NLST 采集的 DICOM 转换幻灯片显微图像数据集

该数据集对应于美国国家癌症研究所影像数据共享平台(IDC)提供的一个图像和/或图像衍生数据集合。该数据集由 IDC 团队转换为 DICOM 表示并收录

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2026-10-07 更新
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医学影像分类肿瘤肺癌NLST幻灯片显微图像DICOMIDC
DICOM converted Slide Microscopy images for the NLST collection

基本信息

模态
医学影像
大小
0.00048685 GB
任务类型
分类
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

NLST 采集的 DICOM 转换幻灯片显微图像数据集

DICOM converted Slide Microscopy images for the NLST collection 是一个面向肿瘤与肺癌研究领域的公开影像数据集,对应美国国家癌症研究所影像数据共享平台(IDC)所提供的一个图像和/或图像衍生数据集合。该数据集由 IDC 团队转换为 DICOM 表示并收录,用户可通过 IDC Portal 对相应图像进行浏览与可视化,并可依据 Zenodo 记录中提供的清单文件按下载说明获取该集合。该数据集来源于美国国家肺癌筛查试验(NLST),包含其中的全切片显微(Slide Microscopy)图像,采用 Creative Commons Attribution 4.0 International 许可发布,作者包括 Clunie, David、Clifford, William、Pot, David、Wagner, Ulrike、Farahani, Keyvan、Kim, Erika 与 Fedorov, Andrey,发布机构为 Zenodo,发布时间为 2026 年。

【数据集背景】

该数据集所对应的原始图像来自美国国家肺癌筛查试验(NLST)。NLST 的开展目的是确定采用低剂量 CT 筛查是否能够降低肺癌高危人群的肺癌死亡率,该试验在美国 33 个医疗中心进行。参与者被随机分配,在 2002 年至 2004 年间接受三次年度筛查。关于原始图像及更多支持性信息的获取方式,可参见 NLST 的 wiki 页面。本数据集即是在这一试验框架下,由 IDC 团队将相关图像转换为 DICOM 表示并收录,形成可检索、可浏览的影像集合。

【数据内容】

该数据集对应一个图像和/或图像衍生数据集合,具体包含来自 NLST 的全切片显微(Slide Microscopy)图像,并已转换为 DICOM 表示。数据集英文名称为 DICOM converted Slide Microscopy images for the NLST collection,在分类上属于肿瘤 / 肺癌方向。除上述内容外,关于图像的具体数量、分辨率、染色类型、文件规模等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 doi.org,原始图像来自美国国家肺癌筛查试验(NLST)。NLST 在美国 33 个医疗中心开展,参与者于 2002 年至 2004 年间被随机分配接受三次年度筛查。该数据集由 IDC 团队转换为 DICOM 表示并收录,属于美国国家癌症研究所影像数据共享平台(IDC)提供的集合之一。关于扫描设备、染色流程、切片制备等采集细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集面向肿瘤 / 肺癌相关的研究与应用,可作为影像数据共享平台中的图像和/或图像衍生数据集合使用,支持通过 IDC Portal 进行浏览与可视化。其全切片显微图像与 NLST 肺癌筛查背景相关联,可用于与肺癌筛查相关的影像研究场景。关于具体的分析任务、模型训练用途或临床决策支持等适用方向,源站未提供。

【使用方法】

用户可通过 IDC Portal 探索和可视化该数据集对应的图像。如需下载该集合,可使用 Zenodo 记录中包含的清单文件,并按照下载说明进行操作。关于下载所需的具体工具、接口、存储要求或操作步骤细节,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集由 IDC 团队转换为 DICOM 表示并收录,发布机构为 Zenodo,采用 Creative Commons Attribution 4.0 International 许可。关于数据质量评估、标注完整性、潜在偏倚、样本代表性或使用限制等具体信息,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的作者为 Clunie, David、Clifford, William、Pot, David、Wagner, Ulrike、Farahani, Keyvan、Kim, Erika 与 Fedorov, Andrey,发布机构为 Zenodo,发布时间为 2026 年。许可方式为 Creative Commons Attribution 4.0 International。关于具体的引用格式、DOI 编号或署名要求细节,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://doi.org/10.5281/zenodo.22837346

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 486.9 KB。

数据说明

本数据集对应于美国国家癌症研究所影像数据共享平台(IDC)提供的一系列图像及/或源自图像的数据。该数据集已被IDC团队转换为DICOM格式并收录。您可以通过IDC门户探索并可视化相应的图像。利用本Zenodo记录中包含的清单文件,按照下方下载指南即可下载该集合。此集合包含了来自国家肺癌筛查试验(NLST)的幻灯片显微镜图像,该试验旨在确定低剂量CT筛查是否能降低33个美国医疗中心中肺癌高风险人群的肺癌死亡率。参与者被随机分配在2002年至2004年间接受三次年度筛查。请参阅NLST wiki页面以了解更多关于原始图像的信息,并获取此集合的任何支持性元数据。包含的文件 文件名指示了IDC数据发布中首次引入集合数据版本的标识。例如,nlst-idc_v22-aws.s5cmd对应的是在IDC数据发布v22中引入的nlst集合内容。

nlst-idc_v25-aws.s5cmd:AWS 下载清单 nlst-idc_v25-gcs.s5cmd:GCS 下载清单 nlst-idc_v25-dcf.dcf:DCF 下载清单 以 -aws.s5cmd 结尾的清单文件引用 Amazon Web Services (AWS) 存储桶中的文件;以 -gcs.s5cmd 结尾的清单文件引用 Google Cloud Storage 中的文件。实际文件完全相同,并在 AWS 和 GCP 之间镜像。下载说明 每个清单文件的头部都包含有关如何下载所含文件的说明。要使用 .s5cmd 清单下载文件:安装 idc-index:pip install --upgrade idc-index 下载此数据集中包含的清单所引用的文件:idc download manifest.s5cmd 要使用 .dcf 清单下载文件,请参阅清单头部。如有问题或需要帮助,请联系 support@canceridc.dev 或在 IDC Forum 上发帖。致谢

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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