基本信息

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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

ALK阳性转移性非小细胞肺癌阿来替尼治疗中出现多变异KRAS嵌合病例报告

该数据集对应 NCBI BioProject 编号 1416035，标题为“Emergence of KRAS mosaicism with multiple variants during treatment with ALECTINIB in ALK positive metastatic non-small cell lung cancer: a case report”。从标题可以看出，这是一项围绕 ALK 阳性转移性非小细胞肺癌病例的报告，关注患者在 ALECTINIB 治疗过程中出现携带多种变异的 KRAS 嵌合现象。数据集在站内归入肿瘤 / 肺癌分类，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，主题标签为“Raw sequence reads”。整体而言，该数据集属于 NCBI BioProject 体系下的一个项目记录，用于汇集与上述病例报告相关的生物学数据，便于用户从单一入口查找该项目产生的多种数据类型。

【数据集背景】

BioProject 是 NCBI 提供的一种项目组织方式，用于汇集与某一项研究计划相关的生物学数据。按照源站描述，一个 BioProject 可以来自单一机构或联盟，其记录为用户提供单一入口，以查找该项目所产生的不同数据类型。本数据集即对应 BioProject ID 1416035，其研究背景聚焦于 ALK 阳性转移性非小细胞肺癌。标题明确指出，该病例报告描述的是患者在接受 ALECTINIB 治疗期间，出现携带多种变异的 KRAS 嵌合现象。这一背景将数据集置于肿瘤学、肺癌靶向治疗及耐药或克隆演化相关研究的语境中。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”，说明其涉及的数据类型为原始序列读长。标题中提及 KRAS 嵌合现象及多种变异，表明项目可能围绕相关样本的测序数据展开。除“Raw sequence reads”这一主题标签外，关于具体样本数量、测序平台、读长长度、数据量、变异位点列表等信息，源站未提供。该 BioProject 记录本身作为项目入口，可能链接到多种数据类型，但当前可确认的内容仅限于上述标题、分类与主题标签所反映的范围。

【采集与来源】

数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，项目编号为 1416035。源站描述说明 BioProject 记录来自单一机构或联盟，并汇集与单一研究计划相关的生物学数据。关于本项目的具体提交机构、样本采集地点、患者来源、采集时间、伦理审批信息以及测序机构等，源站未提供。因此，无法进一步说明样本如何采集、在何处测序或由哪个团队提交。

【适用场景】

基于标题与主题标签，该数据集适用于与 ALK 阳性转移性非小细胞肺癌相关的病例研究场景，尤其是关注 ALECTINIB 治疗过程中 KRAS 嵌合及多种变异出现的分析。由于主题标签为“Raw sequence reads”，它也可能用于需要原始测序读长的分析流程，例如变异识别、嵌合现象探索或病例层面的序列数据复核。需要强调的是，该数据集为病例报告相关项目，并非大规模队列研究；其适用场景应围绕单病例或小规模样本的探索性分析，而不应外推为群体层面的结论。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 记录 ID 1416035 访问该项目，并利用 BioProject 提供的单一入口查找其链接的不同数据类型。由于主题标签为“Raw sequence reads”，使用时可关注原始序列读长相关数据。关于具体下载方式、数据格式、是否需专用工具、是否有配套分析流程或参考基因组信息，源站未提供。因此，实际使用时应以 NCBI BioProject 页面所展示的链接和说明为准，本描述无法补充未给出的操作细节。

【质量与限制】

该数据集为病例报告相关项目，标题明确指向单一病例情境，因此其结论和数据的代表性有限，不能直接视为普遍性结论。主题标签仅标明“Raw sequence reads”，关于数据质量指标、覆盖度、重复性、对照设置、批次效应、污染评估等信息，源站未提供。此外，BioProject 记录本身是项目汇集入口，具体数据质量取决于其链接的子项和原始数据，而当前信息不足以评估这些方面。使用时应充分注意病例报告的性质及数据范围的局限性。

【引用与许可】

该数据集的源站标题为“ID 1416035 - BioProject - NCBI”，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于引用格式、许可条款、使用限制、是否允许再分发或商业使用等信息，源站未提供。用户在使用该数据集时，应直接查阅 NCBI BioProject 页面及相关数据记录所附的引用与许可说明，以确认合规的使用方式。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJNA1416035

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1416035

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

ALK融合见于3%至6%的肺癌中，可使肿瘤对ALK抑制剂（ALK-酪氨酸激酶抑制剂）敏感。然而，获得性耐药不可避免地通过多种机制产生，从而限制了治疗反应的持久性。我们报告一例36岁男性ALK重排肺腺癌患者，接受第二代ALK酪氨酸激酶抑制剂阿来替尼治疗。在疾病进展时，分子分析显示出现了KRAS嵌合现象。本报告详细描述了该肿瘤从初诊到治疗失败的分子演变过程。它阐明了一种引人注目的ALK抑制耐药机制，该机制由多个KRAS变异同步出现所驱动。尽管既往病例报告曾记载孤立的KRAS突变是ALK TKI治疗的潜在耐药机制，但这是首例记录在阿来替尼治疗失败时出现如此广泛KRAS嵌合现象的病例。

它强调了在疾病进展时重新评估癌症分子特征的重要性，以准确界定耐药途径并制定能够克服这种耐药性的合理治疗策略。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别