MDK调控SCLC与CAR-T细胞模型的转录组分析
数据围绕 MDK 调控下的小细胞肺癌（SCLC）与 CAR-T 细胞模型开展转录组分析，属于原始测序读段类型。可用于研究 MDK 对 SCLC 及 CAR-T 细胞转录谱的影响，支撑肿瘤分子机制与细胞治疗相关分析（来源 NCBI）
基本信息
资源简介
MDK调控SCLC与CAR-T细胞模型的转录组分析
该数据集为 PRJNA1441149: Transcriptomic Profiling of MDK-Modulated SCLC and CAR-T Cell Models，来源于 NCBI 的 BioProject 数据库，源站标题为 ID 1441149 - BioProject - NCBI。本站将其归类于肿瘤 / 肺癌方向。数据集围绕 MDK 调控下的小细胞肺癌（SCLC）与 CAR-T 细胞模型开展转录组分析，主题标签为原始测序读段（Raw sequence reads）。整体而言，该数据可用于研究 MDK 对 SCLC 及 CAR-T 细胞转录谱的影响，支撑肿瘤分子机制与细胞治疗相关分析。其记录形式属于 BioProject 类型，即围绕单一研究计划汇集多种类型生物学数据的项目条目，便于用户从一个入口查找该项目所产生的各类数据链接。
【数据集背景】
该数据集来自 NCBI 的 BioProject 数据库，源站标题为 ID 1441149 - BioProject - NCBI。BioProject 是围绕单一研究计划、由单一组织或联合体发起的一类生物学数据集合。一个 BioProject 记录为用户提供一个统一入口，用于查找该项目所产生的不同类型数据。本站将该数据集分类为肿瘤 / 肺癌。数据集英文名称为 PRJNA1441149: Transcriptomic Profiling of MDK-Modulated SCLC and CAR-T Cell Models，表明其研究主题涉及 MDK 调控下的小细胞肺癌与 CAR-T 细胞模型的转录组分析。
【数据内容】
该数据集的主题标签为 Raw sequence reads，即原始测序读段。数据围绕 MDK 调控下的小细胞肺癌（SCLC）与 CAR-T 细胞模型开展转录组分析。可用于研究 MDK 对 SCLC 及 CAR-T 细胞转录谱的影响，支撑肿瘤分子机制与细胞治疗相关分析。源站描述指出，BioProject 记录汇集了与单一研究计划相关的多种数据类型，并提供链接入口。除上述信息外，源站未提供关于样本数量、测序平台、读长、数据量、具体基因或通路结果等更细粒度的数据内容说明。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为 ID 1441149 - BioProject - NCBI。其记录形式为 BioProject，即由单一组织或联合体发起、围绕单一研究计划汇集的生物学数据集合。数据主题标签为原始测序读段。关于具体的样本采集地点、采集时间、组织来源、伦理审批信息、测序机构等，源站未提供。
【适用场景】
根据侧写线索，该数据集可用于研究 MDK 对 SCLC 及 CAR-T 细胞转录谱的影响，支撑肿瘤分子机制与细胞治疗相关分析。其数据类型为原始测序读段，适合需要从原始读段层面开展转录组分析的研究场景。关于更具体的适用场景，如特定疾病亚型、特定细胞模型或特定分析流程的适配性，源站未提供。
【使用方法】
该数据集以 BioProject 记录形式提供，用户可通过该记录查找该项目所产生的不同类型数据的链接。关于原始测序读段的下载方式、数据处理流程、推荐分析工具、参考基因组版本等具体使用方法，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为 BioProject 记录，提供统一入口以查找项目相关数据链接。关于数据质量评估指标、测序深度、覆盖度、批次效应、样本纳入排除标准等质量相关信息，源站未提供。关于数据使用中的限制条件，如是否涉及受控访问、是否包含人类受试者信息等，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为 ID 1441149 - BioProject - NCBI。关于具体的引用格式、许可条款、使用协议或数据共享政策，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1441149
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
为表征小细胞肺癌（SCLC）多种实验模型中的转录组改变，我们进行了RNA测序（RNA-seq）。具体而言，我们对以下样本进行了分析：(1) MDK敲低及对照RPM SCLC小鼠模型的肿瘤组织；(2) MDK敲低及阴性对照的人SCLC细胞系（NCI-H146/SHP-77）；(3) 与SHP-77细胞共培养后的sMDK-DLL3 CAR-T细胞及对照CAR-T细胞；(4) 非共培养条件下的sMDK-DLL3 CAR-T细胞及对照CAR-T细胞。使用TRIzol试剂提取总RNA，采用NEBNext Ultra RNA Library Prep Kit进行文库构建，并在Illumina NovaSeq 6000平台上以150 bp双端读长进行测序，以鉴定差异表达基因及生物学通路改变。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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