多原发肺癌多组学诊断与空间转录组数据集

该数据集为 NCBI BioProject 收录的多原发肺癌多组学诊断与空间转录组数据集,主题标签为 Raw sequence reads,属于肿瘤/肺癌分类

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基因组分类Raw sequence reads
PRJNA1405320: Multi-omics diagnostic and spatial transcriptomics dataset of multiple primary lung cancer

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

多原发肺癌多组学诊断与空间转录组数据集

该数据集为 NCBI BioProject 收录的多原发肺癌多组学诊断与空间转录组数据集,主题标签为 Raw sequence reads,属于肿瘤/肺癌分类。其英文名称为 PRJNA1405320: Multi-omics diagnostic and spatial transcriptomics dataset of multiple primary lung cancer。源站标题为 BioProject - NCBI,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。BioProject 是围绕单一研究计划汇集生物数据的集合,这些数据来自单一组织或联盟;BioProject 记录为用户提供一个统一入口,以便查找该项目所产生的多种数据类型。该数据集聚焦多原发肺癌的多组学诊断与空间转录组研究,并以原始测序读段作为主题标签,为相关肿瘤研究提供数据资源。

【数据集背景】

多原发肺癌是一种在肺部同时或异时出现多个原发肿瘤的疾病类型,其诊断与鉴别涉及复杂的分子特征。该数据集以多原发肺癌为研究对象,整合多组学诊断与空间转录组信息,旨在为肺癌研究提供可用的数据资源。源站标题为 BioProject - NCBI,表明该数据集通过 NCBI 的 BioProject 平台发布。BioProject 作为生物数据集合,围绕单一研究计划组织数据,这些数据来自单一组织或联盟,并提供统一入口以查找项目产生的多种数据类型。该数据集属于肿瘤/肺癌分类,主题标签为 Raw sequence reads,说明其数据内容以原始测序读段为主。

【数据内容】

该数据集的主题标签为 Raw sequence reads,即原始序列读段。其英文名称中包含 Multi-omics diagnostic and spatial transcriptomics dataset of multiple primary lung cancer,表明数据集涉及多组学诊断与空间转录组两个方面的内容。多组学诊断通常涵盖多种分子层面的检测数据,空间转录组则用于在组织空间背景下分析基因表达信息。该数据集将这两类信息结合,用于多原发肺癌的研究。源站描述指出,BioProject 记录提供用户一个单一位置,以查找为该项目生成的多种数据类型。因此,该数据集可能包含与多原发肺癌相关的多种数据类型,但具体的数据文件类型、样本数量、测序平台、数据量等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,源站标题为 BioProject - NCBI。BioProject 是生物数据的集合,与单一研究计划相关,来自单一组织或联盟。该数据集通过 NCBI BioProject 平台发布,其英文名称以 PRJNA1405320 作为项目标识。关于样本采集地点、采集时间、采集机构、伦理审批信息、受试者信息等,源站未提供。该数据集属于肿瘤/肺癌分类,主题标签为 Raw sequence reads,表明其数据来源为测序产生的原始读段。源站描述仅说明 BioProject 的一般性质,未提供该数据集具体的采集流程或来源机构细节。

【适用场景】

该数据集适用于多原发肺癌相关的多组学诊断与空间转录组研究。由于主题标签为 Raw sequence reads,其数据可用于需要原始测序读段的分析流程,例如序列比对、表达定量、变异检测等。多组学诊断与空间转录组的结合,可能适用于探索多原发肺癌的分子特征、肿瘤异质性、空间表达模式等研究方向。该数据集属于肿瘤/肺癌分类,也可用于肺癌领域的比较分析或方法开发。然而,具体适用的分析类型、研究问题及使用限制,源站未提供。使用者应结合自身研究目的,参考 BioProject 记录中的链接与说明,判断数据是否满足需求。

【使用方法】

该数据集可通过 NCBI BioProject 平台访问,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。BioProject 记录为用户提供一个单一位置,以查找为该项目生成的多种数据类型。使用者可通过项目标识 PRJNA1405320 定位该数据集,并依据 BioProject 记录中的链接获取相关数据。由于主题标签为 Raw sequence reads,使用者可能需要使用常规的测序数据分析工具处理原始读段。关于具体的下载方式、数据格式、分析流程、软件推荐等,源站未提供。使用者应遵循 NCBI 平台的一般使用规范,并参考项目页面中的说明进行操作。

【质量与限制】

该数据集通过 NCBI BioProject 平台发布,BioProject 是围绕单一研究计划汇集生物数据的集合,来自单一组织或联盟。其主题标签为 Raw sequence reads,表明数据以原始测序读段为主。关于数据质量评估、测序深度、覆盖度、批次效应、样本完整性、数据验证情况等,源站未提供。该数据集属于肿瘤/肺癌分类,涉及多原发肺癌的多组学诊断与空间转录组,但具体的技术限制、数据偏差、适用范围等,源站未提供。使用者应自行评估数据质量,并结合项目页面中的信息判断其适用性。

【引用与许可】

该数据集的英文名称为 PRJNA1405320: Multi-omics diagnostic and spatial transcriptomics dataset of multiple primary lung cancer,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,源站标题为 BioProject - NCBI。关于引用方式、许可协议、使用条款、数据共享政策等,源站未提供。使用者应参考 NCBI BioProject 平台的一般引用规范与使用政策,并在使用该数据集时遵循相关要求。由于源站未提供具体的引用格式与许可信息,建议使用者直接访问项目页面获取最新说明。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1405320

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

We performed whole-exome sequencing (WES) from patients with multifocal lung cancer and10x Visium spatial transcriptomic sequencing.

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