PRJNA1314234：与免疫检查点抑制剂治疗及免疫相关不良事件相关的人和小鼠肠道微生物组测序数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1314234

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本项目包含人类和小鼠肠道微生物组测序数据集，旨在研究微生物组在免疫相关不良事件（irAE）发生及免疫检查点抑制剂（ICI）疗效中的作用。人类数据集由接受ICI治疗的非小细胞肺癌和黑色素瘤患者粪便样本的鸟枪法宏基因组测序数据组成。样本采集于基线时，即ICI治疗开始前及irAE发生前。这些数据支持对癌症患者基线微生物组分类组成的分析，以评估其预测irAE发生的潜力及与治疗疗效的关联。小鼠数据集包含16S rRNA基因（V3-V4区）测序数据，样本来自接受粪便微生物群移植（FMT）的荷瘤小鼠粪便，供体为一名发生免疫相关性结肠炎的肺癌患者。所有小鼠，包括水处理对照组，均预先接受抗生素处理。粪便样本于FMT后四周采集，对应第二次ICI给药后的时间点。

这些数据为在癌症免疫治疗背景下，肠道微生物组对irAE发病机制的贡献提供了补充性的见解。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。