PRJNA1417012:LGG抑制非小细胞肺癌并缓解吉非替尼副作用宏基因组

该数据集来自 NCBI BioProject(ID 1417012),主题为 LGG 抑制非小细胞肺癌并缓解吉非替尼副作用相关的宏基因组数据,数据类型为原始测序读段(Raw sequence reads)

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基因组分类Raw sequence reads
PRJNA1417012: LGG inhibits non-small cell lung cancer and alleviates the side effects of gefitinib_metagenome

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJNA1417012:LGG抑制非小细胞肺癌并缓解吉非替尼副作用宏基因组

该数据集为 NCBI BioProject 收录的宏基因组项目,编号 1417012,英文名称为 PRJNA1417012: LGG inhibits non-small cell lung cancer and alleviates the side effects of gefitinib_metagenome。其研究主题围绕 LGG 抑制非小细胞肺癌并缓解吉非替尼副作用展开,数据类型为原始测序读段(Raw sequence reads)。在分类上,该数据集归属于肿瘤 / 肺癌方向,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。BioProject 作为生物数据的集合,通常围绕单一研究计划组织,来源于单一机构或联合体,并为用户提供统一入口以查找该项目产生的多种数据类型。该数据集即属于此类项目记录,可供相关领域研究者检索与使用。

【数据集背景】

该数据集来自 NCBI BioProject,项目编号为 1417012。其标题表明研究关注 LGG 在非小细胞肺癌中的作用,以及其与吉非替尼副作用之间的关系。非小细胞肺癌是肺癌的主要类型之一,吉非替尼是相关治疗中涉及的药物。该数据集以宏基因组为研究对象,主题标签为 Raw sequence reads,说明其数据形态为原始测序读段。BioProject 记录本身旨在为同一研究计划下产生的多样数据类型提供统一查找入口,因此该数据集可视为该研究计划所产出的组学数据集合之一。关于该研究的具体实验设计、样本数量、分组方式、测序平台及分析目标,源站未提供。

【数据内容】

该数据集的数据类型为原始测序读段(Raw sequence reads),属于宏基因组数据。主题标签同样标注为 Raw sequence reads,表明数据以测序读段形式存在。宏基因组数据通常用于分析特定环境或样本中微生物群落的组成与功能,但该数据集具体覆盖的样本类型、测序区域、读长、数据量及文件格式等细节,源站未提供。该数据集与 LGG 抑制非小细胞肺癌并缓解吉非替尼副作用这一研究主题相关,但其具体包含的生物学重复、时间点或处理条件等信息,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI BioProject 数据库中的一条项目记录,项目编号为 1417012。BioProject 记录通常来源于单一机构或联合体,用于汇集与某一研究计划相关的生物数据。该数据集的分类为肿瘤 / 肺癌,主题标签为 Raw sequence reads。关于样本采集地点、采集时间、受试者或模型信息、伦理审批信息以及具体提交机构等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与非小细胞肺癌、吉非替尼副作用以及 LGG 相关研究有关的宏基因组分析场景。由于数据类型为原始测序读段,可用于宏基因组组装、物种注释、功能注释或群落结构比较等通用分析流程。该数据集也可作为 BioProject 记录,用于检索同一研究计划下可能关联的其他数据类型。然而,其具体适用的分析目标、可支持的统计比较以及是否适合临床转化研究等,需结合源站提供的完整项目信息判断,源站未提供进一步说明。

【使用方法】

该数据集可通过 NCBI BioProject 数据库访问,项目编号为 1417012。用户可在 NCBI 网站中检索该编号,以获取该项目的记录页面,并进一步查找与该研究计划相关的数据链接。由于数据类型为原始测序读段,常规使用方式包括下载读段文件后进行质量控制、比对或组装等宏基因组分析步骤。关于具体的下载方式、文件命名规则、数据量大小以及是否提供预处理数据等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 BioProject 记录,其描述强调 BioProject 作为生物数据集合的功能,即围绕单一研究计划汇集多样数据类型。该数据集的主题标签为 Raw sequence reads,说明其提供的是原始测序读段,通常需要使用者自行进行质量控制与后续处理。关于该数据集的数据质量指标、测序深度、覆盖度、污染评估、批次效应以及样本量是否充分等,源站未提供。此外,该数据集的具体研究结论、统计显著性及可重复性等信息,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来自 NCBI BioProject,项目编号为 1417012,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于该数据集的引用方式、许可协议、使用限制以及是否允许商业用途等,源站未提供。使用者应参考 NCBI BioProject 页面及相关数据提交方的说明,以获取准确的引用与许可信息。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1417012

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

LGG inhibits non-small cell lung cancer and alleviates the side effects of gefitinib_metagenome

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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