PRJNA1483354：突变型p53通过抑制SPP1使KRAS驱动肺腺癌对免疫治疗敏感
该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1483354），主题为突变型 p53 通过抑制 SPP1 使 KRAS 驱动的肺腺癌对免疫治疗敏感
基本信息
资源简介
PRJNA1483354：突变型p53通过抑制SPP1使KRAS驱动肺腺癌对免疫治疗敏感
PRJNA1483354 是一个来自 NCBI BioProject 数据库的生物学项目记录，其英文名称为“Mutant p53 sensitizes KRAS-driven lung adenocarcinoma to immunotherapy by repressing SPP1”。该数据集在分类上归属于肿瘤 / 肺癌方向，主题标签为“Raw sequence reads”，即原始序列读长数据。从标题和主题可以看出，该项目围绕突变型 p53、KRAS 驱动的肺腺癌以及免疫治疗敏感性之间的关联展开，核心线索是突变型 p53 通过抑制 SPP1 使 KRAS 驱动的肺腺癌对免疫治疗敏感。该记录为使用者提供了一个集中入口，用以查找与这一研究计划相关的多种数据类型。以下将依据可获得的信息，对该数据集进行分段介绍。
【数据集背景】
该数据集所对应的研究计划聚焦于肺腺癌这一肿瘤类型，尤其关注 KRAS 驱动背景下的肺腺癌。其标题明确指向一个生物学机制假设：突变型 p53 能够通过抑制 SPP1 的表达或功能，使 KRAS 驱动的肺腺癌对免疫治疗更为敏感。这一主题将肿瘤遗传学中的两个常见驱动因素——p53 突变与 KRAS 激活——与肿瘤免疫治疗响应联系起来。NCBI BioProject 作为项目记录的集合，通常来源于单一组织或联盟，旨在为某一项研究计划所产生的多样化数据提供统一的检索入口。因此，PRJNA1483354 可被视为该研究计划在 NCBI 平台上的项目标识与导航节点。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”，表明其包含的数据类型为原始序列读长。这类数据通常来自高通量测序平台，是后续序列比对、表达定量或变异检测等分析的基础。项目英文名称提示了研究可能涉及突变型 p53、KRAS 驱动肺腺癌、免疫治疗敏感性以及 SPP1 抑制等生物学要素，但关于具体样本数量、测序平台、读长长度、覆盖深度、实验条件或分析流程等细节，源站未提供。因此，无法进一步描述该数据集内具体包含哪些样本或产生了多少数据量。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，具体记录为 NCBI BioProject 中 ID 1483354 的项目。BioProject 记录本身并不直接存储所有原始数据，而是提供指向该项目所生成的不同数据类型的链接。根据源站描述，BioProject 是来源于单一组织或联盟、与单一研究计划相关的生物数据的集合。关于该项目的具体提交机构、研究团队、样本采集地点、采集时间或伦理审批信息，源站未提供。
【适用场景】
基于其主题标签“Raw sequence reads”以及肿瘤 / 肺癌分类，该数据集可适用于需要原始测序读长的分析场景，例如转录组分析、基因表达差异研究、免疫微环境相关基因（如 SPP1）的表达评估，或与 p53 突变、KRAS 驱动肺腺癌及免疫治疗敏感性相关的探索性研究。由于项目标题明确指向突变型 p53 通过抑制 SPP1 使 KRAS 驱动肺腺癌对免疫治疗敏感这一机制，该数据也可能用于验证或复现该假设相关的测序分析。但具体适用的分析类型仍需结合源站提供的原始数据说明，源站未提供更详细的适用建议。
【使用方法】
使用者可通过 NCBI BioProject 记录 ID 1483354 访问该项目页面，并借助 BioProject 提供的链接查找与该研究计划相关的不同数据类型。由于主题标签为“Raw sequence reads”，使用者可能需要进一步下载原始序列读长文件，并按照常规高通量测序数据分析流程进行处理。关于具体的下载方式、数据格式、参考基因组版本、分析工具或参数设置，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来自 NCBI BioProject，属于公共数据库中的项目记录。其质量与限制取决于原始数据提交时的标准以及后续数据可用性。当前可获得的信息仅包括项目英文名称、源站标题、分类、来源站、源站描述和主题标签，缺乏对样本质量、测序质量、数据完整性、批次效应或潜在偏倚的说明。因此，无法对该数据集的质量进行具体评估。此外，由于源站未提供详细的实验设计、样本信息和数据处理步骤，使用者在解释结果时需谨慎，并应参考原始项目页面以获取最新和完整的信息。
【引用与许可】
该数据集来源于 NCBI BioProject，记录 ID 为 1483354。关于该项目的具体引用方式、许可条款、数据使用限制或版权声明，源站未提供。使用者应遵循 NCBI 及 BioProject 的一般使用政策，并直接查阅项目页面以获取任何与引用和许可相关的官方说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1483354
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本项目旨在表征在不同KRAS和TP53突变背景下H1299非小细胞肺癌（NSCLC）细胞的转录景观。我们对三种不同的细胞系进行了比较转录组测序（RNA-seq）：H1299细胞、仅携带KRAS G12C突变的H1299细胞（K），以及同时携带KRAS G12C与TP53 R175H（KPR175H）或TP53 R248Q（KPR248Q）热点突变的H1299细胞。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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