Name: 中国滤泡性淋巴瘤患者ctDNA预后预测应用Table4数据
Creator: 千方医数集科研发现管道
License: CC BY 4.0

基本信息

模态

基因组

大小

0.000013858 GB

任务类型

预测

许可

CC BY 4.0

创建/更新时间

2023-06-21

版本

v1

资源简介

中国滤泡性淋巴瘤患者ctDNA预后预测应用Table4数据

Table4_Application of circulating tumour DNA in terms of prognosis prediction in Chinese follicular lymphoma patients.XLSX

该数据来自frontiersin.figshare.com，为一项中国滤泡性淋巴瘤患者循环肿瘤DNA预后预测研究的Table4文件，包含28例初诊FL患者的ctDNA突变谱及临床因素信息。研究采用59基因靶向NGS panel检测突变，并分析突变与临床结局预后指标的关系。数据可用于探索FL的突变图谱、评估突变作为预后生物标志物的价值，以及支持FL预后预测相关分析（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。

【数据集背景】

配套论文《Circulating tumor DNA mutation profile is associated with the prognosis and treatment response of Chinese patients with newly diagnosed diffuse large B-cell lymphoma》发表于 Frontiers in Oncology（2022），DOI：10.3389/fonc.2022.1003957。源站首次发布：2023-04-20。

【数据内容】

源站描述（机器翻译，仅供参考）：背景：滤泡性淋巴瘤（FL）是一种惰性非霍奇金淋巴瘤（NHL），通常无法治愈。良好的预后和持久的缓解对FL患者至关重要。基因突变谱为确定FL患者的预后提供了新的生物标志物，但其检测容易受到肿瘤组织活检采集的影响。在本研究中，我们旨在利用循环肿瘤DNA（ctDNA）样本描述FL的突变图谱，并探讨突变与新诊断滤泡性淋巴瘤患者临床结局预后指标之间的关系以及此类突变的预后价值。方法：本研究共纳入28例新诊断的FL患者。使用基于靶向NGS的59基因panel评估ctDNA突变谱。携带突变的患者之间临床因素的差异

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个，合计 13.86 KB。数据集 DOI：10.3389/fgene.2023.1066808.s005。

【主题与分类】

源站学科分类：Gene and Molecular Therapy、Gene Expression (incl. Microarray and other genome-wide approaches)、Genetics、Genetically Modified Animals、Livestock Cloning、Developmental Genetics (incl. Sex Determination)。主题标签：follicular lymphoma、circulating tumour DNA、targeted next-generation sequencing、mutation、prognosis。本站分类：肿瘤/淋巴瘤。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Gene and Molecular Therapy、Gene Expression (incl. Microarray and other genome-wide approaches)、Genetics、Genetically Modified Animals、Livestock Cloning、Developmental Genetics (incl. Sex Determination)。

【获取与许可】

源站页面：https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table4_Application_of_circulating_tumour_DNA_in_terms_of_prognosis_prediction_in_Chinese_follicular_lymphoma_patients_XLSX/22663246

使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。

规范引用：Zhao, Mengjing; Li, Qingjuan; Yang, Jing; Zhang, Min; Liu, Xiaolan; Zhang, Hongwei; et al. (2023). Table4_Application of circulating tumour DNA in terms of prognosis prediction in Chinese follicular lymphoma patients.XLSX. Frontiers. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-21，引用时请注意版本时效。

原始链接

https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table4_Application_of_circulating_tumour_DNA_in_terms_of_prognosis_prediction_in_Chinese_follicular_lymphoma_patients_XLSX/22663246

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使用方式

数据集获取（Figshare）

源站标题：Table4_Application of circulating tumour DNA in terms of prognosis prediction in Chinese follicular lymphoma patients.XLSX
DOI：10.3389/fgene.2023.1066808.s005
发布日期：2023-04-20
文件数：1 个
文件总体积：13.86 KB
源站页面：https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table4_Application_of_circulating_tumour_DNA_in_terms_of_prognosis_prediction_in_Chinese_follicular_lymphoma_patients_XLSX/22663246

命令行下载

curl -L -o "Table4_Application of circulating tumour DNA in terms of prognosis prediction in Chinese follicular lymphoma patients.XLSX" "https://ndownloader.figshare.com/files/40227730"

文件清单

Table4_Application of circulating tumour DNA in terms of prognosis prediction in Chinese follicular lymphoma patients.XLSX（13.86 KB）

文件总体积 13.86 KB（源站 API 实测）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

背景：滤泡性淋巴瘤（FL）是一种惰性非霍奇金淋巴瘤（NHL），通常无法治愈。良好的预后和持久的缓解对FL患者至关重要。基因突变谱为判断FL患者的预后提供了新的生物标志物，但其检测易受肿瘤组织活检采集的影响。本研究旨在利用循环肿瘤DNA（ctDNA）样本描述FL的突变图谱，并探讨新诊断滤泡性淋巴瘤患者中突变与临床结局预后指标之间的关系及此类突变的预后价值。方法：本研究共纳入28例新诊断的FL患者。采用基于靶向NGS的59基因panel评估ctDNA突变谱。分析携带突变患者与无突变患者之间临床因素的差异。我们还探讨了基因突变状态、平均VAFs（变异等位基因频率）与临床因素之间的关系。

采用Kaplan‒Meier法分析携带突变与无突变患者的总体生存期（OS）和无进展生存期（PFS）。结果：21例（75%）患者可检测到ctDNA突变。最常见的突变基因为CREBBP（54%，15/28）、KMT2D（50%，14/28）、STAT6（29%，8/28）、CARD11（18%，5/28）、PCLO（14%，4/28）、EP300（14%，4/28）、BCL2（11%，3/28）和TNFAIP3（11%，3/28），突变频率均>10%。可检测到ctDNA突变的患者倾向于表现为晚期Ann Arbor分期（III-IV期）（p = 0.009）、高FLIPI风险（3–5）（p = 0.023）和严重淋巴结受累（受累区域数≥5）（p = 0.02）。此外，我们发现晚期Ann Arbor分期、高危FLIPI、乳酸脱氢酶升高（LDH：0–248U/L）、晚期病理分级、骨髓受累（BMI）和淋巴结受累患者的平均VAF显著更高。此外，KMT2D、EP300和STAT6突变与较差的PFS相关（p 结论：我们描述了中国新诊断FL患者的ctDNA突变图谱，并发现t