中第三常见的恶性肿瘤。然而,在NHL初诊时,由于临床表现非特异且目前诊断方法有限,大多数病例已处于晚期。本研究旨在利用基于相对和绝对定量同位素标记(iTRAQ)的蛋白质组学分析,筛选并验证儿童NHL的潜在血清生物标志物。采用iTRAQ结合二维液相色谱-串联质谱(2D LC–MS/MS)检测B-NHL患儿(n=20)、T-NHL患儿(n=20)和健康对照(n=20)的血清蛋白表达谱,并应用Ingenuity Pathway Analysis(IPA)进行分析。候选生物标志物S100A8和LRG1通过酶联免疫吸附测定(ELISA)进一步验证。基于E的受试者工作特征(ROC)分析

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 805.18 KB。数据集 DOI:10.3389/fonc.2022.848286.s003。

【主题与分类】

源站学科分类:Cancer、Haematological Tumours、Molecular Targets、Radiation Therapy、Oncology and Carcinogenesis not elsewhere classified、Solid Tumours。主题标签:non-Hodgkin’s lymphoma、proteomics、children、serum。本站分类:肿瘤/淋巴瘤。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Cancer、Haematological Tumours、Molecular Targets、Radiation Therapy、Oncology and Carcinogenesis not elsewhere classified、Solid Tumours。

【获取与许可】

源站页面:https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table_1_iTRAQ-Based_Proteomic_Analysis_Reveals_Potential_Serum_Biomarkers_for_Pediatric_Non-Hodgkin_s_Lymphoma_xlsx/19380107

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Yu, Runhong; Cheng, Linna; Yang, Shiwei; Liu, Yufeng; Zhu, Zunmin (2022). Table_1_iTRAQ-Based Proteomic Analysis Reveals Potential Serum Biomarkers for Pediatric Non-Hodgkin’s Lymphoma.xlsx. Frontiers. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-04,引用时请注意版本时效。

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curl -L -o "Table_1_iTRAQ-Based Proteomic Analysis Reveals Potential Serum Biomarkers for Pediatric Non-Hodgkin’s Lymphoma.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/34418237"

文件清单

  • Table_1_iTRAQ-Based Proteomic Analysis Reveals Potential Serum Biomarkers for Pediatric Non-Hodgkin’s Lymphoma.xlsx(805.18 KB)

文件总体积 805.18 KB(源站 API 实测)。

数据说明

非霍奇金淋巴瘤(NHL)是儿童中第三常见的恶性肿瘤。然而,在NHL初诊时,大多数病例已处于晚期,这是因为临床表现非特异性且目前诊断方法有限。本研究旨在利用基于相对和绝对定量同位素标记(iTRAQ)的蛋白质组学分析,筛选并验证儿童NHL的潜在血清生物标志物。采用iTRAQ结合二维液相色谱-串联质谱(2D LC–MS/MS)检测B-NHL患儿(n=20)、T-NHL患儿(n=20)和健康对照(n=20)的血清蛋白表达谱,并应用Ingenuity Pathway Analysis(IPA)进行分析。候选生物标志物S100A8和LRG1通过酶联免疫吸附试验(ELISA)进一步验证。基于ELISA数据的受试者工作特征(ROC)分析用于评估诊断效能。使用iTRAQ结合2D LC–MS/MS共鉴定出534种蛋白质,且重复鉴定两次。

进一步分析根据我们设定的标准,在B-NHL和T-NHL血清中分别鉴定出79个和73个与对照血清相比的差异表达蛋白;在B-NHL中,34个蛋白过表达,45个蛋白低表达,而在T-NHL中,45个蛋白过表达,28个蛋白低表达(p < 0.05)。IPA显示多种信号通路,包括急性期反应信号传导和肝X受体/视黄醇X受体(LXR/RXR)激活,与儿童NHL强烈相关。根据ELISA结果,与正常对照相比,NHL患者的S100A8和LRG1升高(p < 0.05),这与iTRAQ结果一致。S100A8、LRG1以及S100A8和LRG1联合的ROC曲线下面积分别为0.873、0.898和0.970。我们的发现表明,使用iTRAQ结合2D LC–MS/MS分析血清蛋白质组是发现生物标志物的一种可行方法。血清S100A8和LRG1是儿童NHL有前景的候选生物标志物,这些差异蛋白揭示了一种新的发病机制,并可能在未来对NHL的临床诊断有所帮助。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.3389/fonc.2022.848286.s003(source: https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table_1_iTRAQ-Based_Proteomic_Analysis_Reveals_Potential_Serum_Biomarkers_for_Pediatric_Non-Hodgkin_s_Lymphoma_xlsx/19380107)。

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