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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA1417009：LGG抑制非小细胞肺癌并缓解吉非替尼副作用_肾脏RNAseq

PRJNA1417009 是一个收录于 NCBI BioProject 数据库的生物项目数据集，其英文全称为“LGG inhibits non-small cell lung cancer and alleviates the side effects of gefitinib_kidney_RNAseq”。该数据集围绕 LGG 抑制非小细胞肺癌并缓解吉非替尼副作用这一研究方向，提供了肾脏组织的 RNA 测序数据。从数据分类来看，它归属于肿瘤 / 肺癌领域，数据类型为原始序列读长（Raw sequence reads）。BioProject 作为生物数据的集合记录，旨在将同一项目产生的多种数据类型链接到统一入口，便于用户查找和获取。该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，为研究 LGG 与吉非替尼联合作用下的肾脏转录组变化提供了原始测序数据基础。

【数据集背景】

该数据集对应的 BioProject 编号为 1417009，其标题明确指向一项关于 LGG 抑制非小细胞肺癌并缓解吉非替尼副作用的研究。非小细胞肺癌是肺癌的主要亚型之一，吉非替尼作为靶向治疗药物在临床应用中可能伴随副作用，而 LGG 在该研究背景下被探索是否具有抑制肿瘤并减轻药物副作用的作用。该 BioProject 记录将这一研究倡议相关的生物数据集中呈现，使用户能够通过单一入口找到该项目产生的各类数据。数据集的分类标签为肿瘤 / 肺癌，主题标签为原始序列读长，说明其核心数据形式是测序仪直接产出的短序列读取。肾脏 RNAseq 则提示该数据聚焦于肾脏组织的转录组测序，可能与评估吉非替尼对肾脏的影响以及 LGG 的缓解作用相关。

【数据内容】

该数据集包含的数据类型为原始序列读长（Raw sequence reads），即 RNA 测序产生的原始序列数据。这些读长来源于肾脏组织的 RNAseq 实验，属于该项目中肾脏相关转录组分析的一部分。BioProject 记录本身并不直接展示所有测序读长，而是提供指向不同数据类型的链接，用户可通过该记录访问原始序列读长数据。数据主题围绕 LGG 抑制非小细胞肺癌并缓解吉非替尼副作用这一研究方向，肾脏 RNAseq 数据可用于分析该干预条件下肾脏基因表达的变化。除原始序列读长外，源站未提供关于数据具体文件格式、读长长度、测序深度、样本数量等更详细的信息。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI BioProject 数据库中的一条记录，项目 ID 为 1417009。BioProject 是由单一组织或联盟发起的、与某一研究倡议相关的生物数据集合，其记录为用户提供查找该项目所产生多种数据类型的统一入口。该数据集的具体提交机构、样本采集地点、采集时间、实验操作流程等信息，源站未提供。数据主题标签为原始序列读长，表明其数据来源于高通量测序产生的原始读长。该 BioProject 的标题和分类信息表明其与肿瘤 / 肺癌研究相关，并涉及肾脏 RNAseq 数据。

【适用场景】

该数据集适用于与非小细胞肺癌治疗及药物副作用相关的转录组研究。具体而言，研究人员可利用肾脏 RNAseq 原始序列读长，分析在 LGG 干预以及吉非替尼处理条件下肾脏组织的基因表达变化，探索 LGG 缓解吉非替尼副作用的潜在机制。此外，该数据也可用于比较不同处理组之间肾脏转录组的差异，或作为相关领域研究的公共数据资源进行整合分析。由于数据类型为原始序列读长，适合具备 RNAseq 数据分析能力的用户进行重新比对、定量和差异表达分析。该数据集属于肿瘤 / 肺癌分类，也可为肺癌靶向治疗副作用管理的研究提供参考。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 数据库访问该数据集，项目 ID 为 1417009。BioProject 记录提供指向该项目所产生不同数据类型的链接，用户可据此获取原始序列读长数据。获取数据后，通常需要经过质量控制、比对到参考基因组、转录本定量和差异表达分析等标准 RNAseq 数据处理流程。由于该数据集为肾脏 RNAseq 原始读长，分析时应关注肾脏组织特异性表达以及实验处理条件。具体的数据下载方式、使用的测序平台、参考基因组版本、分析工具等信息，源站未提供，用户需结合原始数据附带的元数据自行判断。

【质量与限制】

该数据集为 NCBI BioProject 收录的原始序列读长数据，其质量取决于原始测序实验和提交数据的完整性。源站未提供关于数据质量评分、测序深度、读长质量分布、样本重复数等具体质量指标。此外，该 BioProject 记录本身仅提供数据链接和项目描述，不包含完整的实验方法、样本信息和分析结果。用户在使用时需注意，该数据集仅涵盖肾脏 RNAseq 数据，不能代表该研究项目中所有组织或所有数据类型。关于数据的具体限制、使用约束以及是否存在批次效应等信息，源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI BioProject 数据库记录。关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款以及是否允许商业用途等信息，源站未提供。用户在使用该数据集时，应遵循 NCBI 数据库的一般使用政策，并建议查阅 BioProject 记录页面以获取最新的引用和许可信息。由于源站未提供具体的引用格式或授权说明，无法在此给出确切的引用要求或许可类型。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJNA1417009

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使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1417009

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

LGG inhibits non-small cell lung cancer and alleviates the side effects of gefitinib_kidney_RNAseq

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别