乳腺癌治疗反应的多模态液体活检组学生物标志物

该数据集来自clinicaltrials.gov,覆盖非小细胞肺癌、结直肠癌、胃癌、肝细胞癌和乳腺癌,采集外周血并开展PhIP-seq自身抗体谱、cfDNA甲基化、外泌体RNA及非靶向血浆代谢组学检测,研究终点包括NAC后临床反应、病理完全缓解及生存随访,可用于治疗反应与生存结局的预测建模(来源 c

Sun Yat-Sen Memorial Hospital of Sun Yat-Sen UniversitySun Yat-Sen Memorial Hospital of Sun Yat-Sen University
clinicaltrials
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基因组预测Lung Cancer Non-small CellColorectal CancerStomach CancerHepatocellular CarcinomaBreast Cancer
Multimodal Liquid-Biopsy Omics Biomarkers of Treatment Response in Breast Cancer

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

乳腺癌治疗反应的多模态液体活检组学生物标志物

该数据集来自clinicaltrials.gov,覆盖非小细胞肺癌、结直肠癌、胃癌、肝细胞癌和乳腺癌,采集外周血并开展PhIP-seq自身抗体谱、cfDNA甲基化、外泌体RNA及非靶向血浆代谢组学检测,研究终点包括NAC后临床反应、病理完全缓解及生存随访,可用于治疗反应与生存结局的预测建模(来源 clinicaltrials.gov)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):条件:非小细胞肺癌、结直肠癌、胃癌、肝细胞癌、乳腺癌。在方案规定的时间点采集外周血(20 mL)。通过PhIP-seq(噬菌体展示免疫沉淀测序)分析血清/血浆自身抗体谱;通过无亚硫酸氢盐甲基化组分析测定cfDNA甲基化;通过链特异性RNA测序分析外泌体RNA;并通过液相色谱-串联质谱进行非靶向血浆代谢组学分析。研究终点包括NAC后的临床反应和病理完全缓解,以及生存随访。该研究依照《赫尔辛基宣言》和中国研究者发起研究的相关法规开展,并已获得机构伦理委员会批准。双向性——一个回顾性泛癌队列(存档

【主题与分类】

主题标签:Lung Cancer Non-small Cell、Colorectal Cancer、Stomach Cancer、Hepatocellular Carcinoma、Breast Cancer。本站分类:肿瘤/肺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://clinicaltrials.gov/study/NCT07880106

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件:非小细胞肺癌、结直肠癌、胃癌、肝细胞癌、乳腺癌。按方案规定的时间点采集外周血(20 mL)。通过PhIP-seq(噬菌体展示免疫沉淀测序)分析血清/血浆自身抗体库;通过免亚硫酸氢盐甲基化组分析检测cfDNA甲基化;通过链特异性RNA测序分析外泌体RNA;通过液相色谱-串联质谱进行非靶向血浆代谢组学检测。研究终点包括新辅助化疗后的临床缓解和病理完全缓解,以及生存随访。本研究依照《赫尔辛基宣言》和中国研究者发起的临床研究相关规定开展,并已获得机构伦理委员会批准。双向性研究——回顾性泛癌队列(存档样本,2020年1月至2026年9月)联合前瞻性乳腺癌队列(入组时间2026年10月至2029年)

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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