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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA1435204：脉冲电场消融重编程非小细胞肺癌患者肿瘤免疫并刺激三级淋巴结构生发中心形成

该数据集对应 NCBI BioProject 编号 1435204，英文标题为“Pulsed Electric Field Ablation Reprograms Tumor Immunity and Stimulates Germinal Center Formation in Tertiary Lymphoid Structures in Patients with Non-Small Lung Cancer”，中文可理解为围绕脉冲电场消融重编程肿瘤免疫并刺激非小细胞肺癌患者三级淋巴结构生发中心形成这一研究方向所建立的生物项目。其来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题标注为“ID 1435204 - BioProject - NCBI”，本站分类归入肿瘤 / 肺癌方向，主题标签为“Raw sequence reads”。整体来看，该数据集属于 NCBI BioProject 体系下与肺癌免疫治疗机制相关的原始测序读长数据集合，面向非小细胞肺癌患者中脉冲电场消融后免疫微环境变化及三级淋巴结构生发中心形成的研究主题。

【数据集背景】

该数据集以 BioProject 形式组织，编号为 1435204，来源于 NCBI。BioProject 是围绕某一项单一研究计划或倡议而汇集的一组生物数据，通常由单一机构或联合体发起。BioProject 记录为用户提供一个统一入口，用以查找该项目所产生的多种数据类型。该项目的主题聚焦于脉冲电场消融对肿瘤免疫的重编程作用，以及其对非小细胞肺癌患者三级淋巴结构中生发中心形成的刺激效应。本站将其归入肿瘤 / 肺癌分类，说明其研究背景与肺癌这一恶性肿瘤方向直接相关。主题标签为“Raw sequence reads”，表明该项目涉及原始测序读长数据。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”，即原始序列读长。源站描述指出，BioProject 记录提供用户查找该项目所生成多种数据类型的统一入口，因此该数据集在内容层面属于与单一研究计划相关的生物数据集合，具体数据类型以原始测序读长为核心标签。关于样本数量、测序平台、读长长度、覆盖深度、数据总量、文件格式等具体指标，源站未提供。关于是否包含表达谱、免疫组库、空间转录组或其他衍生分析结果，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI，源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“ID 1435204 - BioProject - NCBI”。其英文标题表明研究涉及非小细胞肺癌患者，并围绕脉冲电场消融、肿瘤免疫重编程、三级淋巴结构及生发中心形成等主题展开。BioProject 作为数据组织方式，通常由单一机构或联合体发起，用于汇集与某一研究计划相关的生物数据。关于具体采样地点、采样时间、患者数量、伦理审批信息、机构名称及联合体构成，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与非小细胞肺癌免疫治疗机制相关的研究场景，尤其是围绕脉冲电场消融后肿瘤免疫重编程、三级淋巴结构形成及生发中心反应等方向的分析。由于主题标签为“Raw sequence reads”，其原始测序读长可用于后续生物信息学处理，例如序列比对、表达定量、免疫相关基因分析或免疫组库探索等通用用途。该数据集也可作为 BioProject 体系下的入口，用于查找同一研究计划所生成的其他数据类型。关于具体适用的分析流程、疾病分期、治疗队列或临床终点，源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过 NCBI BioProject 记录进行访问，用户可借助 BioProject 编号 1435204 在 NCBI 站点中定位该项目，并通过记录所提供的链接查找该项目生成的多种数据类型。由于主题标签为“Raw sequence reads”，使用者通常需要下载原始测序读长后，依据具体研究目的开展质量控制、比对、定量或免疫相关分析。关于下载方式、文件命名规则、参考基因组版本、分析软件推荐及数据处理步骤，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集以 BioProject 形式组织，来源为 NCBI，具备统一的项目记录入口。其主题标签为“Raw sequence reads”，说明数据以原始测序读长为主。关于数据质量评分、污染控制、批次效应、样本重复数、测序深度、覆盖均一性及缺失值情况，源站未提供。由于源站描述仅对 BioProject 作通用说明，未给出该项目的具体质控指标，因此无法依据现有信息判断其数据质量水平。使用者在开展分析前应自行进行质量控制与评估。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“ID 1435204 - BioProject - NCBI”。关于该数据集的引用格式、文献出处、作者列表、发表期刊、DOI、数据许可协议及使用限制，源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集时，应访问 NCBI BioProject 记录页面，以获取最新的引用与许可信息。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE325414

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使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1435204

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

目的：这项治疗与切除临床研究评估了一种特殊形式的脉冲电场（PEF）消融在早期非小细胞肺癌（NSCLC）中调节抗肿瘤免疫的潜力。三级淋巴结构（TLS）是淋巴聚集物，能将免疫细胞招募到肿瘤微环境（TME）中，并作为免疫生成区域发挥作用。在大多数癌症中，伴有生发中心（GC）的TLS具有强大的预后价值，并能促进肿瘤控制和对免疫治疗的反应，但目前尚无市售疗法能诱导其形成。Aliya系统是一种专有的电外科技术，可向组织输送微秒级电脉冲，在保持基质结构的同时实现肿瘤清除。患者与方法：治疗组患者在诊断性活检后立即接受消融，对照组仅接受活检。本文报告了探索性终点，即对两组患者采集的血液和肿瘤样本中的免疫调节进行检测。结果：组织病理学评估显示，切除的肿瘤中存在伴有GC的TLS。

组织细胞因子评估和单细胞RNA测序显示，消融肿瘤与消融前活检相比，能够招募和组织TLS相关淋巴细胞的细胞因子（包括CXCL13）上调，且GC相关免疫细胞群（包括类别转换记忆B细胞和浆细胞）显著增加。消融组患者含有伴GC的TLS的肿瘤比例更高（47%），而对照组为24%。消融组患者表现出增强的全身免疫，血清HMGB1和循环细胞毒性T细胞增加。结论：这种特殊的PEF可能协调多种同时发生的变化，促进免疫活性更强的TME，并代表了一种改善NSCLC患者免疫治疗方案反应的新方法。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别