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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

LGG抑制非小细胞肺癌并缓解吉非替尼副作用_肝脏RNAseq

该数据集对应 NCBI BioProject 编号 1417010，英文名称为 PRJNA1417010: LGG inhibits non-small cell lung cancer and alleviates the side effects of gefitinib_liver_RNAseq。从名称可以看出，其研究主题围绕 LGG 对非小细胞肺癌的抑制作用，以及 LGG 在缓解吉非替尼副作用方面的潜在作用，并专门包含肝脏组织的 RNAseq 数据。该数据集在分类上归属于肿瘤 / 肺癌方向，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，主题标签为 Raw sequence reads，说明其核心数据形式为原始序列读段。BioProject 作为生物数据集合，旨在将同一项研究计划产生的多种数据类型集中关联，便于用户在一个记录中查找和访问相关数据。该数据集因此可作为肺癌治疗与药物副作用研究领域的一项组学资源。

【数据集背景】

该数据集来自 NCBI BioProject，编号为 1417010。BioProject 是围绕单一研究计划或倡议组织的生物数据集合，通常来源于单一机构或联盟。BioProject 记录为用户提供一个统一入口，用于查找该项目产生的不同类型数据。该数据集的标题表明其研究关注 LGG 对非小细胞肺癌的抑制作用，以及 LGG 对吉非替尼副作用的缓解效果。研究同时涉及肝脏 RNAseq，提示肝脏可能是评估吉非替尼副作用或 LGG 干预效果的重要组织。本站将其归类为肿瘤 / 肺癌，主题标签为 Raw sequence reads，说明该资源主要提供原始测序读段层面的数据。

【数据内容】

该数据集的核心内容为肝脏 RNAseq 的原始序列读段，主题标签明确标注为 Raw sequence reads。数据与 LGG 抑制非小细胞肺癌并缓解吉非替尼副作用这一研究主题相关。由于是 RNAseq 原始读段，数据可用于后续转录组分析，例如基因表达定量、差异表达分析、可变剪接分析以及通路富集等。该 BioProject 记录本身提供指向项目所生成多种数据类型的链接，但具体样本数量、测序平台、读长、文件大小、基因表达矩阵或分析结果等细节，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为 ID 1417010 - BioProject - NCBI。BioProject 记录通常由单一组织或联盟发起，用于汇集与同一研究计划相关的生物数据。该数据集的具体提交机构、研究团队、样本采集地点、实验动物或细胞模型信息、伦理审批信息以及测序服务提供方等，源站未提供。数据以原始序列读段形式存在，属于 NCBI BioProject 体系下的组学数据资源。

【适用场景】

该数据集适用于与非小细胞肺癌治疗、吉非替尼副作用以及 LGG 干预效果相关的转录组研究。由于包含肝脏 RNAseq 原始读段，可用于探索肝脏组织在吉非替尼处理及 LGG 联合干预下的基因表达变化。潜在应用包括差异表达分析、通路富集分析、药物副作用机制研究以及肺癌治疗辅助策略的探索。该数据也可作为公共组学资源，用于方法学比较、数据挖掘或与其他肺癌相关数据集的整合分析。具体适用性需结合研究设计和样本信息判断，而这些信息源站未提供。

【使用方法】

使用者可通过 NCBI BioProject 记录 ID 1417010 访问该数据集，并依据 BioProject 提供的链接查找项目所生成的不同数据类型。由于主题标签为 Raw sequence reads，使用流程通常包括下载原始测序读段，进行质量控制、比对或定量，然后开展下游转录组分析。具体下载方式、文件格式、参考基因组版本、分析工具和参数设置等，源站未提供。使用者应根据自身研究目的选择适当的生物信息学流程，并注意原始读段通常需要经过预处理才能用于表达分析。

【质量与限制】

该数据集以 BioProject 记录形式提供，具体数据质量指标、测序深度、重复数量、批次信息、污染评估及质控结果等，源站未提供。由于仅标注为 Raw sequence reads，使用者需自行完成质控和预处理。该数据集的限制还包括：样本来源、实验设计、统计方法和生物学重复等关键信息未在给定内容中说明，因此无法评估其统计效力或结论稳健性。此外，该数据集仅涉及肝脏 RNAseq，不能代表其他组织或全身效应。使用时应结合原始项目中的完整实验描述进行判断。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为 ID 1417010 - BioProject - NCBI。关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款以及是否允许再分发等，源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集时，应访问 NCBI BioProject 记录页面，查看项目提交者提供的引用要求、数据使用政策及许可信息。若源站未明确说明许可，应遵循 NCBI 通用数据使用政策并尊重原始提交者的权益。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJNA1417010

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1417010

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

LGG inhibits non-small cell lung cancer and alleviates the side effects of gefitinib_liver_RNAseq

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别