PRJNA1466079：抗PD-1后手术的IIIB-N3期肺腺癌长期生存患者TCR库动态
该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1466079），研究对象为一例接受抗PD-1治疗后手术的IIIB-N3期肺腺癌长期生存患者，聚焦其TCR库的长期动态变化
基本信息
资源简介
PRJNA1466079：抗PD-1后手术的IIIB-N3期肺腺癌长期生存患者TCR库动态
PRJNA1466079 是 NCBI BioProject 数据库中的一项生物项目记录，全称为“Long-Term TCR Repertoire Dynamics in a Free Survive Stage IIIB-N3 Lung Adenocarcinoma Patient Treated with Anti-PD-1 Followed by Surgery”。该数据集聚焦于一例 IIIB-N3 期肺腺癌患者，该患者在接受抗 PD-1 治疗后进行了手术，并处于长期生存状态。研究的核心在于追踪该患者 T 细胞受体（TCR）库在较长时间跨度内的动态变化。数据主题标签为“Raw sequence reads”，表明其包含原始测序读长数据。该记录归属于肿瘤/肺癌分类，来源于 ncbi.nlm.nih.gov，为研究者提供了一个集中获取与该特定临床案例相关生物数据的入口。
【数据集背景】
该数据集所对应的 BioProject 记录源自 NCBI，其源站标题为“Homo sapiens (ID 1466079) - BioProject - NCBI”。BioProject 是 NCBI 提供的一种资源集合机制，旨在将源自单一组织或联盟的、与某一项研究计划相关的各类生物数据汇聚在一起。一个 BioProject 记录为用户提供了一个统一的访问位置，便于查找该项目所产生的多种数据类型。本数据集所涉及的研究对象为人类（Homo sapiens），具体疾病背景为 IIIB-N3 期肺腺癌。该患者接受了抗 PD-1 治疗，随后进行了手术，并且属于长期生存（free survive）的案例。研究关注的是该患者 TCR 库在长期随访中的动态变化特征。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”，说明其核心数据形式为原始测序读长。这些读长数据应当来源于对患者样本中 TCR 库进行测序所获得的原始序列信息。源站描述指出，BioProject 记录本身并不直接包含所有数据文件，而是提供指向该项目所生成的各种数据类型的链接。因此，该数据集的内容可能包括与 TCR 库测序相关的原始读长文件，以及指向其他相关数据资源的链接。关于具体的测序平台、读长长度、样本数量、时间点数目等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI 的 BioProject 数据库。项目编号为 PRJNA1466079，内部标识为 ID 1466079。研究对象为 Homo sapiens，即人类。样本来源于一例 IIIB-N3 期肺腺癌患者，该患者接受了抗 PD-1 治疗并随后进行手术。关于样本采集的具体时间点、组织类型（如肿瘤组织、外周血等）、采集地点、采集机构等信息，源站未提供。数据由相关研究组织或联盟提交至 NCBI BioProject 数据库，但具体的提交机构名称、研究团队信息等，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肿瘤免疫学、肺癌临床研究以及 TCR 库分析等领域。具体而言，可用于研究抗 PD-1 治疗对肺腺癌患者 TCR 库多样性和克隆组成的影响，探索长期生存患者中 TCR 库的动态变化模式，以及比较治疗前、治疗中和治疗后不同时间点的 TCR 克隆扩增或收缩情况。此外，该数据集也可用于开发或验证 TCR 库分析方法、免疫治疗响应生物标志物挖掘等。由于该案例涉及长期生存且接受了手术，可能对理解免疫治疗与手术联合治疗模式下的免疫应答特征具有参考价值。关于该数据集是否适用于其他特定分析目的，需结合原始数据的具体内容和质量进行判断。
【使用方法】
用户可通过 NCBI BioProject 数据库访问该记录，利用项目编号 PRJNA1466079 或 ID 1466079 进行检索。BioProject 记录提供了指向该项目所生成的各种数据类型的链接，用户可据此下载原始测序读长数据或其他相关文件。具体的数据下载方式、文件格式、分析工具建议等，源站未提供。用户可能需要结合标准的 TCR 库分析流程，如使用 MiXCR、IMGT/HighV-QUEST 等工具对原始读长进行处理和克隆分型。关于该数据集是否附带详细的分析指南或元数据表，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于 NCBI BioProject 记录，其数据质量依赖于原始提交者的数据产生和提交过程。由于仅涉及一例患者，该数据集在统计推断上的普适性有限，结论不能直接推广到更广泛的肺腺癌患者群体。此外，源站描述仅提供了 BioProject 的通用说明，未对该数据集的具体质量指标（如测序深度、覆盖度、重复性等）进行描述。关于样本量、时间点数量、测序错误率、批次效应等信息，源站未提供。因此，用户在使用该数据集时需自行评估数据质量，并注意单案例研究的固有局限性。
【引用与许可】
该数据集的引用方式应遵循 NCBI BioProject 的标准引用格式，通常包括项目编号 PRJNA1466079 和项目标题。关于该数据集的具体许可协议、使用限制或数据共享政策，源站未提供。用户在使用前应查阅 NCBI 的相关使用条款以及原始提交者可能附加的许可声明。源站未提供该数据集的直接引用文献或相关发表论文信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1466079
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
免疫检查点阻断疗法极大地改变了局部晚期不可切除和转移性非小细胞肺癌（NSCLC）患者的生存可能性。然而，对于不可切除的IIIB-N3期NSCLC患者，推荐的同步根治性放化疗及后续免疫治疗仍未能取得良好的预后结果。在此，我们报告一例不可切除的IIIB期NSCLC患者，伴有对侧纵隔巨块型N3（cT1bN3M0）左肺上叶腺癌，无驱动基因突变，经抗PD-1治疗后达到病理完全缓解，随后接受左肺上叶切除术，并继续抗PD-1治疗3年。迄今为止，该患者已保持无复发生存超过5年。更重要的是，我们在治疗过程中监测了T细胞受体（TCR）库。TCR特征进一步鉴定出一些特定克隆型可能对免疫治疗具有潜在预测价值。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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