PRJNA1414070：肺癌转录组学展示 mPTP 对铁死亡的影响
该数据集为 NCBI BioProject 编号 1414070 的肺癌转录组学项目，主题为 mPTP 对铁死亡的影响，数据以原始序列读段（Raw sequence reads）形式提供
基本信息
资源简介
PRJNA1414070：肺癌转录组学展示 mPTP 对铁死亡的影响
该数据集为 NCBI BioProject 编号 1414070 的肺癌转录组学项目，主题为 mPTP 对铁死亡的影响，数据以原始序列读段（Raw sequence reads）形式提供。项目英文名称为“PRJNA1414070: Transcriptomics of lung cancer illustrating mPTP impact on ferroptosis”，源站标题为“ID 1414070 - BioProject - NCBI”，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，本站分类归入肿瘤 / 肺癌。BioProject 是围绕单一研究计划汇集生物数据的记录，这些数据来自单一机构或联合体，记录本身为用户提供统一入口，以便找到该项目所产生的多种数据类型。该数据集聚焦肺癌转录组学，围绕 mPTP 对铁死亡的影响这一主题，提供原始序列读段，可供后续转录组分析与铁死亡相关机制研究使用。
【数据集背景】
该数据集来源于 NCBI BioProject 数据库，编号为 1414070。BioProject 作为生物数据集合，通常围绕一个单一的研究计划组织，其数据可能来自一个机构或一个联合体。BioProject 记录的作用是提供一个统一的位置，让用户能够找到与该项目相关的多种数据类型。该项目的英文名称明确指向肺癌转录组学，并说明其研究主题是 mPTP 对铁死亡的影响。本站将其分类为肿瘤 / 肺癌，说明该数据集在应用领域上属于肿瘤学中的肺癌方向。主题标签为“Raw sequence reads”，表明该 BioProject 所关联的数据类型以原始序列读段为主。
【数据内容】
该数据集的数据内容以原始序列读段（Raw sequence reads）形式提供。原始序列读段通常指测序仪直接产出的碱基序列片段，尚未经过比对、组装或表达定量等高级处理。该数据集的主题为肺癌转录组学，并围绕 mPTP 对铁死亡的影响展开。因此，从数据类型上看，它属于转录组测序的原始读段数据，可用于后续分析转录本表达、可变剪接、融合基因等转录组层面的特征。由于源站未提供更详细的样本数量、测序平台、读长、数据量、文件格式等信息，这些具体内容无法从现有资料中确定。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“ID 1414070 - BioProject - NCBI”。BioProject 记录本身并不一定直接存储所有原始数据文件，而是提供链接以指向该项目产生的多种数据类型。该项目的原始序列读段数据应可通过 BioProject 记录关联的入口获取。关于样本采集地点、采集时间、受试者信息、伦理审批信息、测序机构等具体采集细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肺癌转录组学相关研究，尤其是关注 mPTP 对铁死亡影响的机制探索。原始序列读段可用于转录组表达分析、差异表达分析、通路富集分析、铁死亡相关基因表达评估，以及 mPTP 相关干预条件下转录组变化的比较研究。此外，该数据集也可用于方法学验证、数据再分析、整合分析，或作为肺癌与铁死亡交叉领域的公共数据资源。由于本站分类为肿瘤 / 肺癌，它也可服务于肿瘤生物学、肺癌分子机制和铁死亡调控网络等研究方向。
【使用方法】
使用者可通过 NCBI BioProject 记录编号 1414070 查找该项目，并依据记录中提供的链接获取原始序列读段数据。获取数据后，通常需要进行质量控制、去除接头和低质量碱基、比对到参考基因组或转录组、定量表达水平，并进行后续统计分析。若研究目标涉及 mPTP 对铁死亡的影响，可在分析中重点关注铁死亡相关基因集、mPTP 相关通路以及两者之间的关联。具体分析流程、软件参数和参考文件选择需根据研究设计确定。源站未提供该数据集专门的使用指南或推荐流程。
【质量与限制】
该数据集以原始序列读段形式提供，意味着数据尚未经过统一的高级处理，使用者需要自行完成质量控制和生物信息学分析。原始读段的质量受测序平台、文库制备、样本质量等多种因素影响，但源站未提供具体的质量评估指标。该数据集的主题明确为肺癌转录组学与 mPTP 对铁死亡的影响，但样本量、分组设计、测序深度、覆盖度、重复数等关键信息源站未提供。因此，在解释分析结果时，应结合原始数据质量和实验设计进行判断。该 BioProject 记录本身是数据入口，不保证所有关联数据均可公开访问，具体访问限制或许可条件需查看源站记录。
【引用与许可】
该数据集的引用方式应参考 NCBI BioProject 记录编号 1414070 及其源站页面。关于该数据集的许可协议、使用条款、是否允许再分发或商业使用等信息，源站未提供。使用者在引用或使用该数据集时，应访问 ncbi.nlm.nih.gov 上的对应 BioProject 记录，查看最新的引用要求、数据访问政策和许可说明。若源站记录中未明确许可信息，建议遵循 NCBI 通用数据使用政策，并尊重原始数据提交者的权益。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1414070
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们旨在利用肺癌细胞NCI-H1299系统性地探究mPTP（尤其是由PPIF基因编码的CypD）对铁死亡的影响。采用CRISPR基因编辑策略，构建了CypD敲除及对照的H1299细胞。细胞经RSL3处理以诱导铁死亡，DMSO作为阴性对照。每组收集三个重复样本。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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