JAK抑制剂通过保护肠道干细胞缓解EGFR抑制剂诱导的腹泻
该数据集来自 NCBI BioProject(ID 1427952),主题为 JAK 抑制剂通过保护肠道干细胞免受适应性免疫加剧的损伤,从而缓解 EGFR 抑制剂诱导的腹泻

基本信息
资源简介
JAK抑制剂通过保护肠道干细胞缓解EGFR抑制剂诱导的腹泻
PRJNA1427952 是 NCBI BioProject 数据库中的一项生物项目记录,其英文名称为“JAK inhibitors alleviate EGFR-inhibitor-induced diarrhoea by protecting intestinal stem cells from adaptive-immune-exacerbated injury”。该数据集在本站被归类于肿瘤 / 肺癌方向,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。从主题标签来看,该数据集属于原始序列读段(Raw sequence reads)类型。整体而言,该数据集围绕 JAK 抑制剂、EGFR 抑制剂诱导的腹泻、肠道干细胞保护以及适应性免疫加剧的损伤等核心主题展开,旨在为相关研究提供可公开获取的原始测序数据资源。作为 BioProject 记录,它为用户提供了一个集中入口,以便查找该项目所产生的多种数据类型及其相关链接。
【数据集背景】
该数据集来自 NCBI BioProject,项目 ID 为 1427952。BioProject 是 NCBI 提供的一种记录形式,用于汇集与某一项单一研究计划相关的生物数据,这些数据通常来源于一个机构或一个联合体。BioProject 记录的核心作用是为用户提供一个统一的位置,以便找到该项目所生成的各种数据类型。该项目的标题明确指向一个具体的研究主题:JAK 抑制剂通过保护肠道干细胞免受适应性免疫加剧的损伤,从而缓解 EGFR 抑制剂诱导的腹泻。这一主题涉及肿瘤治疗中的不良反应管理、肠道干细胞保护以及免疫调节等多个相互关联的生物学问题。本站将其归入肿瘤 / 肺癌分类,说明该数据集可能与肿瘤治疗场景下的腹泻并发症研究有关,尤其是与 EGFR 抑制剂相关的毒性反应。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”,表明其数据内容以原始序列读段为主。原始序列读段通常来自高通量测序平台,是后续数据分析的基础。在该项目背景下,这些原始读段可能用于研究 JAK 抑制剂对肠道干细胞的影响、适应性免疫在 EGFR 抑制剂诱导腹泻中的作用,以及相关基因表达或调控变化。然而,关于具体的样本数量、测序平台、读段长度、数据量大小、文件格式等详细信息,源站未提供。因此,无法进一步描述该数据集所包含的精确数据组成或规模。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,即美国国家生物技术信息中心(NCBI)的官方网站。它作为 BioProject 记录存在,项目 ID 为 1427952。BioProject 本身是一个元数据记录,用于汇集来自单一研究计划或联合体的生物数据。该项目的英文名称已经指明了其研究主题,但关于样本采集的具体方法、实验设计、时间地点、伦理审批信息等,源站未提供。因此,无法得知该数据集在采集过程中的具体细节。
【适用场景】
基于该数据集的主题标签和标题,它可能适用于以下研究方向:肿瘤治疗中 EGFR 抑制剂诱导腹泻的机制研究、JAK 抑制剂对肠道干细胞的保护作用、适应性免疫在肠道损伤中的角色、以及相关信号通路的探索。由于数据内容为原始序列读段,它可能被用于转录组分析、基因表达差异分析或其他高通量测序数据分析。本站将其分类为肿瘤 / 肺癌,因此也可能适用于肺癌治疗相关不良反应的研究。但需要注意的是,具体适用场景需结合项目实际产生的数据和分析目的来判断,源站未提供更详细的适用说明。
【使用方法】
作为 NCBI BioProject 记录,用户可以通过访问 NCBI 网站并检索项目 ID 1427952 来获取该项目的相关信息。BioProject 记录通常提供指向该项目所产生的不同数据类型的链接,用户可以通过这些链接访问原始序列读段或其他相关数据。然而,关于具体的数据下载方式、分析工具、处理流程或使用协议,源站未提供。因此,无法给出更详细的操作步骤或技术建议。
【质量与限制】
该数据集来源于 NCBI BioProject,属于公共数据库中的记录。BioProject 作为元数据集合,其本身并不直接保证所链接数据的质量或完整性。关于该项目的具体质量控制指标、数据验证状态、可能的偏差或限制,源站未提供。此外,由于该记录仅包含标题、主题标签和基本描述,缺乏对样本、实验和数据的详细说明,因此在使用时需谨慎评估其适用性。任何分析都应基于实际获取的原始数据及其配套的元数据。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可协议或使用条款,源站未提供。用户在使用时应参考 NCBI 网站上的通用引用指南和许可政策,并尊重数据提供者的权益。由于缺乏具体的引用信息,无法给出针对该项目的正式引用格式或授权说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1427952
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
表皮生长因子受体(EGFR)抑制剂(EGFRi)是靶向肿瘤治疗的一个里程碑,其中阿法替尼等酪氨酸激酶抑制剂(TKIs)在非小细胞肺癌及其他实体瘤中显示出强效。然而,其临床应用常因胃肠道毒性——尤其是严重腹泻,影响高达75%的患者——而受限,这往往导致治疗中断或减量,并损害抗肿瘤获益。目前的管理主要依赖经验性对症处理,缺乏机制导向的靶向干预。因此,亟需理解EGFRi所致肠道损伤的发病基础。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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