人肺癌TMT标记LC-MS数据集

数据基于TMT标记的液相色谱-质谱联用技术,比较了非小细胞肺癌细胞与正常肺细胞、以及PD-L1低表达与高表达NSCLC细胞系之间的膜蛋白表达差异

omicsdi
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蛋白质分类Tmt-labeling lc-msImmune checkpointHuman lung cancerMembrane protein
Human lung cancer TMT-labeling LC-MS

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

人肺癌TMT标记LC-MS数据集

该数据集来源于omicsdi.org,属于肿瘤/肺癌分类,英文名为Human lung cancer TMT-labeling LC-MS。数据基于TMT标记的液相色谱-质谱联用技术,比较了非小细胞肺癌细胞与正常肺细胞、以及PD-L1低表达与高表达NSCLC细胞系之间的膜蛋白表达差异。研究旨在为免疫治疗发现新的潜在靶点,结果确认NSCLC细胞系中高表达的膜蛋白在正常细胞中高表达,且在PD-L1低表达细胞中高表达。该数据可用于肺癌膜蛋白标志物筛选、免疫检查点相关靶点发现及非小细胞肺癌分子机制研究(来源 omicsdi.org)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):尽管随着针对免疫检查点(PD-1、PD-L1等)的靶向药物的近期发展,癌症治疗的范式已经改变,但仍需要新的抗癌药物靶点。为了发现新的潜在免疫治疗靶点,我们使用质谱比较了非小细胞肺癌细胞与正常肺癌细胞、以及PD-L1低表达和高表达的NSCLC细胞系之间的膜蛋白表达。结果证实,作为NSCLC细胞系中表达最高的蛋白质之一的膜蛋白,在正常细胞中高表达,并在PD-L1低表达细胞中高表达。

【主题与分类】

主题标签:Tmt-labeling lc-ms、Immune checkpoint、Human lung cancer、Membrane protein。本站分类:肿瘤/肺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD044086

下载信息

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源站:https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD044086

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

尽管随着针对免疫检查点(PD-1、PD-L1等)的药物近期发展,癌症治疗的模式已发生变化,但仍需寻找抗癌药物的新靶点。为了发现免疫治疗的新潜在靶点,我们利用质谱技术比较了非小细胞肺癌细胞与正常肺癌细胞,以及PD-L1低表达和高表达的非小细胞肺癌细胞系之间的膜蛋白表达。结果证实,作为非小细胞肺癌细胞系中表达量最高的蛋白质之一的膜蛋白,在正常细胞中高表达,并且在PD-L1低表达的细胞中也呈现高表达。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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