转移性癌症受试者中表达针对KRAS突变具有反应性受体的自体基因工程T细胞联合针对这些抗原的疫苗

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT06253520

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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数据说明

疾病：转移性实体瘤、结直肠癌、乳腺癌、非小细胞肺癌、胃肠道癌、卵巢癌、泌尿生殖系统癌。
背景：

• 来自黑色素瘤或实体上皮癌患者的多数癌灶含有肿瘤浸润淋巴细胞（TIL），这些细胞能够识别由癌症表达的独特突变新抗原。
• 向转移性黑色素瘤患者回输自体 TIL 可使高达 24% 的转移性黑色素瘤患者获得完全且持久的消退。而来自实体上皮癌患者的 TIL 回输所介导的临床缓解要少得多，可能是因为这些抗肿瘤 T 细胞在实体上皮癌中的频率非常低（通常低于 0.1%）。
• 我们开发了过继性细胞转移（ACT）治疗方法，涉及分离能够识别突变癌症新抗原的 T 细胞受体（TCR）。将这些 TCR 转导入自体外周淋巴细胞，以高效表达这些 TCR。这些新抗原 TCR 基因修饰细胞能够在体外识别并摧毁自体癌症。
• 在一名化疗难治性转移性结肠癌患者中，我们鉴定出一群罕见的、靶向 KRAS G12D 热点突变的新抗原反应性 TIL，回输这些 TIL 使所有转移性疾病几乎完全消退，且该消退现已持续超过 5 年。经基因修饰以表达获自该患者的抗 KRAS G12D 受体的细胞，其回输现已被用于使一名携带 G12D 突变的患者的转移性胰腺癌消退。利用靶向筛选以及 PBL 和 TIL 的体外致敏，我们现在已鉴定出一个 TCR 文库，其中的 TCR 能够识别受多种 I 类或 II 类 MHC 限制元件限制的 KRAS G12D 或 KRAS G12V 共享突变。
• 在利用针对突变抗原的 T 细胞受体进行的小鼠实验中，我们已表明，当细胞回输与一种疫苗联合时，携带这些受体的细胞在介导针对已建立肿瘤的抗肿瘤反应方面要有效得多

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。