抗SPP1治疗小鼠肺癌模型肿瘤微环境重塑的单细胞转录组图谱
该数据集为 NCBI BioProject 收录的 PRJNA1435782，主题为抗 SPP1 治疗小鼠肺癌模型后肿瘤微环境重塑的单细胞转录组分析，主题标签为 Raw sequence reads
基本信息
资源简介
抗SPP1治疗小鼠肺癌模型肿瘤微环境重塑的单细胞转录组图谱
PRJNA1435782 是 NCBI BioProject 数据库收录的一个生物项目，全称为“Single-cell transcriptomic profiling of tumor microenvironment remodeling following anti-SPP1 therapy in a murine lung cancer model”。该项目聚焦于小鼠肺癌模型中抗 SPP1 治疗之后肿瘤微环境重塑过程，采用单细胞转录组分析手段进行研究。项目在 NCBI 源站的标题为“ID 1435782 - BioProject - NCBI”，本站将其归类于肿瘤 / 肺癌方向，主题标签为 Raw sequence reads，即原始序列读长数据。整体而言，该数据集为研究抗 SPP1 治疗对小鼠肺癌肿瘤微环境的影响提供了单细胞层面的转录组数据资源，属于肿瘤免疫治疗与微环境研究领域的基础数据集合。
【数据集背景】
BioProject 是 NCBI 提供的一种生物数据组织方式，用于汇集与某一项单一研究计划相关的各类生物数据。按照源站描述，一个 BioProject 通常源自单一机构或一个联合体，其记录为用户提供了一个统一入口，用以查找该项目所产生的多种数据类型。PRJNA1435782 正是在这一框架下建立的项目，其研究主题为抗 SPP1 治疗小鼠肺癌模型后肿瘤微环境重塑的单细胞转录组分析。该主题涉及肺癌治疗与肿瘤微环境两个相互关联的方向，属于肿瘤学研究中的常见议题。本站将其分类为肿瘤 / 肺癌，进一步明确了其所属的疾病领域。
【数据内容】
该数据集的主题标签为 Raw sequence reads，表明其数据内容以原始序列读长为主。项目全称中明确提到“Single-cell transcriptomic profiling”，即单细胞转录组分析，说明所生成的序列数据来源于单细胞转录组测序。研究关注的对象是抗 SPP1 治疗后小鼠肺癌模型中的肿瘤微环境重塑，因此数据应反映治疗前后或治疗条件下肿瘤微环境中不同细胞群体的转录组特征。关于具体的样本数量、测序平台、读长长度、数据量等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 NCBI 的 BioProject 数据库，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。源站标题显示为“ID 1435782 - BioProject - NCBI”，项目编号为 PRJNA1435782。根据源站描述，BioProject 记录汇集了与单一研究计划相关的生物数据，这些数据可能来自单一组织或联合体。关于该项目的具体提交机构、研究团队、样本采集地点、采集时间以及实验条件等信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肿瘤学与免疫治疗相关的研究场景，尤其是针对肺癌肿瘤微环境的研究。由于项目涉及抗 SPP1 治疗，可能适用于探讨 SPP1 在肿瘤微环境中的作用、治疗响应机制以及微环境细胞组成变化等方向。单细胞转录组数据通常可用于细胞类型鉴定、细胞状态分析、差异表达分析以及细胞间通讯推断等分析任务。此外，该数据集也可作为肺癌模型研究中的参考数据，用于比较不同治疗条件下的转录组特征。关于该数据集是否适用于其他特定分析流程或疾病模型，源站未提供。
【使用方法】
该数据集以 BioProject 形式组织，用户可通过 NCBI BioProject 数据库检索项目编号 PRJNA1435782 进行访问。BioProject 记录提供统一入口，用以链接该项目所产生的多种数据类型。由于主题标签为 Raw sequence reads，用户可能需要下载原始序列读长数据后，再进行后续处理与分析。关于具体的下载方式、数据格式、文件组织以及推荐的分析流程，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于 NCBI BioProject，属于公共数据库收录的项目。关于数据质量评估指标、测序深度、覆盖度、重复性以及潜在的技术偏差等信息，源站未提供。此外，该项目的样本量、生物学重复情况以及统计效力等也未见说明。用户在使用时应结合自身研究目的，对数据进行适当的质控与验证。关于该数据集是否存在已知限制或使用注意事项，源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可协议以及使用条款，源站未提供。用户在使用该数据集时，应参考 NCBI BioProject 数据库的通用使用政策以及项目页面中可能列出的引用要求。关于是否需要获得额外授权或是否允许商业用途，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1435782
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本研究呈现了来自小鼠Lewis肺癌(LLC)皮下肿瘤模型的单细胞RNA测序数据，旨在探究抗SPP1（骨桥蛋白）抗体治疗的免疫调节效应。荷瘤C57BL/6J小鼠随机分配至对照组（PBS）和抗SPP1治疗组。在实验终点收集肿瘤，并分离肿瘤浸润免疫细胞，用于基于液滴的单细胞转录组分析。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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