PRJNA1536655:十七烷酸(HDA)与油酸(OA)处理PC-9非小细胞肺癌细胞的RNA-seq分析
NCBI 的 BioProject ID 1536655 记录显示,BioProject 是围绕单一计划、来自单一组织或联盟的生物数据集合

基本信息
资源简介
PRJNA1536655:十七烷酸(HDA)与油酸(OA)处理PC-9非小细胞肺癌细胞的RNA-seq分析
ID 1536655 - BioProject - NCBI
NCBI 的 BioProject ID 1536655 记录显示,BioProject 是围绕单一计划、来自单一组织或联盟的生物数据集合。其记录为用户提供一个统一入口,用于查找该项目生成的不同数据类型链接;该记录标签为 Raw sequence reads(原始序列读取)(来源 NCBI)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):BioProject 是与单一研究计划相关的一组生物学数据,源自单一机构或一个联盟。BioProject 记录为用户提供了一个统一入口,以便找到指向该项目所生成的各种数据类型的链接。
【主题与分类】
主题标签:Raw sequence reads。本站分类:肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1536655
下载信息
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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1536655
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
十七烷酸(HDA;C17:0)是一种奇数碳链饱和脂肪酸,已被证明可抑制非小细胞肺癌(NSCLC)细胞增殖,但其转录组学效应仍不完全清楚。为研究HDA在NSCLC细胞中诱导的转录变化,我们对用HDA或油酸(OA;C18:1)处理的人PC-9 NSCLC细胞进行了RNA测序;油酸是一种促增殖脂肪酸,用作对照。提取总RNA后,由Suzhou Genewiz完成高通量RNA测序。通过差异表达分析鉴定对HDA与OA处理有响应的基因和通路,包括CA9。这些RNA-seq数据为HDA对NSCLC细胞的作用提供了转录组学证据。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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