基因检测指导脑转移患者治疗

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT03994796

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件：CDK基因突变、脑转移性恶性肿瘤、转移性恶性实体肿瘤、NTRK家族基因突变、PI3K基因突变、ROS1基因突变、KRAS G12C突变。主要目标：I. 确定CDK抑制剂在源自肺癌、乳腺癌及其他携带与CDK抑制剂敏感性相关的可操作遗传变异的癌症的进展性脑转移患者中的活性，通过缓解率（神经肿瘤学反应评估[RANO]标准）衡量。II. 确定PI3K抑制剂在源自肺癌、乳腺癌及其他携带PI3K通路可操作遗传变异的癌症的进展性脑转移患者中的活性，通过缓解率（RANO标准）衡量。III. 确定NTRK/ROS1抑制剂在携带可操作NTRK/ROS1基因融合的肺癌来源的进展性脑转移患者中的活性，通过缓解率（RANO标准）衡量。IV.

确定一种KRAS G12C抑制剂在来源于肺癌的进展性脑转移患者以及其他携带KRAS G12C突变的癌症患者中的活性，以缓解率（RANO标准）衡量。次要目标：I. 在按治疗和原发癌类型确定的各队列中，通过实体瘤疗效评价标准（RECIST）评估全身缓解情况。II. 在按治疗和原发癌类型确定的各队列中，通过脑转移（BM）-RANO评估中枢神经系统（CNS）的临床获益率（完全缓解[CR]+部分缓解[PR]+疾病稳定[SD]）。III. 在按治疗和原发癌类型确定的各队列中，通过RECIST评估颅外疾病的临床获益率（CR+PR+SD）。IV. 在按治疗和原发癌类型确定的各队列中，通过BM-RANO评估缓解持续时间。V. 在按治疗和原发癌类型确定的各队列中，通过RECIST评估缓解持续时间。VI. 在按治疗和原发癌类型确定的各队列中，评估颅内疾病的无进展生存期

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。