AMG510耐药与亲本KRAS突变NSCLC细胞系全外显子测序
该数据集为BioProject ID 1451306，包含AMG510耐药及亲本KRAS突变非小细胞肺癌（NSCLC）细胞系的全外显子测序数据，主题标签为Raw sequence reads
基本信息
资源简介
AMG510耐药与亲本KRAS突变NSCLC细胞系全外显子测序
该数据集对应 NCBI BioProject 编号 1451306，英文名称为“Whole Exome Sequencing of AMG510-Resistant and Parental KRAS mutant NSCLC Cell Lines”，即 AMG510 耐药及亲本 KRAS 突变非小细胞肺癌细胞系的全外显子测序项目。其来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“ID 1451306 - BioProject - NCBI”，本站分类归入肿瘤 / 肺癌，主题标签为 Raw sequence reads。整体来看，该数据集围绕 KRAS 突变非小细胞肺癌细胞系在 AMG510 耐药与亲本状态下的全外显子测序展开，属于 BioProject 体系下与单一研究计划相关的生物数据集合，可为关注肺癌靶向治疗耐药机制的研究者提供原始序列读长层面的数据入口。
【数据集背景】
该数据集来自 NCBI 的 BioProject 体系。BioProject 是围绕单一研究计划或倡议组织起来的生物数据集合，通常由单一机构或联盟发起。一个 BioProject 记录为用户提供统一入口，用于查找该项目所产生的多种数据类型。本数据集的项目名称为“Whole Exome Sequencing of AMG510-Resistant and Parental KRAS mutant NSCLC Cell Lines”，表明其研究背景聚焦于 KRAS 突变非小细胞肺癌细胞系中 AMG510 耐药与亲本细胞系之间的比较。本站将其归类为肿瘤 / 肺癌，主题标签为 Raw sequence reads，说明该项目的核心数据形式为原始序列读长。
【数据内容】
该数据集的内容为全外显子测序数据，涉及 AMG510 耐药及亲本 KRAS 突变非小细胞肺癌细胞系。项目名称明确指向两类细胞材料：一是对 AMG510 产生耐药的细胞系，二是亲本细胞系。二者均携带 KRAS 突变，且属于非小细胞肺癌细胞系。数据主题标签为 Raw sequence reads，表明 BioProject 记录所关联的数据类型以原始测序读长为主。除上述信息外，关于样本数量、测序平台、读长长度、覆盖深度、数据量大小等具体指标，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“ID 1451306 - BioProject - NCBI”。其 BioProject 编号为 1451306。根据源站描述，BioProject 记录本身是生物数据的集合入口，用于汇集与单一研究计划相关的多种数据类型，并 originating from a single organization or from a consortium。该数据集在本站被归入肿瘤 / 肺癌分类。关于样本采集的具体地点、时间、机构、伦理审批信息以及细胞系来源等细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与 KRAS 突变非小细胞肺癌及 AMG510 耐药相关的研究场景。由于包含 AMG510 耐药与亲本 KRAS 突变 NSCLC 细胞系的全外显子测序原始序列读长，潜在用途包括：在原始数据层面查看或重新分析外显子区域序列信息；围绕耐药与亲本细胞系进行比较性研究；作为肺癌靶向治疗耐药机制探索的数据资源；以及用于方法学开发、流程验证或数据再利用等。具体适用性需结合源站提供的原始数据与项目说明判断。关于该数据集是否已用于特定发表成果或特定分析结论，源站未提供。
【使用方法】
该数据集以 BioProject 记录形式提供访问入口，用户可通过 NCBI BioProject 编号 1451306 定位项目，并进一步查找该项目关联的数据类型与原始序列读长。由于主题标签为 Raw sequence reads，使用时应预期获取的是原始测序读长数据，而非已加工的表达矩阵或变异注释结果。用户可根据自身研究目的，对原始读长进行质控、比对、变异检测或外显子区域分析等常规全外显子测序数据处理。关于具体的下载方式、文件格式、数据组织结构和配套元数据字段，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集的质量指标、测序深度、覆盖均一性、碱基质量、污染评估、批次信息以及技术重复情况等，源站未提供。其限制在于：当前可确认的信息主要为 BioProject 编号、项目名称、来源站、分类、主题标签以及项目围绕 AMG510 耐药与亲本 KRAS 突变 NSCLC 细胞系开展全外显子测序这一事实。关于样本量、细胞系具体名称、突变位点、耐药模型构建方式、对照设置和统计分析结果等，源站未提供。因此，使用该数据集时不应超出原始序列读长与项目名称所界定的范围进行推断。
【引用与许可】
该数据集的引用方式、许可条款、使用限制、是否允许再分发以及是否需要遵守 NCBI 相关数据使用政策等，源站未提供。用户在使用前应自行查阅 NCBI BioProject 记录及其关联数据页面所载明的引用与许可要求。关于通讯作者、贡献机构、资助来源和项目注册时间等引用相关信息，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1451306
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们对两对亲本及耐药（对AMG510耐药）的非小细胞肺癌细胞系（H358、H1373及其衍生系）进行了全外显子组测序，以识别与获得性化疗耐药相关的基因组改变。对测序数据进行分析，以检测体细胞单核苷酸变异（SNVs）、小插入和缺失（indels）以及拷贝数改变。本研究旨在揭示非小细胞肺癌治疗的新耐药机制和潜在生物标志物。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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