SLC7A5 通过 PPARA 重编程脂肪酸代谢促进肺腺癌转移
该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1497097），主题为 SLC7A5 通过 PPARA 重编程脂肪酸代谢促进肺腺癌转移，属于肿瘤/肺癌领域
基本信息
资源简介
SLC7A5 通过 PPARA 重编程脂肪酸代谢促进肺腺癌转移
该数据集为 NCBI BioProject 数据库中的一项生物项目记录，英文名称为“PRJNA1497097: SLC7A5 Promotes Lung Adenocarcinoma Metastasis by Reprogramming Fatty Acid Metabolism via PPARA”，源站编号为 ID 1497097。其研究主题聚焦于 SLC7A5 通过 PPARA 重编程脂肪酸代谢从而促进肺腺癌转移的机制，属于肿瘤/肺癌领域。数据集的主题标签为“Raw sequence reads”，表明其包含与该项目相关的原始序列读长数据。该记录为使用者提供了一个集中入口，用以查找围绕这一单一研究计划所生成的多种数据类型，便于对该课题进行数据检索与后续分析。
【数据集背景】
该数据集来源于 NCBI BioProject，项目编号为 1497097。BioProject 是围绕单一研究计划或倡议所组织的生物数据集合，通常由单一机构或联合体发起。一个 BioProject 记录为用户提供统一入口，以查找该项目所产生的多种数据类型。本项目的科学主题为 SLC7A5 通过 PPARA 重编程脂肪酸代谢促进肺腺癌转移，属于肿瘤/肺癌研究领域。该主题涉及肺腺癌转移机制与脂肪酸代谢重编程之间的关联，并以 SLC7A5 和 PPARA 为核心分子线索。源站未提供该项目的具体研究机构、资助来源、项目起止时间等背景信息。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”，说明其数据内容以原始序列读长为主。这些原始序列读长应来自该项目围绕 SLC7A5、PPARA 及脂肪酸代谢与肺腺癌转移关系所开展的测序实验。源站未提供具体的样本数量、测序平台、读长类型、数据量大小、文件格式、物种信息、组织类型或实验设计细节。除“Raw sequence reads”这一主题标签外，源站未提供其他数据类型或数据组成说明。
【采集与来源】
该数据集来自 NCBI BioProject 数据库，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。其记录标识为 ID 1497097，英文名称为“PRJNA1497097: SLC7A5 Promotes Lung Adenocarcinoma Metastasis by Reprogramming Fatty Acid Metabolism via PPARA”。源站描述指出，BioProject 是围绕单一研究计划、来自单一机构或联合体的生物数据集合，并为用户提供查找该项目多种数据类型的统一入口。源站未提供样本采集地点、采集时间、采集方法、伦理审批信息或具体提交机构等细节。
【适用场景】
该数据集适用于与肺腺癌转移、脂肪酸代谢重编程、SLC7A5 及 PPARA 相关的研究场景。由于主题标签为“Raw sequence reads”，其原始序列读长可用于转录组、基因组或其他测序数据的再分析，以探索 SLC7A5 通过 PPARA 影响脂肪酸代谢并促进肺腺癌转移的潜在机制。该数据集也可用于肿瘤/肺癌领域的生物信息学分析、差异表达分析、通路富集分析或代谢相关基因研究。源站未提供该数据集在临床诊断、药物开发或特定实验流程中的具体适用说明。
【使用方法】
使用者可通过 NCBI BioProject 记录 ID 1497097 查找该项目，并经由该记录所提供的统一入口访问围绕该研究计划生成的多种数据类型。由于主题标签为“Raw sequence reads”，使用者可依据源站提供的链接获取原始序列读长数据，并按照常规测序数据分析流程进行质量控制、比对、定量及下游分析。源站未提供具体的数据下载方式、分析软件、参数设置或操作步骤。
【质量与限制】
该数据集为 NCBI BioProject 中的项目记录，源站未提供数据质量评估指标、测序深度、覆盖度、重复性、批次效应或质控结果等信息。其主题标签仅标明“Raw sequence reads”，源站未提供数据完整性、准确性或适用性的具体说明。使用者应注意，BioProject 记录本身是项目层面的入口，具体数据质量需依据实际下载的数据文件进行评估。源站未提供该数据集的已知限制、偏差或使用注意事项。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式、许可协议、使用条款或版权信息。使用者如需引用或使用该数据集，应参考 NCBI BioProject 源站页面及相关数据提交机构所给出的具体说明。源站未提供 DOI、文献引用或数据使用授权细节。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1497097
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
转移仍是肺腺癌（LUAD）死亡的主要原因，然而驱动转移进展尤其是肝转移的分子机制仍不完全清楚。代谢重编程已成为癌症的一个标志性特征，但氨基酸转运如何与脂质代谢相互作用以调控转移仍鲜有明确。我们将癌症基因组图谱（TCGA）LUAD队列的生物信息学分析与体外和体内功能研究相结合。采用加权基因共表达网络分析（WGCNA）识别转移相关模块。通过敲低方法在LUAD细胞系中评估SLC7A5功能，采用Western blot、伤口愈合实验、Transwell迁移实验以及原位肺癌小鼠模型进行评估。机制研究包括RNA-seq、靶向脂肪酸谱分析、BODIPY FL C16摄取实验、Seahorse FAO分析以及PPARA荧光素酶报告基因实验。WGCNA鉴定出SLC7A5为转移相关转录网络中的枢纽基因，其高表达预示LUAD患者总生存期、无病生存期较差以及肝转移风险较高。
SLC7A5敲低逆转了上皮-间质转化（EMT），在体外抑制了细胞迁移，并在原位小鼠模型中显著减少了肺内肿瘤生长。机制上，RNA-seq和代谢组学分析显示，SLC7A5缺失诱导了脂肪酸代谢的深刻重编程，其特征为外源性脂肪酸摄取减少、矛盾性地增强的脂肪酸氧化（FAO），以及随之而来的细胞内脂肪酸耗竭。棕榈酸补充挽救了由SLC7A5敲低引起的迁移缺陷。转录因子富集分析确定PPARA为下游效应因子，而SLC7A5沉默显著降低了PPARA表达、转录活性及其调控脂肪酸摄取、合成和氧化的靶基因表达。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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