糖尿病患者伴与不伴MASH的循环外泌体microRNA图谱

数据可用于比较两类人群循环外泌体 microRNA 的差异表达特征,探索其作为 MASH 相关分子标志物的潜力,并为糖尿病相关肝病及肝癌风险研究提供转录组层面的原始测序数据支持(来源 NCBI)

sra
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基因组分类Raw sequence reads
PRJNA1293472: Circulating exosomal microRNA profiling of diabetic patients with and without Metabolic Dysfunction-Associated Steatohepatitis

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

糖尿病患者伴与不伴MASH的循环外泌体microRNA图谱

PRJNA1293472 是一个围绕糖尿病患者循环外泌体 microRNA 展开的测序项目,其全称为 Circulating exosomal microRNA profiling of diabetic patients with and without Metabolic Dysfunction-Associated Steatohepatitis。该项目关注伴与不伴代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH)的糖尿病患者,在循环外泌体 microRNA 层面可能存在的表达差异。项目记录由 NCBI 的 BioProject 数据库收录,主题标签为原始测序读段(Raw sequence reads),在本站被归入肿瘤 / 肝癌分类。整体而言,该数据集提供了可用于比较两类人群循环外泌体 microRNA 差异表达特征的原始转录组测序数据,有助于探索其作为 MASH 相关分子标志物的潜力,并为糖尿病相关肝病及肝癌风险研究提供转录组层面的数据支持。

【数据集背景】

该数据集对应的研究聚焦于糖尿病患者的循环外泌体 microRNA。研究设计比较两类人群:伴有代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH)的糖尿病患者,以及不伴 MASH 的糖尿病患者。代谢功能障碍相关脂肪性肝炎是糖尿病相关肝病中值得关注的病理状态,而循环外泌体 microRNA 作为一类可在外周血中检测的分子,被认为具有反映肝脏病理生理变化的潜力。通过对比两类人群的循环外泌体 microRNA 表达谱,该研究试图揭示与 MASH 相关的 microRNA 差异表达特征,并进一步探讨这些分子作为 MASH 相关分子标志物的可能性。同时,该研究方向也与糖尿病相关肝病及肝癌风险的评估存在关联,因此在本站被归入肿瘤 / 肝癌分类。

【数据内容】

该数据集的主题标签为 Raw sequence reads,即原始测序读段。这意味着数据集的核心内容是测序产生的原始序列数据,而非经过完整注释或统计汇总后的表达矩阵。从项目名称可知,这些原始读段来源于糖尿病患者循环外泌体 microRNA 的测序分析,样本覆盖伴 MASH 与不伴 MASH 两类人群。基于这些原始读段,后续可开展 microRNA 的定量与差异表达分析,从而比较两类人群之间循环外泌体 microRNA 的表达差异。关于具体的样本数量、测序平台、读段长度、测序深度、microRNA 数量以及差异表达结果等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,收录于 NCBI 的 BioProject 数据库,项目编号为 1293472,英文名称为 PRJNA1293472: Circulating exosomal microRNA profiling of diabetic patients with and without Metabolic Dysfunction-Associated Steatohepatitis。根据源站描述,BioProject 是围绕某一项研究计划而汇集的一组生物学数据,该计划通常来自单一机构或某一联盟;BioProject 记录为用户提供一个统一入口,以便找到该项目所产生的多种类型数据的链接。就本数据集而言,其数据主题为原始测序读段,涉及糖尿病患者循环外泌体 microRNA 的测序。关于样本采集地点、采集时间、机构名称、伦理审批信息以及具体的实验流程,源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于比较伴 MASH 与不伴 MASH 的糖尿病患者之间循环外泌体 microRNA 的差异表达特征,进而探索其作为 MASH 相关分子标志物的潜力。由于数据以原始测序读段形式提供,适合具备生物信息学分析能力的用户从原始数据出发,开展 microRNA 定量、差异表达分析以及候选标志物筛选等工作。此外,该数据集也可为糖尿病相关肝病及肝癌风险研究提供转录组层面的原始测序数据支持,例如作为相关研究中的公共数据资源,用于方法验证、结果比较或二次分析。关于该数据集是否已被用于特定发表成果,以及是否存在其他明确的推荐分析流程,源站未提供。

【使用方法】

使用该数据集时,通常需要先从 NCBI BioProject 记录入手,通过项目编号定位到该项目,并借助 BioProject 记录所提供的链接获取与之关联的原始测序读段及其他相关数据。由于主题标签为 Raw sequence reads,使用者一般需要自行完成测序读段的质量控制、比对或注释、microRNA 定量以及差异表达分析等步骤,才能得到可用于比较两类人群表达特征的结果。对于希望探索 MASH 相关分子标志物的用户,可在差异表达分析的基础上进一步筛选候选 microRNA。关于具体的分析软件、参考数据库版本、参数设置以及推荐流程,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 NCBI BioProject 收录的项目记录,主题标签为原始测序读段,说明其提供的是原始序列数据,而非经过统一处理和分析的最终结果。因此,数据质量与可用性在很大程度上取决于原始测序本身以及使用者后续的分析流程。该数据集聚焦于糖尿病患者循环外泌体 microRNA,样本分为伴 MASH 与不伴 MASH 两类,其结论的适用范围应结合研究设计加以判断。关于样本量、测序质量指标、批次效应、混杂因素控制以及数据完整性等信息,源站未提供。此外,该数据集在本站被归入肿瘤 / 肝癌分类,但其直接研究对象为糖尿病患者的循环外泌体 microRNA 与 MASH,与肝癌风险的关联属于研究背景层面的延伸,具体关联强度源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 BioProject 数据库,项目编号为 1293472,英文名称为 PRJNA1293472: Circulating exosomal microRNA profiling of diabetic patients with and without Metabolic Dysfunction-Associated Steatohepatitis。按照 BioProject 的一般定位,该记录为用户提供指向该项目所产生多种数据类型链接的统一入口。关于该数据集的具体引用方式、文献出处、数据使用许可条款以及是否存在使用限制,源站未提供。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1293472

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究旨在识别用于诊断2型糖尿病患者中MASH的非侵入性生物标志物。糖尿病患者从单纯性脂肪变性进展为MASH是一个重大的临床挑战,因为它显著增加了肝硬化和肝细胞癌的风险。当前的诊断方法具有侵入性,不适合广泛筛查。我们假设循环外泌体含有一种特定的微小RNA(miRNA)特征,能够区分伴有和不伴有MASH的糖尿病患者。为验证这一假设,我们从两组患者中分离了血清外泌体,并进行了小RNA测序,以全面分析其miRNA含量。该数据集的目标是提供一个差异表达外泌体miRNA的资源,为在这一高风险人群中开发新型、非侵入性MASH诊断工具奠定基础。

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