印度尼西亚国家癌症中心肺癌患者基因组特征数据集

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3Ae1e28f9768be0486c8a3d9197cac3c7547828a85af510218498431b6254aed38

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数据说明

引言：分子生物学的进步为肺癌管理带来了优势。此外，高通量分子检测目前有助于揭示肺癌患者之间的遗传变异。我们调查了印度尼西亚国家癌症中心肺癌患者的基因组学特征。方法：一项回顾性研究纳入了627份组织活检样本，采用实时聚合酶链反应（RT-PCR）检测，以及80份循环肿瘤DNA（ctDNA）液体活检样本，采用下一代测序（NGS）检测，这些样本来自2018年1月至2022年12月期间在Dharmais癌症医院收治的肺癌患者。数据来源于医疗记录。数据经统计学分析，p<0.05视为具有显著性。结果：RT-PCR揭示的EGFR检测结果为野生型（51.5%）、单变异（38.8%）、双变异（8.3%）和三变异（1.4%），其中L85R变异占18.66%，Ex19del占18.22%，L861Q变异占11.08%。

使用NGS进行的液体活检ctDNA仅显示2…，基因组数据是来自第三方公司（与Dharmais癌症医院合作的实验室）的二次数据，而其他数据则从医院数据库的病历中提取。， ，本README文件由Arif Riswahyudi Hanafi于2024-01-13生成 ## 一般信息 1. 数据集标题：印度尼西亚国家癌症中心肺癌患者的基因组特征 2. 作者信息：主要研究者联系信息：姓名：Arif Riswahyudi Hanafi 机构：Dharmais癌症医院，国家癌症中心，印度尼西亚 电子邮件：3. 数据收集日期：2018-2022 4. 数据收集地理位置：印度尼西亚 5. 支持数据收集的资助来源：无资助 ## 数据与文件概述 1. 文件列表：A) final_data_genomic_features_lung_cancer_indonesia.xlsx B) README.md 2. 文件之间的关系，如果重要：无 3. 收集但未包含在当前数据包中的其他相关数据：无 4. 是否

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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