基本信息

模态

基因组

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA1404308：肺癌模型中与上皮间质转化及癌症干细胞生成相关的miRNA图谱鉴定

该数据集为 NCBI BioProject 编号 1404308 的项目记录，英文名称为“PRJNA1404308: Identification of the miRNA Profile Associated with Epithelial Mesenchymal Transition and the Generation of Cancer Stem Cells in a Lung Cancer Model”。其主题聚焦于肺癌模型，目标是在该模型中鉴定与上皮间质转化（EMT）及癌症干细胞生成相关的 miRNA 表达图谱。数据主题标签为“Raw sequence reads”，表明项目产生的核心数据类型为原始测序读段。本站将其归类于肿瘤 / 肺癌方向，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。整体而言，该数据集适合关注肺癌分子机制、miRNA 调控网络、上皮间质转化及肿瘤干细胞生物学的研究人员参考使用。

【数据集背景】

该数据集来源于 NCBI BioProject 数据库，项目编号为 1404308。BioProject 是围绕某一项研究计划或倡议而组织起来的生物数据集合，通常由单一机构或联合体发起，旨在为用户提供一个统一入口，以便查找该项目所产生的多种类型数据。本项目的研究主题是在肺癌模型中鉴定与上皮间质转化及癌症干细胞生成相关的 miRNA 图谱。上皮间质转化与癌症干细胞生成是肿瘤进展、侵袭和转移研究中的重要生物学过程，而 miRNA 作为转录后调控因子，可能在其中发挥关键调控作用。该项目的设立正是为了从 miRNA 层面刻画这些过程在肺癌模型中的分子特征。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”，说明其数据内容以原始测序读段为主。项目围绕肺癌模型中与上皮间质转化及癌症干细胞生成相关的 miRNA 图谱鉴定展开，因此原始测序读段应来源于针对 miRNA 的高通量测序实验。除“Raw sequence reads”这一主题标签外，源站未提供更细化的数据内容描述，例如具体样本数量、测序平台、读长、数据量或分析流程等信息。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI BioProject 数据库中的一条项目记录，项目编号为 1404308。BioProject 记录通常汇集来自单一研究计划或联合体的生物数据，并提供指向该项目所产生各类数据的链接。关于本项目的具体采集地点、样本来源、实验设计、建库方法及测序机构等信息，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于肺癌分子机制研究，尤其是与上皮间质转化、癌症干细胞生成以及 miRNA 调控相关的分析场景。研究人员可利用原始测序读段开展 miRNA 表达谱分析、差异表达鉴定、靶基因预测及调控网络构建等工作。此外，该数据集也可作为肺癌模型中 miRNA 相关研究的公共数据资源，用于方法比较、结果验证或二次分析。由于本站将其归类为肿瘤 / 肺癌，该数据对肿瘤生物学、非编码 RNA 研究及肺癌转化医学方向具有潜在参考价值。

【使用方法】

该数据集以 BioProject 记录形式提供，用户可通过 NCBI BioProject 数据库访问项目编号 1404308 对应的页面，并借助该记录查找项目所关联的各类数据。由于主题标签为“Raw sequence reads”，使用者通常需要下载原始测序读段，并按照 miRNA 测序数据的常规分析流程进行质控、比对、定量和差异分析。关于具体的下载方式、数据格式、分析工具及参数设置，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来自 NCBI BioProject，属于公共数据库中的项目记录。源站描述仅说明了 BioProject 的一般性质，即围绕单一研究计划或联合体组织生物数据，并提供统一入口查找多种数据类型。关于该项目的样本质量、测序深度、数据完整性、批次效应、重复性及潜在偏差等信息，源站未提供。此外，该记录未给出具体的实验细节和分析结论，因此在使用时需结合原始数据及项目关联信息自行评估适用性。

【引用与许可】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，项目编号为 1404308。关于该数据集的引用方式、许可条款、使用限制及数据共享政策，源站未提供。使用者应遵循 NCBI 及 BioProject 数据库的相关使用规范，并在引用时参考项目页面所附的官方说明。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJNA1404308

访问原始数据

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付，我们提供全链路闭环服务，让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持？联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1404308

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肺癌是一种高度侵袭性的肿瘤，常导致转移，是全球年死亡率最高的恶性肿瘤之一。据世界卫生组织（WHO）统计，2022年该肿瘤在全球造成1，817，469例死亡。尽管癌症治疗取得了进展，转移仍是恶性肿瘤相关死亡的主要原因，约90%的患者因此死亡。虽然大量研究致力于理解肿瘤细胞侵袭的机制，但我们对驱动转移的分子信号通路仍知之甚少，这阻碍了有效靶向疗法的开发。转移需要肿瘤细胞发生改变，使其获得运动性和侵袭性。为实现这一目标，肿瘤细胞激活上皮-间质转化（EMT）程序，其中一部分细胞可进一步去分化，生成癌症干细胞（CSCs），后者在转移和对常规疗法的耐药中发挥关键作用。

有证据表明，基因调控的变化以及非编码RNA（如微小RNA（miRNA））的表达参与了EMT和CSC的形成。然而，在肺癌中参与这些过程的具体miRNA仍知之甚少。基于此，我们的研究旨在鉴定可能负责EMT和CSC生成的miRNA。为实现这一目标，我们利用dCas9技术激活转录因子Twist，在两种肺癌细胞系（A549和NCI H1975）中诱导EMT，生成具有间充质表型的细胞群体。随后将该群体培养数日以获得CSC，并使用成熟的CSC标志物CD133进行选择和分离。对第四种细胞群体（未经任何处理的上皮表型、感染CopGFP慢病毒颗粒的上皮细胞作为

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别