基本信息

模态

基因组

任务类型

预测

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA1414107：肠道菌群促进肿瘤进展

PRJNA1414107 是一个以“Gut microbiota promotes tumor progression”为主题的生物项目记录，归属于肿瘤 / 肺癌分类，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。该记录在源站以 BioProject 形式呈现，标题标识为 ID 1414107 - BioProject - NCBI。BioProject 是围绕单一研究计划汇集生物数据的记录形式，这些数据由单一机构或联盟发起，并为用户提供统一入口，以链接到该项目所产生的不同数据类型。该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”，表明其关联的数据类型涉及原始序列读长。整体而言，该记录为查找和访问与“肠道微生物群促进肿瘤进展”这一研究计划相关的生物数据提供了集中入口，适合关注肿瘤、肺癌以及微生物与肿瘤进展关系的用户进一步查阅。

【数据集背景】

该数据集对应的是一项名为“Gut microbiota promotes tumor progression”的生物项目，源站标题为“ID 1414107 - BioProject - NCBI”。从分类上看，它被归入肿瘤 / 肺癌方向。BioProject 的设计目的，是围绕一个单一研究计划，汇集由单一机构或联盟产生的多种类型生物数据，并为用户提供一个统一的位置，以便找到该项目所生成的不同数据类型的链接。因此，该记录本身并非单一实验的原始数据文件，而是一个项目级入口，用于组织和关联同一研究计划下的数据资源。其主题标签为“Raw sequence reads”，说明该项目涉及原始序列读长的数据内容。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”，即原始序列读长。源站描述指出，BioProject 记录提供用户一个单一位置，以找到该项目生成的不同数据类型的链接。因此，该记录所涵盖的数据内容应以原始序列读长为核心，并通过项目入口链接到不同数据类型。除上述信息外，关于具体样本数量、测序平台、读长长度、数据量、文件格式等细节，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“ID 1414107 - BioProject - NCBI”。BioProject 记录来源于单一机构或联盟发起的单一研究计划。该项目的英文名称为“PRJNA1414107: Gut microbiota promotes tumor progression”。关于具体采样地点、样本类型、采集时间、机构名称、联盟成员等采集与来源细节，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于围绕“肠道微生物群促进肿瘤进展”这一研究计划进行数据查找与关联访问。由于其为 BioProject 记录，用户可通过该统一入口定位到该项目生成的不同数据类型，尤其是与“Raw sequence reads”相关的原始序列读长数据。其分类为肿瘤 / 肺癌，因此适合关注肿瘤学、肺癌以及微生物群与肿瘤进展关系的用户参考。关于更具体的适用分析场景、研究设计用途或临床用途，源站未提供。

【使用方法】

用户可通过 ncbi.nlm.nih.gov 上的 BioProject 记录“ID 1414107 - BioProject - NCBI”访问该数据集。该记录提供统一入口，链接到该项目生成的不同数据类型。主题标签“Raw sequence reads”提示用户可关注原始序列读长相关数据。关于具体的下载方式、数据访问权限、分析流程、软件工具或操作步骤，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 BioProject 项目级记录，其描述强调汇集单一研究计划下的多种数据类型并提供统一入口。关于数据质量指标、测序质量、覆盖度、污染控制、批次效应、样本量、统计效力等具体质量信息，源站未提供。由于源站描述为通用性说明，未给出该项目的具体技术细节，因此在使用时需注意其作为项目入口的性质，而非直接可分析的完整数据包。其他限制信息源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“ID 1414107 - BioProject - NCBI”。关于引用格式、许可协议、使用条款、数据共享政策或授权要求，源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJNA1414107

访问原始数据

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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1414107

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

为了确定肠道微生物群的改变是否与肺癌相关，我们收集了肺癌患者和健康个体的粪便样本。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别