从慢性肝病向肝细胞癌转变过程中的脂质重塑(血液)- 第一部分

该数据集来自 metabolomicsworkbench.org,主题为从慢性肝病向肝细胞癌转变过程中的脂质重塑,样本类型为血液,属于肿瘤/肝癌方向

University of California, DavisUniversity of California, Davis
metabolomics_workbench
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其他分类GC-MS
ST001640: Remodeling Lipids in the Transition from Chronic Liver Disease to Hepatocellular Carcinoma (Blood) - part I

基本信息

模态
其他
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

从慢性肝病向肝细胞癌转变过程中的脂质重塑(血液)- 第一部分

ST001640: Remodeling Lipids in the Transition from Chronic Liver Disease to Hepatocellular Carcinoma (Blood) - part I 是一个公开的代谢组学数据集,来源于 metabolomicsworkbench.org,主题聚焦于从慢性肝病向肝细胞癌转变过程中的脂质重塑。该数据集以血液为样本类型,采用 GC-MS(气相色谱-质谱联用)技术开展代谢物检测,属于肿瘤/肝癌研究方向。从整体定位来看,它服务于肝癌发生发展机制的基础研究,尤其是关注慢性肝病向肝细胞癌演进过程中脂质代谢变化的研究者,可借助该数据集获取血液样本中与脂质重塑相关的代谢信息。该数据集由 University of California, Davis 提供,研究物种为 Homo sapiens,是代谢组学工作台收录的肿瘤代谢研究资源之一。

【数据集背景】

肝细胞癌是最常见的原发性肝癌类型,常发生于慢性肝病背景之下,例如慢性肝炎、肝硬化等病理状态。从慢性肝病向肝细胞癌的转变涉及复杂的分子事件,其中脂质代谢重编程被认为是肿瘤发生与发展的重要特征之一。该数据集正是围绕这一转变过程,以血液为样本,利用 GC-MS 技术检测代谢物,旨在刻画脂质在疾病进展过程中的重塑特征。数据集名称中的“part I”表明其属于该研究系列的第一部分,可能与其他部分共同构成完整的研究体系。该数据集所属机构为 University of California, Davis,研究物种为人类,来源站为 metabolomicsworkbench.org,主题标签为 GC-MS,本站分类归入肿瘤/肝癌方向。

【数据内容】

该数据集的核心内容是代谢组学检测数据,采用 GC-MS 技术获得。GC-MS 是一种常用于挥发性及可衍生化代谢物分析的色谱-质谱联用方法,在脂质相关代谢物检测中具有广泛应用。样本类型为血液,这意味着数据反映的是血液中的代谢物组成信息。数据集主题为“从慢性肝病向肝细胞癌转变过程中的脂质重塑”,因此其数据内容应围绕脂质及相关代谢物在疾病转变过程中的变化展开。关于具体检测的代谢物种类、样本数量、分组设计、质谱参数、原始数据格式等详细信息,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 metabolomicsworkbench.org,源站描述显示其为一项代谢组学研究,采用 GC-MS 方法,研究物种为 Homo sapiens,所属机构为 University of California, Davis。样本类型为血液,研究主题为从慢性肝病向肝细胞癌转变过程中的脂质重塑。关于样本采集的具体流程、伦理审批信息、受试者招募标准、临床信息记录方式、样本处理与储存条件等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于肿瘤代谢组学、肝癌生物标志物发现、脂质代谢重编程机制等研究方向。具体而言,研究者可将其用于探索慢性肝病向肝细胞癌转变过程中血液脂质代谢物的变化模式,也可用于与其他肝癌代谢组学数据集进行比较分析,或作为代谢通路分析的输入数据。由于采用 GC-MS 技术,该数据集尤其适合关注挥发性代谢物或可衍生化脂质相关代谢物的研究。此外,该数据集也可用于代谢组学方法学比较、数据挖掘算法验证等场景。关于该数据集是否适用于临床诊断、预后评估或药物靶点筛选等具体应用,源站未提供明确说明。

【使用方法】

该数据集可通过 metabolomicsworkbench.org 获取。使用者通常需要根据源站提供的数据下载方式获取数据文件,并依据 GC-MS 数据的特点进行预处理,例如峰识别、峰对齐、去噪、归一化等。随后可结合多元统计分析方法(如主成分分析、偏最小二乘判别分析等)或单变量统计方法进行差异代谢物筛选,并借助代谢通路数据库进行生物学解释。关于该数据集的具体文件格式、下载链接、是否提供预处理数据或原始数据、是否附带分析脚本或使用说明等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于 metabolomicsworkbench.org,所属机构为 University of California, Davis,采用 GC-MS 技术,样本为血液,研究物种为人类。关于该数据集的质量控制指标、缺失值比例、批次效应、样本量、统计功效、验证实验等信息,源站未提供。使用者应注意,GC-MS 技术对某些脂质类代谢物的覆盖范围有限,且血液样本的代谢物组成可能受到多种生理与病理因素影响。该数据集名称中标注为“part I”,提示其可能仅为完整研究的一部分,使用时需注意其与其他部分的关系。关于该数据集的具体限制与注意事项,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 metabolomicsworkbench.org,源站描述中未提供具体的引用格式、许可协议或使用条款。关于该数据集的引用要求、许可类型、是否允许商业使用、是否允许再分发等,源站未提供。使用者在获取与使用该数据集时,应遵循 metabolomicsworkbench.org 的相关规定,并建议直接访问源站查看最新的引用与许可信息。

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使用方式

数据集获取

源站:https://metabolomicsworkbench.org/data/DRCCMetadata.php?Mode=Study&StudyID=ST001640

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Metabolomics study (GC-MS). Species: Homo sapiens. Institute: University of California, Davis.

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