基本信息

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基因组

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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA1455662：非小细胞肺癌免疫治疗应答的宏基因组与代谢组决定因素

PRJNA1455662 是一个收录于 NCBI BioProject 数据库的肿瘤学研究项目，其完整英文名称为 Metagenomic and Metabolomic Determinants of Immunotherapy Response in Non-Small Lung Cancer，中文可译为“非小细胞肺癌免疫治疗应答的宏基因组与代谢组决定因素”。该项目在 BioProject 中的编号为 1455662，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，本站将其归类于肿瘤/肺癌方向，主题标签为原始序列读长（Raw sequence reads）。从标题与分类来看，该项目聚焦于非小细胞肺癌患者在接受免疫治疗过程中，微生物组与代谢组因素如何影响治疗应答，属于肿瘤免疫学与多组学交叉的研究范畴。BioProject 作为 NCBI 提供的项目级归档入口，将同一研究计划下产生的多种数据类型汇聚于一条记录中，便于研究者集中检索与获取。

【数据集背景】

非小细胞肺癌是非小细胞肺癌的主要病理类型之一，免疫治疗已成为其临床管理中的重要手段，但不同患者对免疫治疗的应答差异显著。寻找能够预测或解释这种差异的生物标志物，是当前肿瘤研究的热点方向。该项目以“宏基因组与代谢组决定因素”为切入点，试图从微生物群落和代谢物层面理解免疫治疗应答的潜在机制。源站描述指出，BioProject 是围绕单一研究计划、由单一机构或联盟产生的生物数据的集合，并为用户提供查找该项目所生成各类数据的统一入口。该项目的标题和主题标签表明，其数据核心为原始序列读长，可能涉及宏基因组测序产生的原始读长数据。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”，说明其数据内容以原始序列读长为主。结合项目标题，这些原始读长可能来自宏基因组测序，用于解析与非小细胞肺癌免疫治疗应答相关的微生物组特征。标题中同时提及“代谢组”，但源站未提供代谢组数据的具体类型、格式或规模。关于样本数量、测序平台、读长长度、数据量等细节，源站未提供。BioProject 记录本身作为项目级入口，通常不直接展示所有数据文件，而是链接到项目下生成的多种数据类型，因此该项目的具体数据文件构成需以源站记录为准。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“ID 1455662 - BioProject - NCBI”。BioProject 记录由单一机构或联盟发起，用于汇集与某一研究计划相关的生物数据。关于该项目的具体发起机构、样本采集地点、采集时间、受试者人群特征等信息，源站未提供。本站分类将其归入肿瘤/肺癌方向，主题标签为原始序列读长，这些分类信息可用于辅助检索，但不代表源站提供了更详细的采集背景。

【适用场景】

该数据集适用于与非小细胞肺癌免疫治疗应答相关的宏基因组与代谢组研究。研究者可利用原始序列读长进行微生物组组成分析、功能注释或与其他组学数据的整合分析，以探索免疫治疗应答的潜在微生物与代谢决定因素。此外，该数据集也可用于肿瘤免疫学、肺癌精准治疗、多组学数据整合方法学等方向的研究。由于本站分类为肿瘤/肺癌，相关领域的科研人员可将其作为检索入口，进一步获取项目下的数据资源。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 数据库，以项目编号 1455662 或项目英文名称进行检索，访问该项目的记录页面。BioProject 记录提供指向该项目所生成各类数据的链接，用户可据此定位原始序列读长及其他相关数据。关于具体的数据下载方式、文件格式、分析流程或配套工具，源站未提供。使用时应遵循 NCBI 及 BioProject 的相关数据访问规范。

【质量与限制】

该数据集为 BioProject 项目级记录，其数据质量取决于原始研究的设计与执行。关于测序质量、样本完整性、批次效应、数据覆盖度等具体质量指标，源站未提供。此外，代谢组数据的具体内容与质量信息在源站描述中未予体现。用户在使用前应自行评估数据的适用性与可靠性。该项目的标题提示其研究目标为探索决定因素，但源站未提供任何结论性发现或验证结果。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式与许可条款，源站未提供。用户在使用该数据集时，应参考 NCBI BioProject 的通用引用规范，并查阅项目记录页面以获取可能的引用要求或使用限制。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJNA1455662

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1455662

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们研究了治疗前肠道微生物组和血清代谢组/脂质组与III-IV期NSCLC患者免疫检查点抑制剂（ICI）应答之间的关联。我们开展了一项观察性队列研究，在66例接受ICI治疗的III-IV期NSCLC患者中采集粪便和血液样本，并采用了更新的临床获益定义。采用液相色谱质谱法进行了粪便全基因组测序、血浆非靶向代谢组学和血清脂质组学检测。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别