小鼠肝癌模型中IL-2、IL-18与抗PD-L1治疗的空间转录组学
该数据集为BioProject记录，来源于NCBI，标题为小鼠肝癌模型中IL-2、IL-18与抗PD-L1治疗的空间转录组学
基本信息
资源简介
小鼠肝癌模型中IL-2、IL-18与抗PD-L1治疗的空间转录组学
PRJDB39708 是一个来源于 NCBI BioProject 数据库的小鼠肝癌空间转录组学数据集，其完整英文名称为“Spatial transcriptomics of IL-2 IL-18 and anti-PD-L1 therapy in a mouse liver cancer model”。该数据集围绕小鼠肝癌模型展开，研究内容涉及 IL-2、IL-18 以及抗 PD-L1 治疗条件下的空间转录组学分析。从源站标题“Mus musculus (ID 1449813) - BioProject - NCBI”可知，该记录对应的物种为小鼠（Mus musculus），并以 BioProject 形式组织。BioProject 是 NCBI 提供的一种项目级数据组织方式，用于汇集与某一项研究计划相关的多种类型生物学数据，便于用户从一个入口获取该计划下产生的各类数据链接。该数据集在本站被归类为肿瘤 / 肝癌方向，主题标签为 Targeted Locus (Loci)，整体属于肿瘤免疫治疗与空间转录组交叉领域的数据资源。
【数据集背景】
该数据集来源于 NCBI 的 BioProject 数据库，属于一个以小鼠肝癌模型为研究对象的空间转录组学项目。其研究背景涉及 IL-2、IL-18 与抗 PD-L1 治疗，这三者均与肿瘤免疫治疗密切相关。IL-2 和 IL-18 是免疫相关细胞因子，抗 PD-L1 则属于免疫检查点抑制剂，将这三者与空间转录组学结合，意味着该项目试图在空间维度上观察小鼠肝癌组织在免疫治疗干预下的基因表达变化。BioProject 作为项目级记录，本身并不等同于单一实验数据文件，而是为该项目所产生的多种数据类型提供统一的索引与链接入口。源站描述指出，BioProject 记录来自单一组织或联盟，围绕单一研究计划汇集生物学数据，并为用户提供查找该项目下不同数据类型链接的统一位置。因此，该数据集在背景上兼具肿瘤免疫治疗研究与空间转录组技术应用的双重属性。
【数据内容】
该数据集的核心内容为空间转录组学数据，研究对象为小鼠肝癌模型，实验条件涉及 IL-2、IL-18 和抗 PD-L1 治疗。主题标签为 Targeted Locus (Loci)，表明其数据可能涉及特定基因座或靶向位点的分析。作为 BioProject 记录，其数据内容并非单一文件，而是该项目下产生的多种数据类型集合。源站描述强调，BioProject 记录提供用户一个单一位置，以查找为该计划生成的不同数据类型链接。因此，该数据集的内容组织方式是以项目为单位，链接到空间转录组学相关的数据资源。关于具体的样本数量、测序深度、基因表达矩阵、空间坐标信息等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，即美国国家生物技术信息中心（NCBI）。源站标题显示其对应物种为 Mus musculus，编号为 ID 1449813。数据集英文名称中明确提及“mouse liver cancer model”，说明其采集对象为小鼠肝癌模型。实验处理包括 IL-2、IL-18 与 anti-PD-L1 治疗。该记录以 BioProject 形式发布，BioProject 是 NCBI 提供的项目级数据组织框架，用于汇集来自单一组织或联盟、围绕单一研究计划的生物学数据。关于具体的采集时间、采集地点、实验操作流程、样本处理细节、测序平台等信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肿瘤免疫治疗与空间转录组学相关的研究场景。具体而言，可用于研究小鼠肝癌模型中 IL-2、IL-18 与抗 PD-L1 治疗条件下基因表达的空间分布特征。空间转录组学能够保留组织空间位置信息，因此该数据集可能适用于分析肿瘤微环境中不同区域（如肿瘤核心、浸润边缘、邻近正常组织）的转录组差异。此外，由于涉及免疫治疗组合，该数据集也可用于探索免疫治疗响应相关的空间分子标志物。主题标签 Targeted Locus (Loci) 提示其可能适用于靶向基因座分析。作为 BioProject 记录，该数据集还可作为入口，帮助用户查找该项目下产生的其他类型数据。关于具体的分析工具、统计方法或验证实验，源站未提供。
【使用方法】
该数据集以 BioProject 记录形式提供，用户可通过 NCBI 的 BioProject 数据库访问。源站描述指出，BioProject 记录为用户提供单一位置，以查找为该计划生成的不同数据类型链接。因此，使用方法上，用户应先通过该 BioProject 记录获取项目概览，再根据其提供的链接跳转至具体的空间转录组学数据文件或相关资源。由于该数据集涉及小鼠肝癌模型及 IL-2、IL-18、抗 PD-L1 治疗条件，用户在使用时需关注样本分组与实验条件信息。关于具体的数据下载格式、分析流程、软件工具、参数设置等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于 NCBI BioProject，属于公共数据库记录，其数据组织遵循 BioProject 的框架。源站描述表明 BioProject 是围绕单一研究计划汇集生物学数据的集合，因此其质量依赖于原始项目提交的数据。该数据集的主题标签为 Targeted Locus (Loci)，分类为肿瘤 / 肝癌，物种为小鼠。关于数据的具体质量指标，如测序质量、覆盖度、重复性、批次效应等，源站未提供。此外，该数据集为小鼠模型数据，其结论向人类肝癌的转化需谨慎对待。关于样本量、数据完整性、缺失情况等限制信息，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“Mus musculus (ID 1449813) - BioProject - NCBI”。数据集英文名称为“PRJDB39708: Spatial transcriptomics of IL-2 IL-18 and anti-PD-L1 therapy in a mouse liver cancer model”。关于具体的引用格式、许可协议、使用条款、数据共享政策等信息，源站未提供。用户在使用该数据集时，应参考 NCBI BioProject 数据库的相关规定以及原始项目提交者的要求。关于是否允许商业使用、是否需要署名、是否允许再分发等许可细节，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJDB39708
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本项目研究联合白细胞介素-2、白细胞介素-18及抗PD-L1抗体治疗在Mdr2基因敲除肝细胞癌小鼠模型中的免疫学影响。利用10x Genomics Xenium生成的单细胞空间转录组图谱，描绘了肿瘤与肝脏微环境，并揭示了治疗驱动的细胞毒性Ccl5高表达CD8 T细胞招募，伴随显著的肿瘤消退。该数据集将支持未来关于实体瘤中联合细胞因子与检查点阻断免疫疗法的研究。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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