PRJNA1519067：通过类器官探索EGFR突变肺癌奥希替尼耐药的分子机制

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1519067

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   • 天池: 登录后页面提供直链下载
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数据说明

背景：奥希替尼是EGFR突变型非小细胞肺癌（NSCLC）的一线靶向治疗药物，但获得性耐药限制了其临床疗效。保留肿瘤异质性的患者来源肿瘤类器官是探索耐药机制的理想模型。本研究旨在利用类器官模型阐明EGFR突变型肺癌中关键基因介导的奥希替尼耐药机制。方法：构建EGFR突变型肺癌类器官并检测其对奥希替尼的敏感性。进行转录组测序并与TCGA数据进行交叉分析，以筛选耐药相关基因和通路。通过类器官过表达和敲低实验验证SPC25功能，并通过Western blot评估铁死亡相关蛋白（NRF2、SLC7A11、GPX4）的表达。结果：成功构建了具有上皮表型和增殖活性的肺癌类器官。奥希替尼敏感类器官的IC50为0.49 μM，而奥希替尼耐药类器官的IC50为8.51 μM。转录组测序联合TCGA分析鉴定出522个共有差异表达基因。KEGG富集显示铁死亡通路显著富集。其中，SPC25表达在耐药类器官中上调最为显著。在敏感类器官中过表达SPC25显著降低了对奥希替尼的敏感性，同时上调了NRF2、SLC7A11和GPX4的表达；在耐药类器官中敲低SPC25恢复了对奥希替尼的敏感性，并下调了上述铁死亡抑制蛋白的表达。结论：SPC25通过抑制铁死亡通路介导EGFR突变型肺癌类器官对奥希替尼的耐药。靶向SPC25或联合诱导铁死亡可能是逆转奥希替尼耐药的新策略。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。