跨物种与模型整合分析肺肿瘤内皮细胞异质性并鉴定血管生成候选因子

数据围绕肺肿瘤内皮细胞异质性,采用跨物种与多模型的整合分析策略,旨在刻画内皮细胞异质性并鉴定血管生成候选因子。可用于肺癌肿瘤微环境研究、内皮细胞亚群差异表达分析,以及血管生成相关候选基因的筛选与验证(来源 ebi.ac.uk)

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基因组分类Differential
E-MTAB-8031: An integrated approach to profile lung tumor endothelial cell heterogeneity across species and models and to identify angiogenic candidates

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-18

资源简介

跨物种与模型整合分析肺肿瘤内皮细胞异质性并鉴定血管生成候选因子

E-MTAB-8031 是一项围绕肺肿瘤内皮细胞异质性展开的表达谱研究数据集,采用跨物种与多模型整合的分析策略,旨在系统刻画肺肿瘤中内皮细胞的异质性特征,并在此基础上鉴定与血管生成相关的候选因子。该数据集来源于 ebi.ac.uk,在站内归入肿瘤 / 肺癌分类,主题标签为 Differential,属于 Expression Atlas 中的差异表达实验,涉及物种为 Homo sapiens。整体而言,该数据集面向肺癌肿瘤微环境中的内皮细胞群体,强调通过整合性分析手段揭示内皮细胞亚群之间的差异,并为血管生成候选基因的筛选提供数据基础,适合用于肺癌微环境研究、内皮细胞亚群差异表达分析以及血管生成相关候选基因的发现与验证等方向。

【数据集背景】

肺肿瘤的发生与进展不仅取决于肿瘤细胞本身,也与肿瘤微环境中的血管系统密切相关。内皮细胞作为构成肿瘤血管的核心细胞类型,在肿瘤内呈现出显著的异质性,不同亚群在表型、功能与分子特征上可能存在差异,并直接影响血管生成等过程。E-MTAB-8031 正是针对这一科学问题而设计,其研究策略强调跨物种与多模型的整合,目的是更全面地刻画肺肿瘤内皮细胞的异质性,并从中识别具有潜在价值的血管生成候选因子。该数据集在站内被归类为肿瘤 / 肺癌,主题标签为 Differential,说明其核心分析内容围绕差异表达展开。

【数据内容】

该数据集属于 Expression Atlas 中的差异表达实验(Differential),物种标注为 Homo sapiens。其内容聚焦于肺肿瘤内皮细胞的表达谱特征,服务于内皮细胞异质性的刻画以及血管生成候选因子的鉴定。围绕跨物种与多模型的整合分析策略,数据可用于比较不同条件下内皮细胞群体之间的表达差异,进而支持内皮细胞亚群的划分与候选基因的筛选。关于具体的样本数量、分组设计、检测平台、基因数量等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ebi.ac.uk,属于 Expression Atlas 实验记录,实验类型为差异表达(Differential),物种为 Homo sapiens。其英文标题表明该研究采用整合性方法来分析跨物种、跨模型的肺肿瘤内皮细胞异质性,并识别血管生成候选因子。除上述来源与实验类型信息外,关于样本采集地点、采集时间、伦理审批、具体实验流程等信息,源站未提供。

【适用场景】

基于其研究主题与差异表达实验属性,该数据集可应用于多个方向:一是肺癌肿瘤微环境研究,特别是围绕肿瘤血管与内皮细胞群体的分析;二是内皮细胞亚群的差异表达分析,用于揭示不同亚群之间的分子特征差异;三是血管生成相关候选基因的筛选与验证,为后续功能研究提供候选靶点线索。此外,由于研究策略涉及跨物种与多模型的整合,该数据集也适合作为整合性分析思路的参考数据资源。关于具体适用物种范围与模型类型的细节,源站未提供。

【使用方法】

该数据集可作为差异表达分析的基础数据,用于比较肺肿瘤内皮细胞在不同条件或不同亚群之间的表达差异,并据此筛选候选基因。使用时可结合研究目的进行内皮细胞亚群层面的比较分析,或将差异表达结果用于血管生成候选因子的优先级排序。关于数据下载方式、文件格式、分析流程与参数设置等具体操作信息,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于 ebi.ac.uk 的 Expression Atlas 实验记录,具备明确的实验类型与物种标注。其研究定位为跨物种与多模型的整合分析,提示在使用时需关注不同物种与模型之间的可比性问题。关于样本量、数据完整性、批次效应、归一化方法以及验证实验等质量相关信息,源站未提供,因此在实际使用前应结合源站记录进一步核实。

【引用与许可】

该数据集来源于 ebi.ac.uk,英文名称为 E-MTAB-8031: An integrated approach to profile lung tumor endothelial cell heterogeneity across species and models and to identify angiogenic candidates。关于具体的引用文献、作者信息、许可条款与使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-MTAB-8031

标准获取流程:

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Expression Atlas experiment (Differential). Species: Homo sapiens. An integrated approach to profile lung tumor endothelial cell heterogeneity across species and models and to identify angiogenic candidates

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