药物基因组学IND SNP临床试验——阿来替尼与单核苷酸多态性

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT05987956

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疾病：ALK阳性非小细胞肺癌（NSCLC）。常规方法组：诊断为转移性ALK阳性NSCLC的300例按序贯分配分组的NSCLC患者，目前使用ALECENSA——盐酸阿来替尼胶囊，600 mg口服，每日两次——进行化疗；将基于Oxford对药物靶点基因的精准测序，尝试寻找阿来替尼疗效与ALK SNP基因分型之间的关系，以及阿来替尼治疗安全性与CYP4503A SNP基因分型之间的关系。研究方法组：诊断为转移性ALK阳性NSCLC的300例按序贯分配分组的NSCLC患者，目前使用ALECENSA——盐酸阿来替尼胶囊，600 mg口服，每日两次——进行化疗；将基于Oxford对药物靶点基因的精准测序，尝试寻找阿来替尼疗效与ALK SNP基因分型之间的关系，以及阿来替尼治疗安全性与CYP4503A4 SNP基因分型之间的关系。

1. 检测全部600例入组的序贯分配NSCLC患者中每例患者的药物靶点全基因精准序列。
2. 对总共600例入组的序贯分配NSCLC患者，相互比较每例患者的药物靶点全基因精准序列。
3. 计算全部600例入组的序贯分配NSCLC患者中的药物靶点基因SNP。
4. 将每例患者的药物靶点基因SNP与每例患者的药物疗效进行关联分析。
5. 将每例患者的药物靶点基因SNP与每例患者的药物安全性进行关联分析。
6. 将常规方法组的SNP（300例按序贯分配分组的NSCLC患者）与研究方法组的SNP（300例按序贯分配分组的NSCLC患者）进行相互比较。
7. 确认药物靶点基因SNP与药物疗效之间的关系。
8. 确认药物靶点基因SNP与药物安全性之间的关系。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。