香烟烟雾对H292肺癌细胞microRNA表达的影响

该数据集来自omicsdi.org,聚焦香烟烟雾对H292肺癌细胞中microRNA表达的影响。香烟烟雾与包括癌症在内的多种肺部疾病相关,miRNA失调会影响蛋白表达并带来多样的功能后果

omicsdi
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基因组分类Mass spectrometryMirnaLung cancer
Effect of cigarette smoke on microRNA expression in H292 lung cancer cells

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

香烟烟雾对H292肺癌细胞microRNA表达的影响

该数据集聚焦于香烟烟雾对H292肺癌细胞中microRNA表达的影响,来源于omicsdi.org,归类于肿瘤/肺癌方向。香烟烟雾已被认为与包括癌症在内的多种肺部疾病的发生发展相关,而miRNA的失调会影响蛋白质表达,进而带来多样的功能后果。围绕这一主题,该数据集整合了质谱分析相关的实验信息,主题标签涵盖质谱、miRNA与肺癌。通过考察细胞在香烟烟雾暴露条件下miRNA及蛋白质表达的变化,相关研究有助于识别潜在的治疗靶点与化学预防靶点,为肺癌等肺部疾病的机制探索和干预策略提供数据基础。

【数据集背景】

香烟烟雾与多种肺部疾病的发生相关,其中包括癌症。miRNA的失调已知会影响蛋白质表达,并导致多样的功能后果。因此,研究细胞在香烟烟雾暴露后miRNA和蛋白质表达的变化,可能有助于发现潜在的治疗靶点和化学预防靶点。该数据集正是围绕香烟烟雾对H292肺癌细胞中microRNA表达的影响这一主题而建立,所属分类为肿瘤/肺癌,来源站为omicsdi.org。

【数据内容】

该数据集的主题标签包括质谱、miRNA和肺癌。源站描述提到,研究采用基于SILAC的定量蛋白质组学分析,以识别H292肺癌细胞在香烟烟雾处理后差异表达的蛋白质。通过LC-MS/MS分析,共鉴定到3,959种蛋白质,其中303种蛋白质在香烟烟雾处理的H292细胞中过表达,112种蛋白质下调。数据集英文名称为“Effect of cigarette smoke on microRNA expression in H292 lung cancer cells”,表明其关注香烟烟雾对H292肺癌细胞microRNA表达的影响,同时结合了蛋白质组学层面的差异表达信息。

【采集与来源】

该数据集来源于omicsdi.org。源站描述显示,研究使用基于SILAC的定量蛋白质组学方法,对香烟烟雾处理后的H292肺癌细胞进行分析,并通过LC-MS/MS进行鉴定。除上述来源站、实验方法与细胞模型信息外,源站未提供更多关于样本采集地点、时间、伦理审批或具体操作流程的细节。

【适用场景】

该数据集适用于与肺癌及香烟烟雾暴露相关的机制研究场景,尤其是关注miRNA表达变化、蛋白质差异表达以及潜在治疗靶点和化学预防靶点识别的分析。其主题标签涵盖质谱、miRNA和肺癌,可用于支持围绕H292肺癌细胞模型的分子表达谱研究。关于更具体的适用场景,源站未提供。

【使用方法】

源站未提供具体的使用方法说明,包括数据下载方式、文件格式、分析流程或软件工具等信息。

【质量与限制】

源站描述提供了LC-MS/MS鉴定到的蛋白质数量及差异表达数量,但未提供关于数据质量评估、假发现率、重复次数、验证实验或潜在偏差的详细信息。该数据集基于H292肺癌细胞模型,源站未说明其结论是否可推广至其他细胞类型或临床样本。其他质量与限制信息源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供引用方式与许可信息。

下载信息

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD003086

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

吸烟与包括癌症在内的多种肺部疾病的发生有关。已知miRNA的失调会影响蛋白质表达,进而导致多种功能性后果。研究暴露于香烟烟雾后miRNA和蛋白质的表达,有助于识别潜在的治疗和化学预防靶点。我们采用基于SILAC的定量蛋白质组学分析,以鉴定H292肺癌细胞中因香烟烟雾暴露而差异表达的蛋白质。通过LC-MS/MS分析,共鉴定出3,959种蛋白质,其中在香烟烟雾处理的H292细胞中有303种蛋白质过表达,112种蛋白质下调。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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