犬肝细胞癌细胞系95-1044与95-0112常氧和缺氧条件下的小RNA-seq
两株细胞分别代表快速增殖与缓慢增殖的犬肝细胞癌细胞系，细胞裂解物在约80%汇合度时采集用于RNA提取和文库构建。数据可用于比较常氧与缺氧条件下犬肝细胞癌小RNA表达差异，支持肿瘤缺氧相关调控研究（来源 ncbi.nlm.nih.gov）
基本信息
资源简介
犬肝细胞癌细胞系95-1044与95-0112常氧和缺氧条件下的小RNA-seq
PRJNA1464337 数据集收录的是犬肝细胞癌（hepatocellular carcinoma, HCC）细胞系的小 RNA 测序（small RNA-seq）数据，涉及 95-1044 与 95-0112 两株细胞，分别在常氧与缺氧培养条件下进行实验。两株细胞在增殖速度上具有不同特征：95-1044 代表快速增殖的犬 HCC 细胞系，95-0112 代表缓慢增殖的犬 HCC 细胞系。细胞在相应条件下培养 48 小时，于约 80% 汇合度时收集细胞裂解物，用于 RNA 提取与小 RNA-seq 文库构建。该数据集属于肿瘤/肝癌分类，主题标签为原始序列读段（Raw sequence reads），来源为 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov）。整体而言，这批数据为在体外模型中观察犬肝细胞癌在常氧与缺氧环境下小 RNA 层面的差异提供了原始测序材料。
【数据集背景】
肝细胞癌是常见的肝脏恶性肿瘤，肿瘤内部缺氧是实体瘤生长过程中普遍存在的微环境特征，缺氧可影响肿瘤细胞的基因表达调控网络。小 RNA（包括微小 RNA 等非编码小 RNA）是基因表达转录后调控的重要参与者，在肿瘤发生发展及缺氧应答中具有潜在作用。犬肝细胞癌既是兽医肿瘤学的重要研究对象，也可作为比较肿瘤学的研究模型。该数据集以两株增殖特性不同的犬 HCC 细胞系为材料，设置常氧与缺氧两种培养条件，旨在从原始小 RNA 测序读段层面支撑相关研究。数据来源为 NCBI 站点。
【数据内容】
数据集内容为小 RNA-seq 原始序列读段，即主题标签所指的 Raw sequence reads。测序材料来自两株犬肝细胞癌细胞系 95-1044 和 95-0112，二者分别对应快速增殖与缓慢增殖表型。实验条件包括常氧与缺氧两组，细胞在相应条件下培养 48 小时后，于约 80% 汇合度时采集细胞裂解物，随后进行 RNA 分离与小 RNA-seq 文库制备。数据覆盖的生物学维度为：细胞系（两株）× 培养条件（常氧/缺氧）。关于读段数量、测序平台、读长、样本数等具体技术参数，源站未提供。
【采集与来源】
样本采集自体外培养的犬肝细胞癌细胞系。常氧培养条件为 5% CO2、21% O2、37 摄氏度；缺氧培养条件为 5% CO2、2% O2、37 摄氏度。细胞在相应条件下培养 48 小时，待达到约 80% 汇合度时收集细胞裂解物，用于 RNA 提取及小 RNA-seq 文库构建。数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov，本站分类归入肿瘤/肝癌。
【适用场景】
该数据集可用于比较常氧与缺氧条件下犬肝细胞癌小 RNA 表达差异，支持肿瘤缺氧相关调控研究；结合两株细胞在增殖速度上的差异（95-1044 快速增殖、95-0112 缓慢增殖），也可用于在细胞系层面考察不同增殖特性背景下的小 RNA 测序特征。适用对象包括从事兽医肿瘤学、比较肿瘤学以及肿瘤缺氧微环境与小 RNA 调控研究的人员。
【使用方法】
使用时应以原始序列读段为起点，按小 RNA-seq 常规分析流程开展质量控制、接头处理、读段比对与定量等步骤；分析设计上可按细胞系与培养条件两个因素进行分组比较，以考察常氧与缺氧之间以及两株细胞之间的小 RNA 差异。由于源站未提供样本编号、读段规模与平台信息，具体分析参数需依据下载到的原始数据实际情况确定。源站未提供其他使用方法说明。
【质量与限制】
该数据为原始序列读段，未提供预处理或定量结果。实验仅涉及两株细胞系、两种培养条件、48 小时单一时间点，样本层面的重复设置情况源站未提供。测序深度、读长、平台、数据量及质控指标等源站未提供。结果来自体外细胞模型，向体内肿瘤或临床情境的外推需谨慎。源站未提供其他质量与限制说明。
【引用与许可】
源站未提供引用方式与许可信息。
下载信息
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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
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使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1464337
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含两种犬肝细胞癌细胞系95-1044和95-0112的小RNA-seq数据，这些细胞系分别在常氧条件（5% CO2、21% O2、37℃）或低氧条件（5% CO2、2% O2、37℃）下培养。95-1044和95-0112细胞系分别代表快速增殖和缓慢增殖的犬肝细胞癌细胞系。细胞在常氧或低氧条件下培养48小时，并在约80%融合度时收集细胞裂解液，用于RNA提取和小RNA-seq文库制备。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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