HIF-1alpha靶向仿生纳米囊泡增强肺癌放射敏感性并减轻放疗毒性
该数据集来自 NCBI,主题为 HIF-1alpha 靶向仿生纳米囊泡增强肺癌放射敏感性并减轻放疗毒性。研究利用仿生纳米囊泡递送 HIF-1alpha 抑制剂 PX-478,评估其增强放射敏感性、减轻放疗毒性及改善系统性营养代谢的效果,并构建多模态机器学习框架预测放疗毒性风险、指导营养干预分层

基本信息
资源简介
HIF-1alpha靶向仿生纳米囊泡增强肺癌放射敏感性并减轻放疗毒性
该数据集来自 NCBI,主题为 HIF-1alpha 靶向仿生纳米囊泡增强肺癌放射敏感性并减轻放疗毒性。研究利用仿生纳米囊泡递送 HIF-1alpha 抑制剂 PX-478,评估其增强放射敏感性、减轻放疗毒性及改善系统性营养代谢的效果,并构建多模态机器学习框架预测放疗毒性风险、指导营养干预分层。数据包含原始序列读段,可用于肺癌放疗抵抗、放疗毒性预测及营养代谢相关研究(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):背景:肺癌放疗(RT)受肿瘤缺氧、放射性肺损伤以及包括营养恶化在内的全身代谢紊乱所限制。缺氧诱导因子1-alpha(HIF-1alpha)是肿瘤放射抵抗和代谢重编程的关键驱动因素。本研究旨在评估递送HIF-1alpha抑制剂(PX-478)的仿生纳米囊泡在增强放射敏感性、减轻RT诱导毒性以及改善全身营养代谢方面的疗效。此外,还开发了一个多模态机器学习框架,用于预测RT毒性风险并指导营养干预分层。方法:合成仿生纳米囊泡,并对其PX-478包封、稳定性和pH响应释放进行表征。使用原位Lewis肺癌模型和A549/H1975细胞系评估放射敏感性
【主题与分类】
主题标签:Raw sequence reads。本站分类:肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1542245
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pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
背景:肺癌放疗(RT)受限于肿瘤缺氧、放射性肺损伤及包括营养恶化在内的全身代谢紊乱。缺氧诱导因子1-α(HIF-1alpha)是肿瘤放射抵抗和代谢重编程的关键驱动因子。本研究旨在评估递送HIF-1alpha抑制剂(PX-478)的仿生纳米囊泡在增强放射敏感性、减轻RT诱导毒性及改善全身营养代谢方面的疗效。此外,还开发了一个多模态机器学习框架,用于预测RT毒性风险并指导营养干预分层。方法:合成仿生纳米囊泡,并对其PX-478包封率、稳定性及pH响应性释放进行表征。采用原位Lewis肺癌模型及A549/H1975细胞系评估放射增敏和毒性减轻效果。运用多组学、单细胞转录组学及空间组学探究缺氧驱动的代谢重编程和全身营养耗竭。
一种整合了微型CT成像、多组学和行为数据的多模态机器学习模型被开发并验证,用于毒性风险预测和营养干预分层。结果:载有PX-478的纳米囊泡表现出高效的肿瘤细胞摄取、pH响应性释放以及抑制HIF-1alpha信号传导。在体外,纳米囊泡破坏了肿瘤代谢适应,增强了氧化应激,并加剧了放疗诱导的DNA损伤。在体内,纳米囊泡与放疗联合抑制了肿瘤生长,减少了肺纤维化和炎症,并恢复了包括白蛋白和支链氨基酸在内的全身营养参数。多组学分析将HIF-1alpha驱动的代谢重编程与放疗毒性和全身营养耗竭联系起来。该机器学习模型实现了稳健的预测性能(AUC = 0.964),并成功
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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