PRJNA1232732：NSCLC的TIL治疗（TCR-seq）
该数据集来自一项非小细胞肺癌（NSCLC）的肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）治疗试验，包含对连续时间点采集的外周血、肿瘤组织及TIL培养物进行TCR-seq所获得的原始测序数据
基本信息
资源简介
PRJNA1232732：NSCLC的TIL治疗（TCR-seq）
PRJNA1232732: TIL therapy for NSCLC (TCR-seq) 是一个面向肿瘤免疫治疗研究的测序数据集，聚焦非小细胞肺癌（NSCLC）的肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）治疗。该数据集收录了在一项TIL治疗试验中，对连续时间点采集的外周血、肿瘤组织以及TIL培养物进行TCR-seq所获得的原始测序数据，主题标签为原始序列读段（Raw sequence reads）。数据来源于NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），在分类上归属于肿瘤/肺癌方向。对于关注肺癌免疫微环境、T细胞受体 repertoire 动态以及TIL疗法转化研究的人员而言，该数据集提供了从原始测序层面切入的第一手材料，可用于后续的TCR克隆分析、时间序列比较以及培养物与外周血、肿瘤组织之间的对照研究。
【数据集背景】
非小细胞肺癌是肺癌的主要组织学类型之一，其治疗手段近年来不断拓展，肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）治疗作为过继性细胞免疫治疗的一种形式，在实体瘤领域受到持续关注。TIL治疗的核心在于从患者肿瘤组织中分离、扩增具有抗肿瘤活性的淋巴细胞，再回输给患者。理解治疗过程中T细胞受体的组成与变化，是评估TIL产品特征和体内免疫应答的重要环节。该数据集正是围绕这一背景产生，来自一项针对非小细胞肺癌的TIL治疗试验，以TCR-seq为技术手段，记录试验过程中的受体序列信息。
【数据内容】
数据集的内容为TCR-seq原始测序读段（Raw sequence reads），覆盖三类样本来源：连续时间点采集的外周血、肿瘤组织以及TIL培养物。这意味着数据在样本类型上具有多重对照结构——外周血反映循环中的T细胞受体组成，肿瘤组织反映局部浸润情况，TIL培养物则对应经体外扩增后用于治疗的细胞产品。三类样本结合连续时间点设计，使数据具备时间纵向比较的潜力。数据以原始序列读段形式提供，未经过汇总或加工，使用者可根据自身分析流程进行后续处理。
【采集与来源】
数据采集自一项非小细胞肺癌TIL治疗试验，样本包括时间序列上的外周血、肿瘤组织和TIL培养物。数据托管于NCBI，来源站为ncbi.nlm.nih.gov，数据集标识为PRJNA1232732。关于试验的具体机构、患者数量、采样时间间隔、测序平台与读长等信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于T细胞受体 repertoire 相关分析，例如比较外周血、肿瘤组织与TIL培养物之间的克隆组成差异，观察治疗过程中随时间变化的受体克隆动态，以及围绕TIL产品特征开展的探索性研究。由于提供的是原始测序读段，也可用于TCR-seq分析流程的建立、验证与复现。对于肺癌免疫治疗领域的生物信息学与转化研究，该数据集可作为原始数据来源之一。
【使用方法】
使用时应先获取原始测序读段，按照TCR-seq常规流程进行质量控制、序列比对与克隆型鉴定，再依据样本来源（外周血、肿瘤、TIL培养物）和时间点进行分组比较。由于涉及连续时间点样本，建议在分析设计中保留时间维度，以便考察克隆组成的纵向变化。具体的测序平台、读段长度、样本编号与元数据组织方式，源站未提供，需以源站记录为准。
【质量与限制】
该数据集为原始序列读段，未提供预处理或质控后的结果，使用者的分析结论依赖于自身流程的质量控制。关于样本量、时间点数量、测序深度、覆盖度及潜在批次效应等信息，源站未提供。此外，数据仅涉及TCR-seq，不包含其他组学层面的信息。使用时应结合源站的原始记录核实样本与实验设计细节。
【引用与许可】
数据来源于NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），数据集标识为PRJNA1232732。具体的引用方式、作者信息与许可条款，源站未提供，使用前应查阅源站相应记录并遵循其数据使用要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1232732
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包括来自非小细胞肺癌TIL治疗试验的时序外周血、肿瘤和TIL培养物的TCR-seq数据。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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