PRJNA1445085：靶向CRTC2逆转STK11突变NSCLC肿瘤免疫治疗耐药
该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1445085），主题为靶向 CRTC2 逆转 STK11 突变非小细胞肺癌（NSCLC）肿瘤对免疫治疗的耐药
基本信息
资源简介
PRJNA1445085：靶向CRTC2逆转STK11突变NSCLC肿瘤免疫治疗耐药
该数据集为 NCBI BioProject 数据库中的一项记录，编号 1445085，英文名称为“PRJNA1445085: Targeting CRTC2 reverses STK11-mutant NSCLC tumors resistance to immunotherapy”。从名称可以看出，该项目的核心研究方向是靶向 CRTC2 以逆转 STK11 突变型非小细胞肺癌（NSCLC）肿瘤对免疫治疗产生的耐药性。数据集在分类上归属于肿瘤 / 肺癌领域，主题标签为“Raw sequence reads”，即原始序列读长数据。其来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI 的 BioProject 体系。BioProject 是围绕某一项研究计划汇集生物数据的集合，通常来自单一机构或联合体，并为用户提供统一入口，以便查找该项目所产生的多种类型数据。该数据集即围绕上述肺癌免疫治疗耐药逆转研究而组织，供相关领域的研究人员检索与使用。
【数据集背景】
该数据集所对应的研究计划聚焦于非小细胞肺癌（NSCLC）中 STK11 突变导致的免疫治疗耐药问题，并提出以 CRTC2 为靶点来逆转这种耐药。STK11 突变是非小细胞肺癌中一类具有临床意义的分子特征，常与免疫治疗疗效不佳相关；而 CRTC2 作为该研究关注的靶向对象，其干预可能为克服耐药提供新的思路。该 BioProject 记录正是围绕这一研究目标而建立，用于汇集项目产生的生物数据。源站描述指出，BioProject 记录为用户提供一个单一位置，以查找为该项目生成的各种数据类型。该数据集在站内被归类为肿瘤 / 肺癌，主题标签为原始序列读长，说明其数据主体属于测序产生的原始读长类型。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”，表明其数据内容以原始序列读长为主。原始序列读长通常指高通量测序平台直接产出的碱基序列读取结果，是后续比对、定量和变异分析的基础数据形式。该 BioProject 记录本身并不一定包含所有分析后的衍生结果，而是作为项目数据的汇集入口，提供指向不同数据类型的链接。关于具体的样本数量、测序平台、读长长度、数据量大小、物种或细胞系信息、实验条件等细节，源站未提供。因此，该数据集在内容层面可确认的是其包含原始序列读长数据，并与靶向 CRTC2 逆转 STK11 突变 NSCLC 免疫治疗耐药这一研究主题相关。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI 的 BioProject 数据库，记录 ID 为 1445085。BioProject 作为生物数据集合，其记录通常来自单一组织或联合体，用于整合某一研究计划下产生的多种数据。该数据集的英文名称明确指向一项关于 CRTC2 靶向与 STK11 突变 NSCLC 免疫治疗耐药逆转的研究。关于具体的采集机构、样本来源、伦理审批信息、采集时间、地理地点等，源站未提供。该数据集在 NCBI BioProject 中的存在形式是一个项目记录，用户可通过该记录查找与该项目相关的数据链接。
【适用场景】
该数据集适用于与非小细胞肺癌免疫治疗耐药相关的研究场景，尤其是关注 STK11 突变以及 CRTC2 靶向干预的科研工作。由于主题标签为原始序列读长，该数据可用于转录组、基因组或其他测序相关的分析流程，例如差异表达分析、变异检测、融合基因鉴定等。对于研究肿瘤免疫微环境、免疫治疗响应机制以及耐药逆转策略的人员，该数据集可作为原始数据来源之一。此外，该数据集也可用于方法学验证、数据挖掘或作为公共数据资源进行整合分析。但具体适用的分析类型仍需结合项目实际产生的数据模态来判断，源站未提供更细化的说明。
【使用方法】
用户可通过 NCBI BioProject 数据库访问该记录，ID 为 1445085。BioProject 记录提供指向该项目所生成的不同数据类型的链接，用户可据此定位原始序列读长数据及其他相关数据。通常，原始序列读长数据可从 NCBI 的序列读取存档（SRA）等关联数据库下载，但该数据集具体关联哪些数据库、以何种格式提供、是否需要申请访问权限等，源站未提供。使用时应遵循 NCBI 及 BioProject 的通用数据使用规范，并引用对应的项目编号。对于原始序列读长的处理，一般需要经过质量控制、比对或组装等生物信息学步骤，具体流程取决于研究目的。
【质量与限制】
该数据集作为 BioProject 记录，其质量与限制取决于项目提交方提供的数据及元数据。源站描述仅说明 BioProject 是生物数据的集合，并未对该数据集的具体质量指标（如测序深度、覆盖度、重复性、批次效应等）作出说明。该数据集的主题标签为原始序列读长，意味着数据可能未经充分处理或注释，使用时需要自行进行质量评估和预处理。此外，关于样本量、对照组设置、实验重复次数等影响结论可靠性的关键信息，源站未提供。因此，在基于该数据集得出结论前，应结合原始数据的具体情况进行审慎评估。
【引用与许可】
该数据集的引用应遵循 NCBI BioProject 的通用引用规范，并注明项目 ID 1445085 及英文名称。关于该数据集的具体许可协议、使用限制、是否允许商业用途、是否需要联系数据提交者获取额外授权等信息，源站未提供。用户在使用该数据集时，应查阅 NCBI 网站上的相关政策和该 BioProject 记录页面，以获取最新的引用与许可要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1445085
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
携带STK11突变的非小细胞肺癌（NSCLC）患者对标准治疗抗PD-1/PD-L1阻断疗法具有耐药性。对于这一患者群体，目前尚无量身定制的治疗方案，凸显了发现有效治疗策略的迫切需求。在本研究中，我们剖析了STK11介导的免疫检查点阻断（ICB）耐药性的分子机制，并鉴定出CRTC2——转录因子CREB的共激活因子——是调控Stk11依赖性细胞外功能的关键信号节点。CRTC2缺失重塑了Stk11-KO肿瘤的免疫特征，并使其重新对抗PD-1治疗敏感，其敏感程度与Stk11功能正常的肿瘤相当。在机制上，阻断CRTC2与CREB之间的结合足以恢复对免疫治疗的敏感性。这些发现为理解CRTC2在调节ICB应答中的核心作用提供了关键见解，并表明破坏CRTC2-CREB相互作用是该患者群体的一种潜在新型治疗策略。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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