基本信息

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基因组

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA1462622：Huayu Wan通过正常化肿瘤血管和重塑肿瘤免疫微环境增强三阴性乳腺癌免疫检查点抑制剂疗效

该数据集对应 NCBI BioProject 编号 1462622，英文名称为“Huayu Wan enhances immune checkpoint inhibitor efficacy in triple-negative breast cancer by normalizing tumor vasculature and remodeling the tumor immune microenvironment”。从名称可以看出，该项目的主题围绕华宇万（Huayu Wan）在三阴性乳腺癌中增强免疫检查点抑制剂疗效的作用机制，涉及肿瘤血管正常化与肿瘤免疫微环境重塑两个方向。数据集在源站被归类为肿瘤相关项目，本站分类标注为肿瘤 / 肺癌，主题标签为“Raw sequence reads”，说明其数据主体为原始测序读段。该 BioProject 记录汇集了与这一研究计划相关的多种数据类型，为用户提供统一入口以查找该项目所产生的数据链接。

【数据集背景】

BioProject 是 NCBI 提供的一种项目级数据组织方式，用于汇集与某一项研究计划相关的生物学数据。按照源站描述，一个 BioProject 通常源自单一机构或联合体，其记录为用户提供单一位置，以便找到该项目所生成的不同类型数据的链接。本数据集即属于此类项目记录，编号为 1462622，研究主题聚焦于三阴性乳腺癌的免疫治疗增敏机制，具体涉及华宇万对肿瘤血管正常化和肿瘤免疫微环境的调控作用。该主题属于肿瘤学与免疫治疗交叉领域，与免疫检查点抑制剂疗效提升的研究方向密切相关。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”，表明其核心数据内容为原始测序读段。这些读段应来自该项目所开展的高通量测序实验，用于支撑三阴性乳腺癌中血管正常化与免疫微环境重塑相关的研究。除原始测序读段外，源站未提供更细粒度的数据内容说明，例如具体测序平台、样本类型、读长、数据量或文件格式等信息均未在已有资料中体现。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI BioProject 数据库，源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“ID 1462622 - BioProject - NCBI”。其数据由项目提交方产生并提交至 NCBI BioProject 进行归档与公开。关于样本采集的具体地点、时间、伦理审批信息以及实验操作流程，源站未提供。

【适用场景】

基于其主题与数据标签，该数据集可适用于以下方向：三阴性乳腺癌免疫检查点抑制剂疗效机制研究、肿瘤血管正常化相关通路分析、肿瘤免疫微环境重塑的转录组或基因组层面探索，以及原始测序读段的再分析。由于数据标签为原始测序读段，具备生物信息学分析能力的用户可将其用于序列比对、表达定量、变异检测等下游分析。具体适用场景需结合项目原始研究设计判断，源站未提供更详细的适用说明。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 数据库检索编号 1462622 或使用数据集英文名称进行查找，进而访问该项目记录页面，获取其关联的数据链接。原始测序读段通常需要借助生物信息学工具进行质控、比对和定量分析。关于该项目数据的具体使用步骤、推荐工具或分析流程，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 BioProject 项目记录，其数据质量取决于提交方所提交的原始数据。源站未提供关于数据质量评估、质控标准、覆盖度或重复性等方面的具体信息。此外，本站分类标注为“肿瘤 / 肺癌”，而数据集主题为三阴性乳腺癌，两者在分类上存在差异，用户在使用时需注意以数据集实际主题为准。源站未提供其他质量与限制说明。

【引用与许可】

该数据集的引用方式与许可条款，源站未提供。用户在使用时应参考 NCBI BioProject 页面上的相关声明，并遵循源站及数据提交方的引用要求。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJNA1462622

访问原始数据

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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1462622

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

华蟾素（HYW）是一种在肿瘤临床治疗中广泛使用的中药复方制剂，已证实具有抗肿瘤活性，并可通过改善非小细胞肺癌瘤内药物递送来增强化疗疗效。然而，其在三阴性乳腺癌（TNBC）治疗中增强免疫检查点抑制剂（ICIs）应答的疗效及作用尚不明确。本研究旨在探讨HYW增强ICIs治疗TNBC疗效的潜在机制。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别